Rapid PROTAC Discovery Platform: Nanomole-Scale Array Synthesis and Direct Screening of Reaction Mixtures
作者:Mateusz P. Plesniak、Emilia K. Taylor、Frederik Eisele、Christopher M. B. K. Kourra、Iacovos N. Michaelides、Alice Oram、Johan Wernevik、Zulma Santisteban Valencia、Hannah Rowbottom、Nadia Mann、Linda Fredlund、Valentyna Pivnytska、Anna Novén、Mohammad Pirmoradian、Thomas Lundbäck、R. Ian Storer、Mariell Pettersson、Gian M. De Donatis、Marie Rehnström
DOI:10.1021/acsmedchemlett.3c00314
日期:2023.12.14
empirical, which requires a significant investment of time and resources. To facilitate rapid hit finding, we developed capabilities for PROTAC parallel synthesis and purification by harnessing an array of preformed E3-ligand-linker intermediates. In the next iteration of this approach, we developed a rapid, nanomole-scale PROTAC synthesis methodology using amide coupling that enables direct screening of
精确的长度、形状和接头连接点都是设计有效的蛋白水解靶向嵌合体 (PROTAC) 的组成部分。由于这些异双功能降解剂的合成复杂性以及计算建模辅助 PROTAC 设计的难度,对结构-活性关系的探索主要依靠经验进行,这需要投入大量时间和资源。为了促进快速发现苗头化合物,我们利用一系列预制的 E3 配体接头中间体开发了 PROTAC 平行合成和纯化的能力。在该方法的下一次迭代中,我们开发了一种使用酰胺偶联的快速、纳摩尔级 PROTAC 合成方法,该方法能够在基于细胞的降解测定以及 logD 和 EPSA 测量中直接筛选未纯化的反应混合物。这种方法极大地扩展和加速了 PROTAC SAR 勘探(5 天而不是几周),并避免了费力且对溶剂要求高的反应混合物进行纯化,从而使其成为一种经济且更可持续的 PROTAC 苗头化合物发现方法。