5'-Amino-2',5'-dideoxy-uridine | 35959-38-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 2 '，5'-二脱氧核苷
• 英文名称: 5'-Amino-2',5'-dideoxy-uridine
• 英文别名: 5'-amino-2',5'-dideoxyuridine；2'-deoxy-5'-aminouridine；5'-Amino-2',5'-dideoxyuridin；Uridine, 5'-amino-2',5'-dideoxy-；1-[(2R,4S,5R)-5-(aminomethyl)-4-hydroxyoxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 35959-38-7
• 化学式: C₉H₁₃N₃O₄
• 分子量: 227.22
• InChiKey: ABYZQSMQSHNEMQ-SHYZEUOFSA-N

物化性质

• 密度：
  1.466±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.9
• 重原子数：
  16
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  105
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  5

制备方法与用途

5'-氨基-2',5'-二脱氧尿苷是一种嘌呤核苷类似物，它具有广泛的抗肿瘤活性，主要针对惰性淋巴系统恶性肿瘤。其抗癌作用机制包括抑制DNA合成和诱导细胞凋亡等过程。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-Amino-2',5'-dideoxy-uridine 以 吡啶 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 2.5h， 生成 1-[(2R,4S,5R)-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-[(diphenoxyphosphorylamino)methyl]oxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
  参考文献：
  名称：

  脱氧尿苷三磷酸核苷酸水解酶是潜在的抗寄生虫药物靶标。

  摘要：

  本文介绍了一项结构活性研究，旨在从寄生虫原生动物中鉴定出新型的小分子脱氧尿苷酶5'-三磷酸核苷酸水解酶（dUTPase）抑制剂。描述了dUMP的各种类似物的成功合成，其中在3'-和5'-位引入取代基，以及在5'-位杂原子的变化。对化合物进行了针对重组恶性疟原虫和利什曼原虫主要酶和人类酶的测定，以提供选择性的量度。还针对体外完整的寄生虫恶性疟原虫和多杀利什曼原虫对化合物进行了体外测试。已鉴定出许多恶性疟原虫dUTPase的有效和选择性抑制剂，这些抑制剂表现出类似药物的特性并代表了未来发展的良好线索。最好的抑制剂包括化合物5'-三苯甲基氨基-2'，5'-二脱氧尿苷（2j）（Ki = 0.2 microM）和5'-O-三苯基甲硅烷基-2'，3'-二氢氢化-2'，3'-二脱氧尿苷（5h）（Ki = 1.3 microM），与人类酶相比，选择性大于200倍。确定了对抗疟原虫活性重要的结构特征。在体外

  DOI：

  10.1021/jm050111e
• 作为产物：
  描述：

  2-脱氧尿苷 在 palladium on activated charcoal 吡啶 、 叠氮化锂 、 氢气 作用下， 以 乙醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 7.0h， 生成 5'-Amino-2',5'-dideoxy-uridine
  参考文献：
  名称：

  2'-脱氧尿苷和5-氟-2'-脱氧尿苷衍生物的合成及其在抗体靶向研究中的评估。

  摘要：

  2'-脱氧尿苷和抗癌剂5-氟-2'-脱氧尿苷（FdUR）的衍生物通过人血清白蛋白载体（HSA）与鼠类抗骨肉瘤单克隆抗体791T / 36间接连接。从2'-脱氧尿苷1a和1b开始，从关键中间体5'-氨基核苷4合成了含有5'-琥珀酰胺酸7和5'-马来酰胺酸8间隔区的新核苷，从核呋喃呋喃糖醛酸10合成了核呋喃酰胺基苯甲酸13。这些核苷通过其间隔子功能与HSA连接。对于这些衍生物-HSA缀合物，获得了25-40的高摩尔取代率（MSR：药物的摩尔/ HSA的摩尔）。所有衍生物对抗原阳性成骨肉瘤791T和抗原阴性膀胱癌T24细胞系的细胞毒性均低于母体药物。任何针对791T细胞的衍生物均未达到IC50。然后将氟脱氧尿苷-HSA缀合物通过稳定的硫醚键进一步连接至小鼠单克隆抗体791T / 36。最佳的氟化5'-琥珀酸免疫偶联物对791T和T24细胞的IC50为1 microM，略好于氟脱氧尿苷。未缀合的衍

  DOI：

  10.1021/jm00063a007
• 作为试剂：
  描述：

  5'-azido-2',5'-dideoxyuridine 在 palladium-carbon 水 、 5'-Amino-2',5'-dideoxy-uridine 、 ammonium hydroxide 、 ethanol-ether 作用下， 以 乙醇 为溶剂， 反应 2.5h， 以to provide the desired product, (127 mg, 56%)的产率得到5'-Amino-2',5'-dideoxy-uridine
  参考文献：
  名称：

  Anti herpes simplex viral compounds and their synthesis

  摘要：

  化合物5'-氨基-2'，5'-二脱氧-5-碘尿苷；5'-氨基-2'，5'-二脱氧-5-溴尿苷；以及其药学上可接受的酸盐被发现是疱疹病毒的有效抑制剂。

  公开号：

  US04000260A1

文献信息

• Modified 5′-Trityl Nucleosides as Inhibitors of<i>Plasmodium falciparum</i>dUTPase
  作者：Gian Filippo Ruda、Corinne Nguyen、Przemysław Ziemkowski、Krzysztof Felczak、Ganasan Kasinathan、Alexander Musso-Buendia、Christian Sund、Xiao Xiong Zhou、Marcel Kaiser、Luis M. Ruiz-Pérez、Reto Brun、Tadeusz Kulikowski、Nils Gunnar Johansson、Dolores González-Pacanowska、Ian H. Gilbert

