2-(N-(2-((((9H-芴-9-基)甲氧基)羰基)氨基)乙基)-2-(2,4-二氧代-3,4-二氢嘧啶-1(2H)-基)乙酰胺)乙酸 | 959151-70-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 中文名称: 2-(N-(2-((((9H-芴-9-基)甲氧基)羰基)氨基)乙基)-2-(2,4-二氧代-3,4-二氢嘧啶-1(2H)-基)乙酰胺)乙酸
• 英文名称: 2-(N-(2-((((9H-Fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)ethyl)-2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)acetamido)acetic acid
• 英文别名: 2-[[2-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)acetyl]-[2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)ethyl]amino]acetic acid
• CAS: 959151-70-3
• 化学式: C₂₅H₂₄N₄O₇
• 分子量: 492.488
• InChiKey: SSDDNBIJABMEDZ-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.2
• 重原子数：
  36
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.24
• 拓扑面积：
  145
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-(N-(2-((((9H-芴-9-基)甲氧基)羰基)氨基)乙基)-2-(2,4-二氧代-3,4-二氢嘧啶-1(2H)-基)乙酰胺)乙酸 在 1-羟基苯并三唑 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成
  参考文献：
  名称：

  Solid-phase synthesis and evaluation of TAR RNA targeted β-carboline–nucleoside conjugates

  摘要：

  我们合成了四种δ-咔啉核苷共轭物。亲和毛细管电泳分析了这些δ-咔啉核苷共轭物 4â11、13 和 15 与 TAR RNA 的结合亲和力。与 TAR RNA 的结合亲和力数据显示，轭合物 9 和 13 的结合力强于母体化合物 MC3。计算机建模表明，δ-咔啉核苷共轭物 13 能与 TAR RNA 的 UCU 三核苷酸隆起区吻合。

  DOI：

  10.1039/b809598a

文献信息

• PEPTIDE NUCLEIC ACID (PNA) MONOMERS WITH AN ORTHOGONALLY PROTECTED ESTER MOIETY
  申请人：VERA THERAPEUTICS, INC.

  公开号：US20210206809A1

  公开（公告）日：2021-07-08

  This application pertains to orthogonally protected esters of peptide nucleic acid (PNA) monomers, which ester groups can be removed under conditions that permit typical backbone and side chain acid- and base-labile protecting groups to remain substantially intact thereby permitting the high yield of PNA monomer carboxylic acids that are suitable for use in PNA oligomer synthesis. Exemplary ester groups include, but are not limited to, 2,2,2-trichloroethyl (TCE), 2,2,2-tribromoethyl (TBE), 2-bromoethyl (2-BE) and 2-iodoethyl groups (2-IE). This invention also pertains to novel methods for the synthesis of Backbone Ester compounds and related Backbone Ester Acid Salts.
• Solid-phase synthesis and evaluation of TAR RNA targeted β-carboline–nucleoside conjugates
  作者：Peng Zhao、Hong-Wei Jin、Zhen-Jun Yang、Liang-Ren Zhang、Li-He Zhang

  DOI：10.1039/b809598a

  日期：——

  Four types of β-carboline–nucleoside conjugates were synthesized. The binding affinities of these β-carboline–nucleoside conjugates 4–11, 13 and 15 to TAR RNA were evaluated by affinity capillary electrophoresis. The data of binding affinities to TAR RNA show that conjugates 9 and 13 are stronger binders than the parent compound MC3. Computer modeling indicates that the β-carboline–nucleoside conjugate 13 can fit to the UCU three-nucleotide bulge region of TAR RNA.

  我们合成了四种δ-咔啉核苷共轭物。亲和毛细管电泳分析了这些δ-咔啉核苷共轭物 4â11、13 和 15 与 TAR RNA 的结合亲和力。与 TAR RNA 的结合亲和力数据显示，轭合物 9 和 13 的结合力强于母体化合物 MC3。计算机建模表明，δ-咔啉核苷共轭物 13 能与 TAR RNA 的 UCU 三核苷酸隆起区吻合。