3'-azido-3'-deoxythymidine 5'-β,γ-difluoromethylene-γ-P-methyltriphosphate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 3'-azido-3'-deoxythymidine 5'-β,γ-difluoromethylene-γ-P-methyltriphosphate
• 英文别名: [(2S,3S,5R)-3-azido-5-(5-methyl-2,4-dioxo-pyrimidin-1-yl)tetrahydrofuran-2-yl]methoxy-[difluoro-[hydroxy-[hydroxy(methyl)phosphoryl]oxy-phosphoryl]methyl]phosphinic acid；[(2S,3S,5R)-3-azido-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-[difluoro-[hydroxy-[hydroxy(methyl)phosphoryl]oxyphosphoryl]methyl]phosphinic acid
• 化学式: C₁₂H₁₈F₂N₅O₁₁P₃
• 分子量: 539.22
• InChiKey: IIBUPCCUEQEFOK-DJLDLDEBSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.1
• 重原子数：
  33
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.67
• 拓扑面积：
  203
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  15

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  AZT 5'-tosylate 在 1H-1,2,4-三唑 、 三乙胺 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 27.75h， 生成 3'-azido-3'-deoxythymidine 5'-β,γ-difluoromethylene-γ-P-methyltriphosphate
  参考文献：
  名称：

  AZT 5'-三磷酸酯模拟物的合成及其对HIV-1逆转录酶的抑制作用。

  摘要：

  为寻找活性核苷5'-三磷酸模拟物，我们合成了一系列AZT三磷酸模拟物（AZT P3Ms），并评估了它们对HIV-1逆转录酶的抑制作用以及它们在胎牛血清和CEM细胞提取物中的稳定性。AZT与2-氯-4H-1,3,2-苯并二氧杂磷酰基-4-酮反应，然后用焦磷酸盐类似物处理亚磷酸酯中间体2，得到环状三磷酸酯中间体4b-4f，将其进行硼化并随后进行硼化水解得到AZT5'-α-硼烷-β，γ-桥修饰的三磷酸酯6b-6f，产率中等至良好。环状中间体4d与碘反应，然后用一系列亲核试剂处理，得到AZT5'-β，γ-二氟亚甲基-γ-取代的三磷酸酯（7b-7i）。几种不同类型的AZT P3M，包括α-P-硫代（或二硫代）和β，γ-二氟亚甲基（13,14），α，β-二氟亚甲基和γ-P-甲基（或苯基）（15,16），以及还合成了α-硼烷-β，γ-二氟亚甲基和γ-O-甲基/苯基（11,12）。使用荧光测定法和以聚（A

  DOI：

  10.1021/jm040116w