scaffold. The length and character of the backbone as well as the identity of the intercalators were varied, resulting in mono- or divalent recognition of the double helix with varying affinity. Our lead compound proved to be a moderately sequence-selective bis-intercalator with an unwinding angle of 27 degrees and a binding constant of about 8 microM. 9-aminoacridine rings were preferred over acridine
我们已经在DNA识别的背景下利用了多价的概念,使用新颖的
化学方法来合成具有异常序列选择性的新型bis-intercalator。先前已经观察到双插入,但是用于这种分子的从头构建的设计原理是未知的。我们的化合物具有两个从刚性,基于聚降
冰片烷的支架中突出的芳族基团。骨架的长度和特征以及嵌入剂的身份各不相同,从而导致双螺旋的单价或二价识别具有不同的亲和力。我们的先导化合物被证明是中等序列选择性的双嵌入剂,展开角度为27度,结合常数约为8 microM。9-
氨基ac啶环比over啶羧酰胺或
萘二甲
酰亚胺更可取,刚性的[3]-聚降
冰片烷支架优于[5]-聚降
冰片烷。连接环与支架的连接子的柔性,尽管影响较小,但会影响DNA结合的强度和特性。