N-(benzo[d]thiazol-2-yl)-3-bromopropanamide

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并噻唑类
• 英文名称: N-(benzo[d]thiazol-2-yl)-3-bromopropanamide
• 英文别名: N-benzothiazol-2-yl-3-bromopropionamide；N-(1,3-benzothiazol-2-yl)-3-bromopropanamide
• 化学式: C₁₀H₉BrN₂OS
• 分子量: 285.164
• InChiKey: DLAQHIVUIVWAKH-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.6
• 重原子数：
  15
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.2
• 拓扑面积：
  70.2
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-(benzo[d]thiazol-2-yl)-3-bromopropanamide 在 sodium azide 作用下， 生成
  参考文献：
  名称：

  靶向分枝杆菌蛋白酪氨酸磷酸酶 B 用于抗结核药物。

  摘要：

  蛋白质酪氨酸磷酸酶常被病原菌利用和破坏，引起人类疾病。来自结核分枝杆菌的酪氨酸磷酸酶 mPTPB 是一种必需的毒力因子，由细菌分泌到巨噬细胞的细胞质中，在那里它介导分枝杆菌在宿主中的存活。因此，人们对了解 mPTPB 逃避宿主免疫反应的机制以及开发作为独特抗结核 (antiTB) 药物的强效和选择性 mPTPB 抑制剂具有相当大的兴趣。我们发现 mPTPB 通过阻断 ERK1/2 和 p38 介导的 IL-6 产生并通过激活 Akt 通路促进宿主细胞存活来破坏先天免疫反应。我们鉴定了一种具有高效细胞活性的强效选择性 mPTPB 抑制剂 I-A09，来自通过点击化学组装的双齿苯并呋喃水杨酸衍生物的组合文库。我们证明了在巨噬细胞中用 I-A09 抑制 mPTPB 可以逆转细菌磷酸酶诱导的宿主免疫反应的改变，并防止宿主细胞中的结核病生长。结果提供了必要的原理验证数据，以支持 mPTPB 的特定抑制剂可作为有效的抗结核治疗剂的观点。

  DOI：

  10.1073/pnas.0909133107
• 作为产物：
  描述：

  2-氨基苯并噻唑 、 3-溴丙酰氯 以 四氢呋喃 为溶剂， 以26%的产率得到N-(benzo[d]thiazol-2-yl)-3-bromopropanamide
  参考文献：
  名称：

  氨基羧酰胺苯并噻唑类化合物可能是LSD1的潜在抑制剂。第一部分：基于计算片段的药物设计。

  摘要：

  赖氨酸特异性脱甲基酶LSD1通过特定赖氨酸氨基酸残基的去甲基化作用调节细胞中组蛋白的功能。LSD1在各种癌症中过表达，被认为是癌症治疗的有效靶标。在这项研究中，我们描述了使用基于计算片段的药物设计方法发现新型LSD1抑制剂的过程。Maybridge Ro3 2000多样性片段库的基于结构的筛选已鉴定出与LSD1活性位点内两个不同区域结合的两组片段。De Novo和多拷贝同时搜索（MCSS）对接，配体效率（LE）和结合能计算（BE）有助于选择最佳评分片段，这些片段生长成可产生铅样化合物。使用灵活的对接将最终生长的化合物对接至酶的活性位点，并计算其总结合能，以帮助选择可能合成和生物学评估的潜在LSD1抑制剂。合成了六种化合物并进行了生物学测试，其中两种已显示出对LSD1的有希望的活性。复合具有氨基羧酰胺苯并噻唑支架的图37显示出最佳的抑制活性，IC 50值为18.4μM。选择化合物37作为LSD1命中抑制剂，值得进一步优化。

  DOI：

  10.1016/j.jmgm.2019.107440

文献信息

• Derivatives of Salicylic Acid as Inhibitors of YopH in Yersinia pestis
  作者：Zunnan Huang、Yantao He、Xian Zhang、Andrea Gunawan、Li Wu、Zhong-Yin Zhang、Chung F. Wong

  DOI：10.1111/j.1747-0285.2010.00996.x

  日期：——

  Yersinia pestis causes diseases ranging from gastrointestinal syndromes to bubonic plague and could be misused as a biological weapon. As its protein tyrosine phosphatase YopH has already been demonstrated as a potential drug target, we have developed two series of forty salicylic acid derivatives and found sixteen to have micromolar inhibitory activity. We designed these ligands to have two chemical moieties connected by a flexible hydrocarbon linker to target two pockets in the active site of the protein to achieve binding affinity and selectivity. One moiety possessed the salicylic acid core intending to target the phosphotyrosine‐binding pocket. The other moiety contained different chemical fragments meant to target a nearby secondary pocket. The two series of compounds differed by having hydrocarbon linkers with different lengths. Before experimental co‐crystal structures are available, we have performed molecular docking to predict how these compounds might bind to the protein and to generate structural models for performing binding affinity calculation to aid future optimization of these series of compounds.