  DOI：10.1002/cmdc.201000445

  日期：2011.2.7

  2′‐Deoxyuridine triphosphate nucleotidohydrolase (dUTPase) is a potential drug target for the treatment of malaria. We previously reported the discovery of 5′‐tritylated analogues of deoxyuridine as selective inhibitors of this Plasmodium falciparum enzyme. Herein we report further structure–activity studies; in particular, variations of the 5′‐trityl group, the introduction of various substituents

  2'-脱氧尿苷三磷酸核苷酸水解酶（dUTPase）是治疗疟疾的潜在药物靶标。我们之前曾报道过发现脱氧尿苷的5'-三苯甲基化类似物可作为恶性疟原虫的选择性抑制剂酶。在这里，我们报告了进一步的结构活动研究；特别是5'-三苯甲基的变体，在脱氧尿苷的3'-位置引入了各种取代基以及修饰了碱基。测试了针对酶和寄生虫的化合物。5'-三苯甲基和3'-取代基的变异具有良好的耐受性，并产生了活性化合物。然而，由于尿嘧啶环的修饰导致酶抑制作用的丧失和抗血浆作用的显着降低，因此对尿嘧啶碱基的活性有明确的要求。
• [EN] TARGETED PROTEIN DEGRADATION<br/>[FR] DÉGRADATION CIBLÉE DE PROTÉINES
  申请人：C4 THERAPEUTICS INC

  公开号：WO2020132561A1

  公开（公告）日：2020-06-25

  This invention provides pharmaceutical protein degraders and E3 ubiquitin ligase binders for therapeutic applications as described further herein.

  这项发明提供了用于治疗应用的药用蛋白质降解剂和E3泛素连接酶结合物。
• The muraminomicin biosynthetic gene cluster and enzymatic formation of the 2-deoxyaminoribosyl appendage
  作者：Xiuling Chi、Satoshi Baba、Nidhi Tibrewal、Masanori Funabashi、Koichi Nonaka、Steven G. Van Lanen

  DOI：10.1039/c2md20245j

  日期：——

  The biosynthetic genes for muraminomicin F were uncovered, and the enzymatic synthesis of the unusual aminoribosyl appendage was delineated.

  生物合成muraminomicin F的基因已被发现，并且这种不寻常的氨基核糖附属物的酶合成已被描绘。
• Design, Synthesis, and Evaluation of 5′-Diphenyl Nucleoside Analogues as Inhibitors of the Plasmodium falciparum dUTPase
  作者：Shahienaz E. Hampton、Beatriz Baragaña、Alessandro Schipani、Cristina Bosch-Navarrete、J. Alexander Musso-Buendía、Eliseo Recio、Marcel Kaiser、Jean L. Whittingham、Shirley M. Roberts、Mikhail Shevtsov、James A. Brannigan、Pia Kahnberg、Reto Brun、Keith S. Wilson、Dolores González-Pacanowska、Nils Gunnar Johansson、Ian H. Gilbert

  DOI：10.1002/cmdc.201100255

  日期：2011.10.4

  Deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase (dUTPase) is a potential drug target for malaria. We previously reported some 5'-tritylated deoxyuridine analogues (both cyclic and acyclic) as selective inhibitors of the Plasmodium falciparum dUTPase. Modelling studies indicated that it might be possible to replace the trityl group with a diphenyl moiety, as two of the phenyl groups are buried, whereas

  脱氧尿苷5'-三磷酸核苷酸水解酶（dUTPase）是疟疾的潜在药物靶标。我们先前报道了一些5'-三苯甲基化的脱氧尿苷类似物（环状和无环的）作为恶性疟原虫dUTPase的选择性抑制剂。模型研究表明，由于两个苯基被掩埋，而第三个苯基暴露于溶剂，则可能有可能用二苯基部分取代三苯甲基。本文中，我们报告了一些亲脂性和分子量均低于三苯甲基铅化合物的二苯类似物的合成和评估。共晶体结构表明，二苯基抑制剂以类似的方式与相应的三苯甲基衍生物结合，其中两个苯基部分占据了预测的掩埋苯基结合位点。
• [EN] MIBG ANALOGS AND USES THEREOF<br/>[FR] ANALOGUES DE MIBG ET LEURS UTILISATIONS
  申请人：UNIV NEBRASKA

  公开号：WO2017053834A1

  公开（公告）日：2017-03-30

  Compounds and compositions for targeting cells expressing norepinephrine transporter, and methods of making and using the same. The compounds comprise MIBG analogs conjugated to active agents for treatment and/or diagnosis of various conditions, including neuroblastoma.

  用于靶向表达去甲肾上腺素转运蛋白的细胞的化合物和组合物，以及制备和使用这些化合物的方法。这些化合物包括与活性药物结合的MIBG类似物，用于治疗和/或诊断各种疾病，包括神经母细胞瘤。