5'-[[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl]prop-2-enylsulfonio]-5'-deoxyadenosine

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 5'-脱氧核糖核苷
• 英文名称: 5'-[[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl]prop-2-enylsulfonio]-5'-deoxyadenosine
• 英文别名: 5’-[[(R/S)(3S)-3-amino-3-carboxypropyl]prop-2-enylsulfonio]-5’-deoxyadenosine；5'-[(RS)[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl]prop-2-enylsulfonio]-5'-deoxyadenosine；S-adenosyl-allyl-L-homocysteine；AdoPropen；allyl-SAM；Allyl((S)-3-amino-3-carboxypropyl)(((2S,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl)methyl)sulfonium；[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl]-[[(2S,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl]-prop-2-enylsulfanium
• 化学式: C₁₇H₂₅N₆O₅S
• 分子量: 425.489
• InChiKey: GFGYWGPRDTVIHL-FLSALXOJSA-O

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.8
• 重原子数：
  29
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.53
• 拓扑面积：
  184
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-[[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl]prop-2-enylsulfonio]-5'-deoxyadenosine 、 m⁷GpppA 在 recombinant Giardia lamblia trimethylguanosinesynthase var1 作用下， 以 aq. buffer 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 P¹-adenosine(5')-P³-[N²-prop-2-enyl-7-methylguanosine(5')] triphosphate
  参考文献：
  名称：

  化学酶法的RNA帽的特定位点的修改。

  摘要：

  上限和上限：可采用两步法来特异地修饰真核mRNA的5'-cap。首先，三甲基鸟苷合酶变体识别m 7 G帽结构，并使用基于S腺苷L L蛋氨酸的共底物引入生物正交基团。然后，通过硫醇-烯或CuAAC点击化学进一步修饰酶引入的报告基团（参见方案）。

  DOI：

  10.1002/anie.201302874
• 作为产物：
  描述：

  腺苷 在 甲酸 、 sodium methylate 、 silver perchlorate 、 对甲苯磺酸 、 溶剂黄146 、 三苯基膦 、 偶氮二甲酸二乙酯 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 为溶剂， 反应 15.5h， 生成 5'-[[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl]prop-2-enylsulfonio]-5'-deoxyadenosine
  参考文献：
  名称：

  蛋白精氨酸烯丙基化和随后的荧光团靶向

  摘要：

  蛋白质烯丙基化和荧光团靶向：酵母核糖核糖核蛋白Npl3的精氨酸残基通过Hmt1催化的烯丙基-SAM作为烯丙基供体的烯丙基化反应得到了广泛修饰。在紫外线照射下，用四唑化合物进一步处理了烯丙基化的蛋白质，从而形成了附有蛋白质的荧光产物。

  DOI：

  10.1002/cbic.201300176

文献信息

• Biocatalytic Friedel-Crafts Alkylation Using Non-natural Cofactors
  作者：Harald Stecher、Martin Tengg、Bernhard J. Ueberbacher、Peter Remler、Helmut Schwab、Herfried Griengl、Mandana Gruber-Khadjawi

  DOI：10.1002/anie.200905095

  日期：2009.12.7

  A novel biocatalytic protocol for CC bond formation is described and is an equivalent to Friedel–Crafts alkylation. S‐Adenosyl‐L‐methionine (SAM), the major methyl donor for biological methylation catalyzed by methyltransferases (Mtases), can perform alkylations (see scheme). These enzymes can accept non‐natural cofactors and transfer functionalities other than methyl onto aromatic substrates.

  描述了一种新颖的CC键形成的生物催化方案，该方案等同于Friedel-Crafts烷基化。S-腺苷-L-蛋氨酸（SAM）是甲基转移酶（Mtases）催化的生物甲基化的主要甲基供体，可以进行烷基化（请参阅方案）。这些酶可以接受非天然的辅助因子，并且可以将甲基以外的其他功能转移到芳香族底物上。
• Structure and Biocatalytic Scope of Coclaurine <i>N</i> ‐Methyltransferase
  作者：Matthew R. Bennett、Mark L. Thompson、Sarah A. Shepherd、Mark S. Dunstan、Abigail J. Herbert、Duncan R. M. Smith、Victoria A. Cronin、Binuraj R. K. Menon、Colin Levy、Jason Micklefield

  DOI：10.1002/anie.201805060

  日期：2018.8.13

  plant secondary metabolites, which have been exploited to develop analgesics, antibiotics, antitumor agents, and other therapeutic agents. Biosynthesis of BIAs proceeds via a common pathway from tyrosine to (S)‐reticulene at which point the pathway diverges. Coclaurine N‐methyltransferase (CNMT) is a key enzyme in the pathway to (S)‐reticulene, installing the N‐methyl substituent that is essential for

  苄基异喹啉生物碱 (BIA) 是结构多样的植物次生代谢物家族，已被用来开发镇痛药、抗生素、抗肿瘤剂和其他治疗剂。BIA 的生物合成通过从酪氨酸到 ( S )-网状荠烯的共同途径进行，此时该途径出现分歧。椰壳碱N-甲基转移酶 (CNMT) 是 ( S )-网状荠烯途径中的关键酶，安装N-甲基取代基，这对于许多 BIA 的生物活性至关重要。在本文中，我们描述了 CNMT 的第一个晶体结构，它与诱变研究一起定义了酶活性位点的结构。还利用一系列天然和合成底物以及辅因子类似物探索了 CNMT 的特异性。这项研究的知识可用于生成生产 BIA 或合成衍生物所需的改进 CNMT 变体。
• Engineering Methyllysine Writers and Readers for Allele-Specific Regulation of Protein–Protein Interactions
  作者：Simran Arora、W. Seth Horne、Kabirul Islam