  鼠疫杆菌 可引起从胃肠综合征到腺鼠疫等多种疾病，并可能被滥用为生物武器。由于其蛋白酪氨酸磷酸酶 YopH 已被证明是一个潜在的药物靶点，我们研发了两个系列总共 40 种水杨酸衍生物，并发现其中有 16 种具有微摩尔抑制活性。我们设计这些配体，使其通过一个灵活的烃类连接链连接两种不同的化学基团，以作用于蛋白活性位点的两个口袋，从而实现对结合亲和力和选择性的控制。其中一个基团以水杨酸为核心，旨在针对磷酸酪氨酸结合口袋；另一个基团则包含不同的化学片段，用于靶向邻近的次要口袋。这两个系列的化合物区别于它们的烃类连接链长度不同。在实验共晶结构可获得之前，我们进行了分子对接，以预测这些化合物如何与蛋白结合，并建立结构模型，计算结合亲和力，以辅助未来对这一系列化合物的优化工作。
• Amino-carboxamide benzothiazoles as potential LSD1 hit inhibitors. Part I: Computational fragment-based drug design
  作者：Soraya Alnabulsi、Enas A. Al-Hurani、Nizar A. Al-shar'i、Tamam El-Elimat

  DOI：10.1016/j.jmgm.2019.107440

  日期：2019.12

  produce lead-like compounds. The final grown compounds were docked into the active site of the enzyme using flexible docking and their total binding energies were calculated in order to aid the selection of potential LSD1 inhibitors that will be synthesized and biologically evaluated. Six compounds were synthesized and biologically tested, of which two had showed a promising activity against LSD1. Compound

  赖氨酸特异性脱甲基酶LSD1通过特定赖氨酸氨基酸残基的去甲基化作用调节细胞中组蛋白的功能。LSD1在各种癌症中过表达，被认为是癌症治疗的有效靶标。在这项研究中，我们描述了使用基于计算片段的药物设计方法发现新型LSD1抑制剂的过程。Maybridge Ro3 2000多样性片段库的基于结构的筛选已鉴定出与LSD1活性位点内两个不同区域结合的两组片段。De Novo和多拷贝同时搜索（MCSS）对接，配体效率（LE）和结合能计算（BE）有助于选择最佳评分片段，这些片段生长成可产生铅样化合物。使用灵活的对接将最终生长的化合物对接至酶的活性位点，并计算其总结合能，以帮助选择可能合成和生物学评估的潜在LSD1抑制剂。合成了六种化合物并进行了生物学测试，其中两种已显示出对LSD1的有希望的活性。复合具有氨基羧酰胺苯并噻唑支架的图37显示出最佳的抑制活性，IC 50值为18.4μM。选择化合物37作为LSD1命中抑制剂，值得进一步优化。
• Substituted heterocyclic compounds
  申请人：——

  公开号：US20040152890A1

  公开（公告）日：2004-08-05

  Disclosed are novel heterocyclic derivatives, useful for the treatment of various disease states, in particular cardiovascular diseases such as atrial and ventricular arrhythmias, intermittent claudication, Prinzmetal's (variant) angina, stable and unstable angina, exercise induced angina, congestive heart disease, and myocardial infarction. The compounds are also useful in the treatment of diabetes.

  本发明涉及新型杂环衍生物，可用于治疗各种疾病状态，特别是心血管疾病，如心房和心室心律失常、间歇性跛行、普林兹梅特尔（变异型）心绞痛、稳定和不稳定性心绞痛、运动诱发性心绞痛、充血性心力衰竭和心肌梗塞。该化合物也可用于糖尿病的治疗。
• Substituted piperazine compounds and their use as fatty acid oxidation inhibitors
  申请人：CV THERAPEUTICS, INC.

  公开号：EP1806346A1

  公开（公告）日：2007-07-11

  Disclosed are novel heterocyclic derivatives, useful for the treatment of various disease states, in particular cardiovascular diseases such as atrial and ventricular arrhythmias, intermittent claudication, Prinzmetal's (variant) angina, stable and unstable angina, exercise induced angina, congestive heart disease, and myocardial infarction. The compounds are also useful in the treatment of diabetes.

  所公开的新型杂环衍生物可用于治疗各种疾病，尤其是心血管疾病，如房性和室性心律失常、间歇性跛行、普林兹梅塔尔（变异型）心绞痛、稳定型和不稳定型心绞痛、运动诱发心绞痛、充血性心脏病和心肌梗塞。这些化合物还可用于治疗糖尿病。
• SUBSTITUTED PIPERAZINE COMPOUNDS AND THEIR USE AS FATTY ACID OXIDATION INHIBITORS
  申请人：CV THERAPEUTICS, INC.

  公开号：EP1567525B1

  公开（公告）日：2007-06-27