PCM-0102338

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 有机碳酸及其衍生物
• 英文名称: PCM-0102338
• 英文别名: 1-(2-Chloroacetyl)imidazolidin-2-one
• 化学式: C₅H₇ClN₂O₂
• mdl: MFCD06363490
• 分子量: 162.576
• InChiKey: GZQIJKIKCCPGKH-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.3
• 重原子数：
  10
• 可旋转键数：
  1
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  49.4
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  2

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  PCM-0102338 、 1-benzyl-5-(tert-butyl)-1H-benzo[d]imidazole-2-thiol 在 potassium carbonate 作用下， 以38%的产率得到1-(2-((1-benzyl-5-(tert-butyl)-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)thio)acetyl)imidazolidin-2-one
  参考文献：
  名称：

  发现 2-硫代苯并咪唑作为 SARS-CoV-2 主要蛋白酶的非共价抑制剂

  摘要：

  针对 SARS-CoV-2 的抗病毒药物的发现是结束 COVID-19 大流行和应对未来爆发的重要一步。在这种情况下，主要蛋白酶 (M pro ) 代表了开发冠状病毒抗病毒药物的理想靶点，它在不同菌株中保守并且对生存至关重要。在这项工作中，我们使用计算机工具创建并验证了一个对接协议，该协议能够预测 M pro催化位点的结合剂。以下基于结构的虚拟筛选 ZINC 库的一个子集（超过 430 万个独特结构），导致鉴定出具有 2-硫代苯并咪唑支架的命中化合物。使用针对重组 M pro的基于 FRET 的蛋白水解测定法确认抑制活性. 在对接姿势分析的指导下，通过合成小型类似物库获得结构-活动关系。我们的努力导致了一种微摩尔 M pro抑制剂 (IC 50 = 14.9 µM)的鉴定 ，其原始支架具有理想的药物样特性（使用 QikProp 函数预测），代表了开发新型冠状病毒的有希望的领先地位抗病毒药。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2022.128867
• 作为产物：
  描述：

  2-咪唑烷酮 、 氯乙酰氯 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 2.5h， 以48%的产率得到PCM-0102338
  参考文献：
  名称：

  发现 2-硫代苯并咪唑作为 SARS-CoV-2 主要蛋白酶的非共价抑制剂

  摘要：

  针对 SARS-CoV-2 的抗病毒药物的发现是结束 COVID-19 大流行和应对未来爆发的重要一步。在这种情况下，主要蛋白酶 (M pro ) 代表了开发冠状病毒抗病毒药物的理想靶点，它在不同菌株中保守并且对生存至关重要。在这项工作中，我们使用计算机工具创建并验证了一个对接协议，该协议能够预测 M pro催化位点的结合剂。以下基于结构的虚拟筛选 ZINC 库的一个子集（超过 430 万个独特结构），导致鉴定出具有 2-硫代苯并咪唑支架的命中化合物。使用针对重组 M pro的基于 FRET 的蛋白水解测定法确认抑制活性. 在对接姿势分析的指导下，通过合成小型类似物库获得结构-活动关系。我们的努力导致了一种微摩尔 M pro抑制剂 (IC 50 = 14.9 µM)的鉴定 ，其原始支架具有理想的药物样特性（使用 QikProp 函数预测），代表了开发新型冠状病毒的有希望的领先地位抗病毒药。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2022.128867

文献信息

• US3937612A
  申请人：——

  公开号：US3937612A

  公开（公告）日：1976-02-10