  DOI：10.1021/jacs.9b05725

  日期：2019.10.2

  Protein-protein interactions mediated by methyllysine are ubiquitous in biological systems. Specific perturbation of such interactions has remained a challenging endeavor. Herein, we describe an allele-specific strategy towards an engineered protein-protein interface orthogonal to the hu-man proteome. We develop a methyltransferase (writer) variant that installs aryllysine moiety on histones that can

  由甲基赖氨酸介导的蛋白质-蛋白质相互作用在生物系统中无处不在。这种相互作用的特定扰动仍然是一项具有挑战性的工作。在此，我们描述了一种针对与人类蛋白质组正交的工程蛋白质-蛋白质界面的等位基因特异性策略。我们开发了一种甲基转移酶 (writer) 变体，它在组蛋白上安装了芳基赖氨酸部分，只能被工程染色质域 (read-er) 识别。我们建立工程界面的生化完整性，为正交性提供结构证据，并验证其在识别转录调节因子方面的适用性。我们的方法为甲基赖氨酸相互作用组的特定操作提供了前所未有的策略。
• Directed Evolution of a Halide Methyltransferase Enables Biocatalytic Synthesis of Diverse SAM Analogs
  作者：Qingyun Tang、Christoph W. Grathwol、Aşkın S. Aslan‐Üzel、Shuke Wu、Andreas Link、Ioannis V. Pavlidis、Christoffel P. S. Badenhorst、Uwe T. Bornscheuer

  DOI：10.1002/anie.202013871

  日期：2021.1.18

  Biocatalytic alkylations are important reactions to obtain chemo‐, regio‐ and stereoselectively alkylated compounds. This can be achieved using S‐adenosyl‐l‐methionine (SAM)‐dependent methyltransferases and SAM analogs. It was recently shown that a halide methyltransferase (HMT) from Chloracidobacterium thermophilum can synthesize SAM from SAH and methyl iodide. We developed an iodide‐based assay for

  生物催化烷基化是获得化学、区域和立体选择性烷基化化合物的重要反应。这可以通过使用 S-腺苷-L-甲硫氨酸 (SAM) 依赖性甲基转移酶和 SAM 类似物来实现。最近的研究表明，来自嗜热氯酸杆菌的卤化物甲基转移酶（HMT）可以从 SAH 和碘甲烷合成 SAM。我们开发了一种基于碘化物的测定方法，用于拟南芥HMT 的定向进化，并用它来鉴定 V140T 变体，该变体也可以接受乙基、丙基和烯丙基碘，产生相应的 SAM 类似物（90、50 和15 毫克 SAH 的 70% 转化率）。 V140T AtHMT 与O-甲基转移酶（IeOMT 或 COMT）进行一锅级联，以实现木犀草素的区域选择性乙基化和 3,4-二羟基苯甲醛的烯丙基化。虽然 3,4-二羟基苯甲醛的丙基化级联反应转化率较低，但丙基-SAH 中间体可以通过 NMR 光谱得到证实。
• Preparation, Assay, and Application of Chlorinase SalL for the Chemoenzymatic Synthesis of S-Adenosyl-l-Methionine and Analogs
  作者：Tony D. Davis、Sylvia Kunakom、Michael D. Burkart、Alessandra S. Eustaquio

  DOI：10.1016/bs.mie.2018.02.012

  日期：——

  However, SAM and its analogs are expensive and unstable, degrading rapidly under physiological conditions. Thus, the availability of methods to prepare SAM in situ is desirable. In addition, synthetic methods to generate SAM analogs suffer from low yields and poor diastereoselectivity. The chlorinase SalL from the marine bacterium Salinispora tropica catalyzes the reversible, nucleophilic attack of chloride

  S-腺苷-1-甲硫氨酸（SAM）在生物学上很普遍，在各种酶促反应中是第二最常见的辅助因子。SAM的主要作用之一是核酸，蛋白质和代谢物的甲基化。甲基化通常赋予DNA和蛋白质以调节控制力，并导致专门代谢产物（如开发为药物的那些代谢产物）的活性增加。在甲基转移酶催化的生物分子修饰中使用SAM类似物的兴趣已经增加。然而，SAM及其类似物昂贵且不稳定，在生理条件下会迅速降解。因此，期望有用于原位制备SAM的方法的可用性。另外，产生SAM类似物的合成方法产率低且非对映选择性差。来自海洋细菌Salinispora tropica的氯化酶SalL催化氯化物对SAM的C5'核糖基碳的可逆亲核攻击，导致5'-氯-5'-脱氧腺苷（ClDA）的形成，伴随着1-甲硫氨酸的置换。已经证明，SalL催化的反应的体外平衡有利于SAM的合成。在本章中，我们描述了用SalL制备SalL的方法，以及用ClDA和1-蛋氨酸同源物