N,N-bis({N-[{4-(N-hydroxycarbamoyl)-3-hydroxyphenyl)-methyl]carbamoyl}methyl)-N'-aminopentane-1,5-diamide

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: N,N-bis({N-[{4-(N-hydroxycarbamoyl)-3-hydroxyphenyl)-methyl]carbamoyl}methyl)-N'-aminopentane-1,5-diamide
• 英文别名: 4-[[[2-[(5-hydrazinyl-5-oxopentanoyl)-[2-[[3-hydroxy-4-(hydroxycarbamoyl)phenyl]methylamino]-2-oxoethyl]amino]acetyl]amino]methyl]-N,2-dihydroxybenzamide
• 化学式: C₂₅H₃₁N₇O₁₀
• 分子量: 589.562
• InChiKey: VPOLGIKJFAEFPL-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.8
• 重原子数：
  42
• 可旋转键数：
  14
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.28
• 拓扑面积：
  273
• 氢给体数：
  10
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  N,N-bis-({N-[(4-(N-hydroxycarbamoyl)-3-hydroxyphenyl)methyl]-carbamoyl}methyl)-N'-[(tert-butoxy)carbonylamino]pentane-1,5-diamide 、 三氟乙酸 在 1,1-二氯乙烷 、 三氟乙酸 、 甲醇 、 乙酸乙酯 作用下， 以 1,1-二氯乙烷 为溶剂， 反应 4.0h， 以Obtained 1.41 grams (68% yield) of product as a white powder的产率得到N,N-bis({N-[{4-(N-hydroxycarbamoyl)-3-hydroxyphenyl)-methyl]carbamoyl}methyl)-N'-aminopentane-1,5-diamide
  参考文献：
  名称：

  Bifunctional boronic compound complexing reagents and complexes

  摘要：

  适用于修饰生物活性物种的试剂，以便将双功能硼化合物络合基团纳入其中，以后与具有悬垂苯硼酸基团的不同（或相同）生物活性物种结合，其通用式为1，其中基团R是适于试剂与生物活性物种反应的亲电性或亲核性基团，其中基团R.sub.2选自H和OH基团之一，基团R.sub.3选自具有带电取代基的烷基和亚甲基之一。基团Z是选自（CH.sub.2）.sub.n和CH.sub.2 O(CH.sub.2 CH.sub.2 O).sub.n.sbsb.2的间隔基团，其中n为1至5的整数，n.sub.2为1至4的整数。基团Z.sub.2和Z.sub.3各自是选自CH.sub.2 Ar、CH.sub.2 CONHCH.sub.2 Ar、CH.sub.2 CONH(CH.sub.2).sub.n.sbsb.3 CO--NHCH.sub.2 Ar和(CH.sub.2).sub.n.sbsb.4 NHCO(CH.sub.2).sub.n.sbsb.5 CONHCH.sub.2 Ar的间隔基团，其中基团Ar表示通用式I中试剂的芳香环，其中n.sub.3为1至5的整数，n.sub.4为2或3的整数，n.sub.5为1至4的整数。通用式I的试剂与生物活性物种的反应得到具有悬垂双功能硼化合物络合基团的结合物（一个或多个）。结合物可以进一步与羟胺（NH.sub.2 OH）反应，通过苯甲酸酯基团的酰胺化来得到一类双功能硼化合物络合结合物，例如具有一个或多个悬垂双功能硼化合物络合基团的结合物。

  公开号：

  US06156884A1

文献信息

• PURIFICATION OF PRIMER EXTENSION PRODUCTS
  申请人：——

  公开号：US20010049438A1

  公开（公告）日：2001-12-06

  This invention provides methods for purifying nucleic acids, in particular primer extension products such as those obtained in nucleic acid sequencing reactions. The methods involve the use of a primer to which is attached a string of arylboronic acid moieties. After extension of the primer using a polymerase, the primer extension products are complexed with a solid support to which is attached an arylboronic acid complexing moiety. The resulting complex is separated from the reaction mixture, washed, and the primer extension products are dissociated from the solid support. The primer extension products are obtained in a form particularly suitable for loading directly on a capillary electrophoresis apparatus.

  本发明提供了一种纯化核酸的方法，特别是用于纳米级核酸测序反应中获得的引物延伸产物。该方法涉及使用一个引物，该引物附有一串芳基硼酸基团。在使用聚合酶延伸引物后，将引物延伸产物与固定有芳基硼酸络合基团的固体支持物复合。然后将所得的复合物从反应混合物中分离，清洗，并使引物延伸产物从固体支持物中解离。引物延伸产物以特别适合直接加载在毛细管电泳设备上的形式获得。
• Purification of primer extension products
  申请人：Prolinx, Inc.

  公开号：US20040072203A1

  公开（公告）日：2004-04-15

  This invention provides methods for purifying nucleic acids, in particular primer extension products such as those obtained in nucleic acid sequencing reactions. The methods involve the use of a primer to which is attached a string of arylboronic acid moieties. After extension of the primer using a polymerase, the primer extension-products are complexed with a solid support to which is attached an arylboronic acid complexing moiety. The resulting complex is separated from the reaction mixture, washed, and the primer extension products are dissociated from the solid support. The primer extension products are obtained in a form particularly suitable for loading directly on a capillary electrophoresis apparatus.

  本发明提供了纯化核酸的方法，特别是引物延伸产物，如核酸测序反应中获得的引物延伸产物。这些方法涉及使用一种连接了一串芳基硼酸分子的引物。使用聚合酶延伸引物后，引物延伸产物与附有芳基硼酸复合物的固体支持物复合。所得复合物从反应混合物中分离出来，经过洗涤，引物延伸产物从固体支持物中分离出来。得到的引物延伸产物特别适合直接加载到毛细管电泳仪上。
• US6156884A
  申请人：——

  公开号：US6156884A

  公开（公告）日：2000-12-05
• US6414122B1
  申请人：——

  公开号：US6414122B1

  公开（公告）日：2002-07-02
• US6870065B2
  申请人：——

  公开号：US6870065B2

  公开（公告）日：2005-03-22