coenzyme F430

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 四吡咯及其衍生物
• 英文名称: coenzyme F430
• 化学式: C₄₂H₅₁N₆NiO₁₃
• 分子量: 906.589
• InChiKey: CSIZETLYBMWYQA-SXMZNAGASA-M

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  None
• 重原子数：
  None
• 可旋转键数：
  None
• 环数：
  None
• sp3杂化的碳原子比例：
  None
• 拓扑面积：
  None
• 氢给体数：
  None
• 氢受体数：
  None

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  coenzyme F430 以 甲醇 、 aq. phosphate buffer 为溶剂， 生成 13-epi-coenzyme F430 、 12,13-diepi-coenzyme F430
  参考文献：
  名称：

  基于辅酶 F430 作为功能特异性生物标志物对地下海洋沉积物中产甲烷种群和潜力的洞察

  摘要：

  辅酶 F430 是甲基辅酶 M 还原酶 (MCR) 的辅基，是甲烷代谢的关键化合物。我们将辅酶 F430 作为产甲烷的功能特异性生物标志物应用于收集在硫酸盐还原带下方的地下海洋沉积物，以研究产甲烷菌的分布和活性。此外，我们检查了辅酶 F430 的差向异构化动力学，这是细胞死亡后降解过程的第一阶段，在不同温度（4、15、34、60°C）和 pH 值（5、7、9）下条件，涵盖了本研究中使用的钻孔沉积物的原位条件。降解实验表明，差向异构化动力学符合热力学规律，辅酶 F430 的半衰期从 304 天减少到 11 小时现场温度。这表明在沉积物中检测到的原生 F430 来源于活产甲烷菌，因为 F430 的非生物降解速度远快于沉降速度，不会被化石化。根据辅酶 F430 分析和降解实验，在下北半岛海底沉积物中检测到的天然形式的 F430 来自活产甲烷菌细胞，该细胞在细胞中不会被降解，但在细胞死亡后很快消失

  DOI：

  10.1021/jacsau.1c00307

文献信息

• Derivatives of Coenzyme F430 with a Covalently Attachedα-Axial Ligand. Part II
  作者：Carsten Bauer、Bernhard Jaun

  DOI：10.1002/hlca.200390348

  日期：2003.12

  Coenzyme F430 pentamethyl ester 2 was partially hydrolyzed to a mixture of the five F430 tetramethyl esters 7–11, which were separated by HPLC and identified by means of a full NMR characterization. The tetramethyl ester with a free COOH group at the side chain at C(3) of F430 was coupled to the N-terminus of the peptidic spacerligand construct 12 selected and studied as described before. The UV/VIS

  辅酶F430五甲基酯2是部分水解的五个F430四甲基酯的混合物7 - 11，这是由HPLC分离和鉴定通过全NMR表征的装置。F430的C（3）侧链具有游离COOH基团的四甲酯与如前所述选择和研究的肽间隔基配体构建体12的N末端偶联。在CH的UV / VIS和NMR谱2氯2 / 3,3,3-三氟乙醇6:1表明，新的衍生物，将Ni II（3 3 -dehydroxy-8 3，12 2，13 3，18 2 -四ø甲基F430-3 3 -基）-L-脯氨酰基-L-脯氨酰- ñ π -甲基-L-组氨酸甲酯（13），是分子内，五配位的，顺磁性络合物。在相同的溶剂系统中，父3 3，8 3，12 2，13 3，18 2 -penta- ö甲基F430（2）的四个坐标，甚至在等摩尔1个的存在反磁性ħ咪唑。轴向配位的13个组氨酸残基的质子化形成了反磁性的四配位基离形式，这使我们能够通过NMR建立13的组成。
• Insights into the Methanogenic Population and Potential in Subsurface Marine Sediments Based on Coenzyme F430 as a Function-Specific Biomarker
  作者：Masanori Kaneko、Yoshinori Takano、Masashi Kamo、Kazuya Morimoto、Takuro Nunoura、Naohiko Ohkouchi

  DOI：10.1021/jacsau.1c00307

  日期：2021.10.25

  methanogens. In addition, we examined the kinetics of the epimerization of coenzyme F430, which is the first stage of the degradation process after cell death, at various temperatures (4, 15, 34, 60 °C) and pH (5, 7, 9) conditions, which cover in situ conditions of drilled sediments used in this study. The degradation experiments revealed that the kinetics of the epimerization well follow the thermodynamic laws

  辅酶 F430 是甲基辅酶 M 还原酶 (MCR) 的辅基，是甲烷代谢的关键化合物。我们将辅酶 F430 作为产甲烷的功能特异性生物标志物应用于收集在硫酸盐还原带下方的地下海洋沉积物，以研究产甲烷菌的分布和活性。此外，我们检查了辅酶 F430 的差向异构化动力学，这是细胞死亡后降解过程的第一阶段，在不同温度（4、15、34、60°C）和 pH 值（5、7、9）下条件，涵盖了本研究中使用的钻孔沉积物的原位条件。降解实验表明，差向异构化动力学符合热力学规律，辅酶 F430 的半衰期从 304 天减少到 11 小时现场温度。这表明在沉积物中检测到的原生 F430 来源于活产甲烷菌，因为 F430 的非生物降解速度远快于沉降速度，不会被化石化。根据辅酶 F430 分析和降解实验，在下北半岛海底沉积物中检测到的天然形式的 F430 来自活产甲烷菌细胞，该细胞在细胞中不会被降解，但在细胞死亡后很快消失