(R)-2-((2-chlorophenyl)(2-(piperidin-1-yl)ethoxy)methyl)-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridine-7-carboxylic acid

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吡咯并吡啶类
• 英文名称: (R)-2-((2-chlorophenyl)(2-(piperidin-1-yl)ethoxy)methyl)-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridine-7-carboxylic acid
• 英文别名: 2-{(R)-(2-chlorophenyl)[2-(piperidin-1-yl)ethoxy]methyl}-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridine-7-carboxylic acid；2-[(R)-(2-chlorophenyl)-(2-piperidin-1-ylethoxy)methyl]-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridine-7-carboxylic acid
• 化学式: C₂₂H₂₄ClN₃O₃
• 分子量: 413.904
• InChiKey: AWPYWZMMJZGPOX-OAQYLSRUSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.2
• 重原子数：
  29
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  78.4
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2-((1-(2-chlorophenyl)prop-2-yn-1-yl)oxy)tetrahydro-2H-pyran 在 copper(l) iodide 、 C₃₇H₅₆ClPPd 、 potassium carbonate 、 对甲苯磺酸 作用下， 以 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 21.0h， 生成 (S)-2-((2-chlorophenyl)(2-(piperidin-1-yl)ethoxy)methyl)-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridine-7-carboxylic acid 、 (R)-2-((2-chlorophenyl)(2-(piperidin-1-yl)ethoxy)methyl)-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridine-7-carboxylic acid
  参考文献：
  名称：

  深入了解抑制剂对映体对组蛋白赖氨酸脱甲基酶 5A 的作用

  摘要：

  手性药物的异构体在生物活性方面表现出显着差异。我们研究了 12 种化合物对 KDM5A 的结合和抑制活性。其中有两对对映异构体代表两种不同的抑制剂化学型，即 ( R )- 和 ( S )-2-((2-氯苯基)(2-(哌啶-1-基)乙氧基)甲基)-1 H -吡咯并[3,2- b ]吡啶-7-甲酸（化合物N51和N52 ）和( R ) -和( S ) -N- (1-(3-异丙基-1H-吡唑-5-羰基)吡咯烷-3-基)环丙烷甲酰胺（化合物N54和N55 ）。在体外， N51 / N52对的S对映体( N52 )和N54 / N55对的R对映体( N54 )表现出约4至5倍的结合亲和力。对于细胞可渗透的N54 / N55对， R-亚型对KDM5A的更有效的酶抑制转化为生长抑制活性的差异。我们确定了与所有 12 种抑制剂复合的 KDM5A 催化结构域的结构，这揭示了导致结合亲和力差异的相互作用（或缺

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.8b00261

文献信息

• Insights into the Action of Inhibitor Enantiomers against Histone Lysine Demethylase 5A
  作者：John R. Horton、Xu Liu、Lizhen Wu、Kai Zhang、John Shanks、Xing Zhang、Ganesha Rai、Bryan T. Mott、Daniel J. Jansen、Stephen C. Kales、Mark J. Henderson、Katherine Pohida、Yuhong Fang、Xin Hu、Ajit Jadhav、David J. Maloney、Matthew D. Hall、Anton Simeonov、Haian Fu、Paula M. Vertino、Qin Yan、Xiaodong Cheng

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.8b00261

  日期：2018.4.12

  Isomers of chiral drugs can exhibit marked differences in biological activities. We studied the binding and inhibitory activities of 12 compounds against KDM5A. Among them are two pairs of enantiomers representing two distinct inhibitor chemotypes, namely, (R)- and (S)-2-((2-chlorophenyl)(2-(piperidin-1-yl)ethoxy)methyl)-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridine-7-carboxylic acid (compounds N51 and N52) and (R)- and

  手性药物的异构体在生物活性方面表现出显着差异。我们研究了 12 种化合物对 KDM5A 的结合和抑制活性。其中有两对对映异构体代表两种不同的抑制剂化学型，即 ( R )- 和 ( S )-2-((2-氯苯基)(2-(哌啶-1-基)乙氧基)甲基)-1 H -吡咯并[3,2- b ]吡啶-7-甲酸（化合物N51和N52 ）和( R ) -和( S ) -N- (1-(3-异丙基-1H-吡唑-5-羰基)吡咯烷-3-基)环丙烷甲酰胺（化合物N54和N55 ）。在体外， N51 / N52对的S对映体( N52 )和N54 / N55对的R对映体( N54 )表现出约4至5倍的结合亲和力。对于细胞可渗透的N54 / N55对， R-亚型对KDM5A的更有效的酶抑制转化为生长抑制活性的差异。我们确定了与所有 12 种抑制剂复合的 KDM5A 催化结构域的结构，这揭示了导致结合亲和力差异的相互作用（或缺