(2S)-2-(9H-芴-9-基甲氧羰基氨基)-3-[1-[(2-甲基丙烷-2-基)氧羰基]哌啶-4-基]丙酸 | 313052-02-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 中文名称: (2S)-2-(9H-芴-9-基甲氧羰基氨基)-3-[1-[(2-甲基丙烷-2-基)氧羰基]哌啶-4-基]丙酸
• 英文名称: N-α-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-β-(1-butyloxycarbonylpiperidine-4-yl)-D,L-alanine
• 英文别名: 2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-3-[1-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonyl]piperidin-4-yl]propanoic acid
• CAS: 313052-02-7
• 化学式: C₂₈H₃₄N₂O₆
• 分子量: 494.588
• InChiKey: JVDSTYGNXVJVKL-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  587.6°C (rough estimate)
• 密度：
  1.2130 (rough estimate)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.7
• 重原子数：
  36
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.46
• 拓扑面积：
  105
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

安全信息

• 危险品标志：
  Xi
• 安全说明：
  S26,S37/39
• 危险类别码：
  R36/37/38

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2S)-2-(9H-芴-9-基甲氧羰基氨基)-3-[1-[(2-甲基丙烷-2-基)氧羰基]哌啶-4-基]丙酸 在 盐酸 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 14.0h， 生成 (9H-fluoren-9-yl)methyl (3-(1-(2-(4-methyl-2-oxo-2,2-dihydroquinolin-6-yl)acetyl)piperidin-4-yl)-1-(methylamino)-1-oxopropan-2-yl)carbamate
  参考文献：
  名称：

  使用 DNA 编码的化学文库选择发现有效的 BET 溴结构域 1 立体选择性抑制剂。

  摘要：

  BRDT、BRD2、BRD3 和 BRD4 包含溴结构域和末端外 (BET) 亚家族，其中包含两个相似的串联溴结构域（BD1 和 BD2）。选择性 BD1 抑制在癌症模型中以及正如我们和其他人所报道的 BRDT 在睾丸中的串联 BET BD 抑制的表型效应。为了寻找新的 BET BD1 结合剂，我们从我们的 DNA 编码化学文库中筛选出超过 45 亿个分子，同时使用 BRDT-BD1 或 BRDT-BD2 蛋白。仅由 BRDT-BD1 富集的化合物系列在 DNA 外重新合成，揭示了一种有效的手性化合物 CDD-724，其抑制 BRDT-BD1 的选择性比 BRDT-BD2 高 2,000 倍以上。CDD-724 立体异构体在抑制 BRDT-BD1 方面表现出显着差异，R-对映异构体 (CDD-787) 的效力是 S-对映异构体 (CDD-786) 的 50 倍。通过结构-活性关系研究，我们生产了

  DOI：

  10.1073/pnas.2122506119

文献信息

• Subtype Selective Substrates for Histone Deacetylases
  作者：Birgit Heltweg、Franck Dequiedt、Brett L. Marshall、Carsten Brauch、Minoru Yoshida、Norikazu Nishino、Eric Verdin、Manfred Jung

  DOI：10.1021/jm0497592

  日期：2004.10.1

  To probe the steric requirements for deacylation, we synthesized lysine-derived small molecule substrates and examined structure -reactivity relationships with various histone deacetylases. Rat liver, human HeLa, and human recombinant class I and II histone deacetylases (HDACs) as well as human recombinant NAD(+)-dependent SIRT1 (class III enzyme) were used in these studies. A benzyloxycarbonyl substituent on the alpha-amino group yielded the highest conversion rates. Replacing the epsilon-acetyl group with larger lipophilic acyl substituents led to a pronounced decrease in conversion by class I and II enzymes; the class III enzyme displayed a greater tolerance. Incubations with recombinant FLAG-tagged human HDACs 1, 3, and 6 showed a distinct subtype selectivity among small molecule substrates. The subtype selectivity of HDAC inhibitors could be predicted with these substrates and an easily obtainable mixture of HDAC subtypes.