N3-4'-trifluoromethyldiphenylmethylvancomycin

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机聚合物 - 多肽
• 英文名称: N3-4'-trifluoromethyldiphenylmethylvancomycin
• 英文别名: (1S,2R,18R,19R,22S,25R,28R,40S)-22-(2-amino-2-oxoethyl)-5,15-dichloro-48-[(2S,3R,4S,5S,6R)-4,5-dihydroxy-3-[(2S,4S,5S,6S)-5-hydroxy-4,6-dimethyl-4-[[4-[4-(trifluoromethyl)phenyl]phenyl]methylamino]oxan-2-yl]oxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-2,18,32,35,37-pentahydroxy-19-[[(2R)-4-methyl-2-(methylamino)pentanoyl]amino]-20,23,26,42,44-pentaoxo-7,13-dioxa-21,24,27,41,43-pentazaoctacyclo[26.14.2.23,6.214,17.18,12.129,33.010,25.034,39]pentaconta-3,5,8(48),9,11,14,16,29(45),30,32,34(39),35,37,46,49-pentadecaene-40-carboxylic acid
• 化学式: C₈₀H₈₄Cl₂F₃N₉O₂₄
• 分子量: 1683.49
• InChiKey: ZRMNFIKCYMGFOL-CZABSZFKSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.9
• 重原子数：
  118
• 可旋转键数：
  17
• 环数：
  14.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  517
• 氢给体数：
  19
• 氢受体数：
  29

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N3-4'-trifluoromethyldiphenylmethylvancomycin 在 三氟乙酸 作用下， 反应 2.0h， 生成 万古霉素糖苷配基
  参考文献：
  名称：

  一种新型糖肽抗生素的杂质鉴定和放大

  摘要：

  已经开发出多种新型糖肽抗生素来对抗耐药细菌菌株。此前，我们报道了一系列用脂质尾部和额外糖修饰的万古霉素衍生物。SM-V-61 作为具有三氟甲基-联苯片段和半乳糖的万古霉素类似物之一，显示出增强的抗菌活性、改善的 PK/PD、更好的水溶性和安全性。然而，其合成程序不完善、收率较低、杂质复杂等问题阻碍了候选药物SM-V-61的进一步开发。在此，我们报告了对 SM-V-61 杂质分析和工艺优化的进一步研究。我们首先合成并鉴定了多种杂质，建立了SM-V-61质量分析和控制的分析方法。基于定义的分析方法，

  DOI：

  10.1021/acs.oprd.1c00064
• 作为产物：
  描述：

  在 甲醇 、 sodium cyanoborohydride 、 三氟乙酸 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 N3-4'-trifluoromethyldiphenylmethylvancomycin
  参考文献：
  名称：

  靶向抗焦磷酸的万古霉素衍生物的设计与合成

  摘要：

  作为难治性革兰氏阳性细菌感染的最后手段，随着耐万古霉素细菌的出现，特别是耐万古霉素肠球菌的出现，万古霉素正在失去疗效（VRE）。为了克服这种威胁，我们通过金属螯合，亲脂性和半乳糖附着策略，分别或联合修饰，合理设计和合成了39种新的万古霉素衍生物，以进行广泛的结构-活性关系（SAR）分析。在一个拟议的机制中，二聚烯丙基胺在间苯二酚的第七个氨基酸位置或C-末端上的缀合使万古霉素骨架具有对脂质II中焦磷酸部分的结合能力，同时保持了对细菌细胞壁肽聚糖二肽末端的固有结合亲和力前体。对体外抗菌活性进行了评估，最佳化合物显示对VRE的活性比万古霉素高16到1024倍。化合物11 b（3'，5'-双（二吡啶甲酰基氨基甲基）酪氨酸[1,2,3]三唑基甲氧基乙氧基乙基氨基甲基-N-癸基万古霉素）通过结合两个外围修饰而产生的协同作用，对VRE具有特别强的活性。

  DOI：

  10.1002/cmdc.201800252

文献信息

• Extra Sugar on Vancomycin: New Analogues for Combating Multidrug-Resistant <i>Staphylococcus aureus</i> and Vancomycin-Resistant <i>Enterococci</i>
  作者：Dongliang Guan、Feifei Chen、Lun Xiong、Feng Tang、Faridoon、Yunguang Qiu、Naixia Zhang、Likun Gong、Jian Li、Lefu Lan、Wei Huang

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.7b01345

  日期：2018.1.11

  Lipophilic substitution on vancomycin is an effective strategy for the development of novel vancomycin analogues against drug-resistant bacteria by enhancing bacterial cell wall interactions. However, hydrophobic structures usually lead to long elimination half-life and accumulative toxicity; therefore, hydrophilic fragments were also introduced to the lipo-vancomycin to regulate their pharmacokin

