5-p-quinonyl-2'-deoxyuridine | 87414-25-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 5-p-quinonyl-2'-deoxyuridine
• 英文别名: 5-p-benzoquinonyl-2'-deoxyuridine；2'-Deoxyuridin-5-yl-1,4-benzoquinone；5-(3,6-dioxocyclohexa-1,4-dien-1-yl)-1-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 87414-25-3
• 化学式: C₁₅H₁₄N₂O₇
• 分子量: 334.285
• InChiKey: MDGPYHVFELBDEI-YNEHKIRRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.8
• 重原子数：
  24
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  133
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-p-quinonyl-2'-deoxyuridine 在 sodium tetrahydroborate 作用下， 以 水 为溶剂， 生成 5-(2,5-Dihydroxy-phenyl)-1-((2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-hydroxymethyl-tetrahydro-furan-2-yl)-1H-pyrimidine-2,4-dione
  参考文献：
  名称：

  5-对苯醌基2'-脱氧尿苷5'-磷酸：可能的基于机理的胸苷酸合成酶抑制剂。

  摘要：

  设计为胸苷酸合成酶的自杀抑制剂的标题化合物（1）可以通过相应的二甲氧基苯基衍生物的氧化银（II）氧化脱甲基来制备。化合物1显示胸苷酸合成酶（耐甲氨蝶呤的干酪乳杆菌）的时间依赖性失活和饱和动力学，该失活对底物保护有反应。在试图去除抑制剂的长时间透析中，失活是不可逆的。失活的速率常数为0.065 s-1；解离常数（Ki）估计为2 microM。将这种失活的动力学与模型硫醇试剂对胸苷酸合成酶活性位点没有亲和力引起的失活进行了比较。

  DOI：

  10.1021/jm00361a016
• 作为产物：
  描述：

  5-(2,5-dimethoxyphenyl)-2'-deoxyuridine 在 silver(II) oxide 、 硝酸 作用下， 以 1,4-二氧六环 为溶剂， 反应 0.17h， 以60%的产率得到5-p-quinonyl-2'-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  5-对苯醌基2'-脱氧尿苷5'-磷酸：可能的基于机理的胸苷酸合成酶抑制剂。

  摘要：

  设计为胸苷酸合成酶的自杀抑制剂的标题化合物（1）可以通过相应的二甲氧基苯基衍生物的氧化银（II）氧化脱甲基来制备。化合物1显示胸苷酸合成酶（耐甲氨蝶呤的干酪乳杆菌）的时间依赖性失活和饱和动力学，该失活对底物保护有反应。在试图去除抑制剂的长时间透析中，失活是不可逆的。失活的速率常数为0.065 s-1；解离常数（Ki）估计为2 microM。将这种失活的动力学与模型硫醇试剂对胸苷酸合成酶活性位点没有亲和力引起的失活进行了比较。

  DOI：

  10.1021/jm00361a016

文献信息

• Thiol addition to quinones: model reactions for the inactivation of thymidylate synthase by 5-p-benzoquinonyl-2'-deoxyuridine 5'-phosphate
  作者：Madhavi K. Vadnere、Linda Maggiora、Mathias P. Mertes

  DOI：10.1021/jm00159a025

  日期：1986.9

  The reaction of methyl mercaptoacetate (5) with phenyl-p-benzoquinone (6) or 5-p-benzoquinonyl-3',5'-di-O-acetyl-2'-deoxyuridine (10) resulted in the formation of the three possible adducts to the quinone rings of 6 and 10; an additional product in the reaction with 10 was the unsubstituted hydroquinone (14). Both reactions were found to be solvent dependent; in buffered aqueous acetonitrile the meta

  巯基乙酸甲酯（5）与苯基-对-苯醌（6）或5-对苯醌基-3'，5'-二-O-乙酰基-2'-脱氧尿苷（10）的反应导致形成三醌环6和10的可能加合物; 与10反应的另一产物是未取代的对苯二酚（14）。发现两个反应都是溶剂依赖性的。在缓冲的乙腈水溶液中，以2：1的比例形成10的间位和对位加合物。在乙酸乙酯中，以2：3的比例分离邻位加合物和10的还原产物。5与10在乙腈中反应的二级速率常数为0.53 M-1 s-1；加入水可加速反应。尽管不能排除最初提出的基于机制的酶失活，模型反应的结果支持了另一种机制，即将活性位点硫醇加到醌环上。如果是这样，则标题化合物将被分类为亲和标记，而不是基于机理的抑制剂。
• 5-p-Benzoquinonyl-2'-deoxyuridine 5'-phosphate: a possible mechanism-based inhibitor of thymidylate synthetase
  作者：Linda Maggiora、Charles T. C. Chang、Mohamed E. Hasson、Christopher F. Bigge、Mathias P. Mertes

  DOI：10.1021/jm00361a016

  日期：1983.7

  The title compound (1), designed as a suicide inhibitor of thymidylate synthetase, can be prepared by silver(II) oxide oxidative demethylation of the corresponding dimethoxyphenyl derivative. Compound 1 shows time-dependent inactivation of thymidylate synthetase (methotrexate-resistant Lactobacillus casei) and saturation kinetics, and the inactivation is responsive to substrate protection. The inactivation

  设计为胸苷酸合成酶的自杀抑制剂的标题化合物（1）可以通过相应的二甲氧基苯基衍生物的氧化银（II）氧化脱甲基来制备。化合物1显示胸苷酸合成酶（耐甲氨蝶呤的干酪乳杆菌）的时间依赖性失活和饱和动力学，该失活对底物保护有反应。在试图去除抑制剂的长时间透析中，失活是不可逆的。失活的速率常数为0.065 s-1；解离常数（Ki）估计为2 microM。将这种失活的动力学与模型硫醇试剂对胸苷酸合成酶活性位点没有亲和力引起的失活进行了比较。