3-(5-carboxy-6-phenylhexyl)coformycin aglycon

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯丙烷和聚酮 - 苯丙酸
• 英文名称: 3-(5-carboxy-6-phenylhexyl)coformycin aglycon
• 英文别名: 2-Benzyl-6-(8-hydroxy-7,8-dihydro-6H-imidazo[4,5-d][1,3]diazepin-3-yl)-hexanoic acid；2-benzyl-6-(8-hydroxy-7,8-dihydro-4H-imidazo[4,5-d][1,3]diazepin-3-yl)hexanoic acid
• 化学式: C₁₉H₂₄N₄O₃
• 分子量: 356.425
• InChiKey: KENABUKLZKAHBP-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.9
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.42
• 拓扑面积：
  99.7
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  6-羟基己酸 在 咪唑 、 sodium hydroxide 、 sodium tetrahydroborate 、 四丁基氟化铵 、 sodium hydride 、 potassium carbonate 、 三乙胺 、 lithium diisopropyl amide 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 正己烷 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 27.25h， 生成 3-(5-carboxy-6-phenylhexyl)coformycin aglycon
  参考文献：
  名称：

  AMP脱氨酶抑制剂。2.初步发现非核苷酸过渡态抑制剂系列。

  摘要：

  描述了一系列可抑制腺苷5'-单磷酸脱氨酶（AMPDA）或腺苷脱氨酶（ADA）的N3取代的甲酰辅酶A糖苷配基类似物。制备这些化合物的关键步骤是（1）用烷基处理6，7-二氢咪唑并[4,5-d] [1,3] diazepin-8（3H）-one（4）的钠盐溴或甲磺酸烷基酯生成N3-烷基化的化合物5和（2）用NaBH（4）还原5。当N 3-取代基包含羧酸部分时，实现了对AMPDA的选择性抑制。例如，具有己酸侧链的化合物7b抑制了具有K（i）＝4.2μM的AMPDA和具有K（i）＝280μM的ADA。大的亲脂性基团α取代为羧酸盐，提供了适度的效能提高，同时保持了选择性，如α-苄基类似物7j（AMPDA K（i）= 0.41 microM和ADA K（i）> 1000 microM）所示。这些化合物以及本系列论文中描述的其他化合物，是第一种适合测试AMPDA选择性抑制是否可以通过增加损伤部位的局部腺苷

  DOI：

  10.1021/jm990447m

文献信息

• Discovery of AMP Mimetics that Exhibit High Inhibitory Potency and Specificity for AMP Deaminase
  作者：Mark D. Erion、Srinivas Rao Kasibhatla、Brett C. Bookser、Paul D. van Poelje、M. Rami Reddy、Harry E. Gruber、James R. Appleman

  DOI：10.1021/ja983153j

  日期：1999.1.1

  The first potent, specific, and cell-penetrable AMP deaminase (AMPDA) inhibitors were discovered through an investigation of 3-substituted 3,6,7,8-tetrahydroimidazo[4,5-d][1,3]diazepin-8-ol analogues. Inhibition constants for the most potent inhibitors were 105-fold lower than the KM for the substrate AMP. High affinity required the presence of both the 8-hydroxyl and the 3-substituent and is postulated

  通过对 3-取代 3,6,7,8-四氢咪唑并[4,5-d][1,3]diazepin-8-的研究，发现了第一个有效、特异性和细胞可渗透的 AMP 脱氨酶 (AMPDA) 抑制剂ol 类似物。最有效抑制剂的抑制常数比底物 AMP 的 KM 低 105 倍。高亲和力需要 8-羟基和 3-取代基的存在，并且被假定来自于降低结合熵成本并使二氮杂碱基采用模拟过渡态 (TS) 结构的结合构象的协同相互作用. 相对于其他 AMP 结合酶，AMPDA 抑制剂系列的高特异性 (> 105）部分归因于二氮杂碱，它有利于与用于稳定 TS 结构的残基相互作用，并排除通常由 AMP 结合酶用于结合 AMP 的相互作用。相比之下，AMPDA 和腺苷脱氨酶 (ADA) 之间的区别，这两种酶假定稳定类似的 TS 结构......