3,6-bis(diethylamino)-9-(2-((4-((2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxy)-4-oxobutyl)(methyl)carbamoyl)phenyl)xanthylium

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并吡喃
• 英文名称: 3,6-bis(diethylamino)-9-(2-((4-((2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxy)-4-oxobutyl)(methyl)carbamoyl)phenyl)xanthylium
• 英文别名: [6-(Diethylamino)-9-[2-[[4-(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxy-4-oxobutyl]-methylcarbamoyl]phenyl]xanthen-3-ylidene]-diethylazanium
• 化学式: C₃₇H₄₃N₄O₆
• 分子量: 639.772
• InChiKey: VPRJYRQXZQPRRX-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.6
• 重原子数：
  47
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  99.5
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  、 Fmoc-甘氨酸 、 Fmoc-L-丙氨酸 、 、 3,6-bis(diethylamino)-9-(2-((4-((2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxy)-4-oxobutyl)(methyl)carbamoyl)phenyl)xanthylium 、 Fmoc-O-叔丁基-L-苏氨酸 、 Fmoc-N-三苯甲基-L-天冬酰胺 在 benzotriazol-1-yloxyl-tris-(pyrrolidino)-phosphonium hexafluorophosphate 、 N,N-二异丙基乙胺 、 哌啶 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 1.25h， 生成
  参考文献：
  名称：

  设计，合成和体外评估cAMP依赖性蛋白激酶（PKACα）催化亚基的荧光标记不可逆抑制剂†

  摘要：

  不可逆激酶抑制剂的设计和开发是激酶药物发现的一个扩展领域。开发这些抑制剂的当前方法是利用ATP竞争性抑制剂支架在激酶ATP结合位点靶向非催化性半胱氨酸。但是，该方法受到限制，因为并非所有激酶在可被靶向的ATP结合位点均具有半胱氨酸。在这项工作中，我们报告了开发利用底物结合位点的不可逆激酶抑制剂的补充方法。使用cAMP依赖性蛋白激酶（PKACα）的催化亚基作为模型系统，我们基于底物竞争性抑制剂支架PKI（14-22）设计并合成了一种不可逆抑制剂，该抑制剂共价修饰PK​​ACα中的非催化Cys199。底物结合位点。新化合物抑制PKACα（IC50 = 11.8±1.1 nM），是激酶面板中PKACα的约100倍选择性，并通过荧光，质谱和动力学实验证明了该激酶的共价标记。这项研究证明了利用这种新方法开发不可逆抑制剂的可行性，这些抑制剂在其底物结合位点具有相似的非催化半胱氨酸的任何89个激酶。

  DOI：

  10.1039/c6ob00529b
• 作为产物：
  描述：

  罗丹明B 在 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 44.0h， 生成 3,6-bis(diethylamino)-9-(2-((4-((2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxy)-4-oxobutyl)(methyl)carbamoyl)phenyl)xanthylium
  参考文献：
  名称：

  设计，合成和体外评估cAMP依赖性蛋白激酶（PKACα）催化亚基的荧光标记不可逆抑制剂†

  摘要：

  不可逆激酶抑制剂的设计和开发是激酶药物发现的一个扩展领域。开发这些抑制剂的当前方法是利用ATP竞争性抑制剂支架在激酶ATP结合位点靶向非催化性半胱氨酸。但是，该方法受到限制，因为并非所有激酶在可被靶向的ATP结合位点均具有半胱氨酸。在这项工作中，我们报告了开发利用底物结合位点的不可逆激酶抑制剂的补充方法。使用cAMP依赖性蛋白激酶（PKACα）的催化亚基作为模型系统，我们基于底物竞争性抑制剂支架PKI（14-22）设计并合成了一种不可逆抑制剂，该抑制剂共价修饰PK​​ACα中的非催化Cys199。底物结合位点。新化合物抑制PKACα（IC50 = 11.8±1.1 nM），是激酶面板中PKACα的约100倍选择性，并通过荧光，质谱和动力学实验证明了该激酶的共价标记。这项研究证明了利用这种新方法开发不可逆抑制剂的可行性，这些抑制剂在其底物结合位点具有相似的非催化半胱氨酸的任何89个激酶。

  DOI：

  10.1039/c6ob00529b

文献信息

• Design, synthesis, and in vitro evaluation of a fluorescently labeled irreversible inhibitor of the catalytic subunit of cAMP-dependent protein kinase (PKACα)
  作者：Robert A. Coover、Nicole M. Luzi、Sudha Korwar、Maria E. Casile、Charles E. Lyons、Darrell L. Peterson、Keith C. Ellis

  DOI：10.1039/c6ob00529b

  日期：——

  we report a complementary approach to developing irreversible kinase inhibitors that utilizes the substrate-binding site. Using the catalytic subunit of cAMP-dependent protein kinase (PKACα) as a model system, we have designed and synthesized an irreversible inhibitor based on the substrate-competitive inhibitor scaffold PKI(14-22) that covalently modifies non-catalytic Cys199 in the PKACα substrate-binding

  不可逆激酶抑制剂的设计和开发是激酶药物发现的一个扩展领域。开发这些抑制剂的当前方法是利用ATP竞争性抑制剂支架在激酶ATP结合位点靶向非催化性半胱氨酸。但是，该方法受到限制，因为并非所有激酶在可被靶向的ATP结合位点均具有半胱氨酸。在这项工作中，我们报告了开发利用底物结合位点的不可逆激酶抑制剂的补充方法。使用cAMP依赖性蛋白激酶（PKACα）的催化亚基作为模型系统，我们基于底物竞争性抑制剂支架PKI（14-22）设计并合成了一种不可逆抑制剂，该抑制剂共价修饰PK​​ACα中的非催化Cys199。底物结合位点。新化合物抑制PKACα（IC50 = 11.8±1.1 nM），是激酶面板中PKACα的约100倍选择性，并通过荧光，质谱和动力学实验证明了该激酶的共价标记。这项研究证明了利用这种新方法开发不可逆抑制剂的可行性，这些抑制剂在其底物结合位点具有相似的非催化半胱氨酸的任何89个激酶。