cyclic-HDP-ribose

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 咪唑并嘧啶类
• 英文名称: cyclic-HDP-ribose
• 英文别名: (2R,3R,4S,5R,13R,14S,15R,16R)-3,4,8,14,15-pentahydroxy-8,10,10-trioxido-7,9,11,25,26-pentaoxa-1,19,21-triaza-17-azonia-8,10-diphosphoniapentacyclo[15.6.1.12,5.113,16.018,23]hexacosa-17(24),18(23),19-trien-22-one
• 化学式: C₁₅H₂₀N₄O₁₄P₂
• 分子量: 542.29
• InChiKey: KZFFJWPOKMETIG-KEOHHSTQSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -6
• 重原子数：
  35
• 可旋转键数：
  0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.67
• 拓扑面积：
  267
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  15

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  3-carbamoyl-1-[O⁵-(1,2-dihydroxy-2-inosin-5'-yloxy-diphosphoryl)-β-D-ribofuranosyl]-pyridinium betaine 在 phosphate buffer 、 Aplysia cyclase 作用下， 反应 5.0h， 以81%的产率得到cyclic-HDP-ribose
  参考文献：
  名称：

  吡啶核苷酸类似物的新型酶环化：环-GDP-核糖和环-HDP-核糖

  摘要：

  The cyclase of Aplysia californica catalyzed an alternative mode of cyclization of nicotinamide guanine dinucleotide (NGD) and nicotinamide hypoxanthine dinucleotide (NHD) to form cyclic-GDP-ribose (cGDPR) and cyclic-HDP-ribose (cHDPR) respectively. In these cyclic nucleotides, the newly formed glycosyl bonds are attached onto the N-7 nitrogen of the purine rings instead of the N-1 nitrogen as in cyclic ADP-ribose (cADPR).

  DOI：

  10.1016/0040-4039(95)02004-9

文献信息

• Novel enzymatic cyclizations of pyridine nucleotide analogs: Cyclic-GDP-ribose and cyclic-HDP-ribose
  作者：Fang-Jie Zhang、Charles J. Sih

  DOI：10.1016/0040-4039(95)02004-9

  日期：1995.12

  The cyclase of Aplysia californica catalyzed an alternative mode of cyclization of nicotinamide guanine dinucleotide (NGD) and nicotinamide hypoxanthine dinucleotide (NHD) to form cyclic-GDP-ribose (cGDPR) and cyclic-HDP-ribose (cHDPR) respectively. In these cyclic nucleotides, the newly formed glycosyl bonds are attached onto the N-7 nitrogen of the purine rings instead of the N-1 nitrogen as in cyclic ADP-ribose (cADPR).