  万古霉素上的亲脂取代是通过增强细菌细胞壁相互作用来开发新型抗药物细菌万古霉素类似物的有效策略。然而，疏水结构通常导致长消除半衰期和累积毒性。因此，亲水片段也被引入到万古霉素脂中以调节其药代动力学/药效学性质。在这里，我们通过广泛的结构-活性关系分析，合成了一系列新的万古霉素类似物，这些类似物在第七个氨基酸的苯环上带有多个糖基，在万古胺上具有亲脂性取代基。最佳类似物显示对甲氧西林敏感的金黄色葡萄球菌具有较高的128-1024倍活性，对万古霉素有抗药性与万古霉素相比，金黄色葡萄球菌（VISA）和耐万古霉素的肠球菌（VRE）。体内药代动力学研究表明，额外糖基序的有效调节可缩短半衰期，并解决了万古霉素累积毒性的问题。通过引入额外的糖，这项工作为脂-万古霉素衍生物的设计提出了一种有效的策略，从而产生了更好的类抗生素特性，从而增强了功效，优化了药代动力学并降低了毒性。
• Design and Synthesis of Pyrophosphate-Targeting Vancomycin Derivatives for Combating Vancomycin-Resistant <i>Enterococci</i>
  作者：Dongliang Guan、Feifei Chen、Faridoon、Junjie Liu、Jian Li、Lefu Lan、Wei Huang

  DOI：10.1002/cmdc.201800252

  日期：2018.8.20

  As the last resort for intractable Gram‐positive bacterial infections, vancomycin is losing efficacy with the emergence of vancomycin‐resistant bacteria, especially vancomycin‐resistant Enterococci (VRE). To combat this threat, we rationally designed and synthesized 39 novel vancomycin derivatives by respective or combined modifications using metal‐chelating, lipophilic, and galactose‐attachment strategies

  作为难治性革兰氏阳性细菌感染的最后手段，随着耐万古霉素细菌的出现，特别是耐万古霉素肠球菌的出现，万古霉素正在失去疗效（VRE）。为了克服这种威胁，我们通过金属螯合，亲脂性和半乳糖附着策略，分别或联合修饰，合理设计和合成了39种新的万古霉素衍生物，以进行广泛的结构-活性关系（SAR）分析。在一个拟议的机制中，二聚烯丙基胺在间苯二酚的第七个氨基酸位置或C-末端上的缀合使万古霉素骨架具有对脂质II中焦磷酸部分的结合能力，同时保持了对细菌细胞壁肽聚糖二肽末端的固有结合亲和力前体。对体外抗菌活性进行了评估，最佳化合物显示对VRE的活性比万古霉素高16到1024倍。化合物11 b（3'，5'-双（二吡啶甲酰基氨基甲基）酪氨酸[1,2,3]三唑基甲氧基乙氧基乙基氨基甲基-N-癸基万古霉素）通过结合两个外围修饰而产生的协同作用，对VRE具有特别强的活性。
• EP3450450
  申请人：——

  公开号：——

  公开（公告）日：——
• Impurity Identification and Scale-Up of a Novel Glycopeptide Antibiotic
  作者：Shang Jiao、Dongliang Guan、Lili Xu、Bo Liu、Weiwei Shi、Jian Li、Feng Tang、Wei Huang

  DOI：10.1021/acs.oprd.1c00064

  日期：2021.11.19

  variety of novel glycopeptide antibiotics have been developed to combat the drug-resistant bacterial strains. Previously, we reported a series of vancomycin derivatives that are modified with lipid tails and extra sugars. SM-V-61, as one of the vancomycin analogues with a trifluoromethyl-biphenyl fragment and galactose, showed enhanced antibacterial activity, improved PK/PD, better water solubility

  已经开发出多种新型糖肽抗生素来对抗耐药细菌菌株。此前，我们报道了一系列用脂质尾部和额外糖修饰的万古霉素衍生物。SM-V-61 作为具有三氟甲基-联苯片段和半乳糖的万古霉素类似物之一，显示出增强的抗菌活性、改善的 PK/PD、更好的水溶性和安全性。然而，其合成程序不完善、收率较低、杂质复杂等问题阻碍了候选药物SM-V-61的进一步开发。在此，我们报告了对 SM-V-61 杂质分析和工艺优化的进一步研究。我们首先合成并鉴定了多种杂质，建立了SM-V-61质量分析和控制的分析方法。基于定义的分析方法，