5-fluoro-3-(2-(naphthalen-2-yl)-2-oxoethyl)benzo[d]oxazol-2(3H)-one

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 萘
• 英文名称: 5-fluoro-3-(2-(naphthalen-2-yl)-2-oxoethyl)benzo[d]oxazol-2(3H)-one
• 英文别名: 5-Fluoro-3-(2-naphthalen-2-yl-2-oxoethyl)-1,3-benzoxazol-2-one；5-fluoro-3-(2-naphthalen-2-yl-2-oxoethyl)-1,3-benzoxazol-2-one
• 化学式: C₁₉H₁₂FNO₃
• 分子量: 321.308
• InChiKey: ZYZYOGYFCLTNCX-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.1
• 重原子数：
  24
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.05
• 拓扑面积：
  46.6
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2-氨基-4-氟苯酚 在 potassium carbonate 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 2.33h， 生成 5-fluoro-3-(2-(naphthalen-2-yl)-2-oxoethyl)benzo[d]oxazol-2(3H)-one
  参考文献：
  名称：

  苯并[d]恶唑-2（3H）-one衍生物作为色域蛋白CDYL的第一个有效和选择性小分子抑制剂的鉴定和表征。

  摘要：

  组蛋白翻译后修饰（PTM）的表观遗传“阅读器”的化学探针已成为在生理学和病理学上对其靶蛋白进行机理和功能研究的强大工具。然而，仅开发了有限的“阅读器”探针，这限制了我们对这些大分子及其在细胞或动物中的作用的理解。在这里，我们报道了一种结构导向的方法来开发和表征苯并[d]恶唑-2（3H）-类似物，作为第一个有效的和选择性的小分子抑制剂，称为色域Y样（CDYL），一种组蛋白甲基赖氨酸阅读器蛋白。通过分子对接和动态模拟研究了CDYL的色域与修饰的拟肽之间的结合构象，便于随后从Specs化学文库中通过SPR技术验证的数十个命中点进行虚拟筛选（KD值：从271.1μM到5.4μM）。43种化合物的进一步设计和合成有助于解释结构-活性关系（SAR），这导致发现了新型CDYL小分子抑制剂。发现了化合物D03（KD：0.5μM），并且在其他色域蛋白中表现出优异的选择性，包​​括CDYL2（> 140倍），CDY1（未观察到结合）和CBX7（>

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2019.111656

文献信息

• Identification and characterization of benzo[d]oxazol-2(3H)-one derivatives as the first potent and selective small-molecule inhibitors of chromodomain protein CDYL
  作者：Lixin Yang、Yongqing Liu、Minghua Fan、Guiwang Zhu、Hongwei Jin、Jing Liang、Zhenming Liu、Zhuo Huang、Liangren Zhang

  DOI：10.1016/j.ejmech.2019.111656

  日期：2019.11

  [d]oxazol-2(3H)-one analogs as the first potent and selective small-molecule inhibitors of chromodomain Y-like (CDYL), a histone methyllysine reader protein. The binding conformation between the chromodomain of CDYL and the modified peptidomimetics was studied via molecular docking and dynamic simulations, facilitating subsequent virtual screening of tens of hits from Specs chemical library validated by SPR technique

  组蛋白翻译后修饰（PTM）的表观遗传“阅读器”的化学探针已成为在生理学和病理学上对其靶蛋白进行机理和功能研究的强大工具。然而，仅开发了有限的“阅读器”探针，这限制了我们对这些大分子及其在细胞或动物中的作用的理解。在这里，我们报道了一种结构导向的方法来开发和表征苯并[d]恶唑-2（3H）-类似物，作为第一个有效的和选择性的小分子抑制剂，称为色域Y样（CDYL），一种组蛋白甲基赖氨酸阅读器蛋白。通过分子对接和动态模拟研究了CDYL的色域与修饰的拟肽之间的结合构象，便于随后从Specs化学文库中通过SPR技术验证的数十个命中点进行虚拟筛选（KD值：从271.1μM到5.4μM）。43种化合物的进一步设计和合成有助于解释结构-活性关系（SAR），这导致发现了新型CDYL小分子抑制剂。发现了化合物D03（KD：0.5μM），并且在其他色域蛋白中表现出优异的选择性，包​​括CDYL2（> 140倍），CDY1（未观察到结合）和CBX7（>