sodium [4-(morpholin-4-yl)-6-oxo-1,6-dihydropyrimidin-2-yl]acetate | 1260544-00-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氮化合物
• 英文名称: sodium [4-(morpholin-4-yl)-6-oxo-1,6-dihydropyrimidin-2-yl]acetate
• 英文别名: Sodium (4-morpholin-4-yl-6-oxo-1,6-dihydropyrimidin-2-yl)acetate；sodium;2-(4-morpholin-4-yl-6-oxo-1H-pyrimidin-2-yl)acetate
• CAS: 1260544-00-0
• 化学式: C₁₀H₁₂N₃O₄*Na
• 分子量: 261.213
• InChiKey: FTIOHTRWRYLGKI-UHFFFAOYSA-M

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -5.1
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  94.1
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  sodium [4-(morpholin-4-yl)-6-oxo-1,6-dihydropyrimidin-2-yl]acetate 在 溶剂黄146 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 1.08h， 生成 2-[(5-fluoro-1H-benzimidazol-2-yl)methyl]-6-(morpholin-4-yl)pyrimidin-4(3H)-one
  参考文献：
  名称：

  NOVEL 1H-PYRIMIDIN-2-ONE DERIVATIVES, PREPARATION THEREOF AND PHARMACEUTICAL USE THEREOF AS INHIBITORS OF AKT (PKB) PHOSPHORYLATION

  摘要：

  这项发明涉及公式(I)的新产品：其中Z代表—O—、—NH或Nalk；n代表0至4；R1代表Hal、羟基、烷基或烷氧基；烷基和烷氧基基团可选择性取代；R2和R3代表H、Hal或烷基，可选择性取代一个或多个卤素原子；R4代表H；这些产品在所有异构体形式和盐中作为药物，特别是作为AKT(PKB)磷酸化抑制剂。

  公开号：

  US20120172360A1
• 作为产物：
  描述：

  ethyl [4-(morpholin-4-yl)-6-oxo-1,6-dihydropyrimidin-2-yl]acetate 在 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 48.0h， 以100%的产率得到sodium [4-(morpholin-4-yl)-6-oxo-1,6-dihydropyrimidin-2-yl]acetate
  参考文献：
  名称：

  水的热力学差异决定了溶剂暴露的配体改性的PI3K-β/δ选择性。

  摘要：

  磷酸肌醇3-激酶（PI3K）参与重要的细胞功能，并代表着药物研发工作的理想靶点，特别是与肿瘤学有关的研究。然而，四种PI3K亚型（α，β，γ和δ）具有高度相似的结合位点，这使得选择性抑制剂的设计具有挑战性。一系列对β亚型的选择性高于δ的抑制剂产生了化合物3（S），该​​化合物已进入I / Ib期临床试验，用于晚期PTEN缺陷型癌症患者。有趣的是，X射线晶体学揭示了使抑制剂3（S）和相关化合物对β-亚型具有选择性的修饰不会直接与PI3Kβ或PI3Kδ相互作用，从而混淆了SAR的合理性。这里，我们使用WaterMap应用显式的溶剂分子动力学和溶剂热力学分析，以了解异常的亲和力和选择性趋势。我们发现溶剂能量学和水网络的差异，这是通过不同配体的结合进行调节的，从而解释了实验的亲和力和选择性趋势。这项研究突出了水分子在分子识别中的关键作用，以及在药物开发工作中考虑水网络以合理化和提高选择性的重要性。

  DOI：

  10.1021/acs.jcim.5b00641

文献信息

• Chiral Brønsted Acid from Chiral Phosphoric Acid Boron Complex and Water: Asymmetric Reduction of Indoles
  作者：Kai Yang、Yixian Lou、Chenglan Wang、Liang‐Wen Qi、Tongchang Fang、Feng Zhang、Hetao Xu、Lu Zhou、Wangyang Li、Guan Zhang、Peiyuan Yu、Qiuling Song

  DOI：10.1002/anie.201913656

  日期：2020.2.17

  A new chiral Brønsted acid, generated in situ from a chiral phosphoric acid boron (CPAB) complex and water, was successfully applied to asymmetric indole reduction. This "designer acid catalyst", which is more acidic than TsOH as suggested by DFT calculations, allows the unprecedented direct asymmetric reduction of C2-aryl-substituted N-unprotected indoles and features good to excellent enantioselectivities

  由手性磷酸硼（CPAB）配合物和水原位生成的新手性布朗斯台德酸已成功地用于不对称吲哚还原。如DFT计算所建议的，这种“设计酸催化剂”比TsOH酸性更强，可实现C2-芳基取代的N-未保护的吲哚空前的直接不对称还原，并具有良好的对映选择性，并具有宽泛的官能团耐受性。DFT计算和机理实验表明该反应经历了C3质子化和氢化物转移过程。此外，庞大的C 2-烷基取代的N-未保护的吲哚也适用于该体系。
• Preparation and optimization of new 4-(morpholin-4-yl)-(6-oxo-1,6-dihydropyrimidin-2-yl)amide derivatives as PI3Kβ inhibitors
  作者：Victor Certal、Frank Halley、Angela Virone-Oddos、Fabienne Thompson、Bruno Filoche-Rommé、Youssef El-Ahmad、Jean-Christophe Carry、Cécile Delorme、Andreas Karlsson、Pierre-Yves Abecassis、Loic Vincent、Hélène Bonnevaux、Jean-Paul Nicolas、Renaud Morales、Nadine Michot、Isabelle Vade、Audrey Louboutin、Sébastien Perron、Gilles Doerflinger、Bernadette Tric、Sylvie Monget、Christoph Lengauer、Laurent Schio

  DOI：10.1016/j.bmcl.2012.08.072

  日期：2012.10

  From a HTS campaign, a new series of pyrimidone anilides exemplified by compound 1 has been identified with good inhibitory activity for the PI3Kβ isoform. The structure of compound 1 in PI3Kγ was solved revealing a binding mode in agreement with the SAR observed on PI3Kβ. These compounds displayed inhibition in the nanomolar range in the biochemical assay and were also potent p-Akt inhibitors in a

  从HTS活动中，已鉴定出一系列新的以化合物1为代表的嘧啶酮酐，对PI3Kβ亚型具有良好的抑制活性。解析了PI3Kγ中化合物1的结构，揭示了与PI3Kβ上观察到的SAR一致的结合方式。这些化合物在生化分析中显示出在纳摩尔范围内的抑制作用，并且在PTEN缺陷型PC3前列腺癌细胞系中也是有效的p-Akt抑制剂。体外药物动力学特性的优化导致化合物25在小鼠中表现出52％的生物利用度，并在一项急性PK / PD研究中与靶标结合。
• NOVEL PYRIMIDINE DERIVATIVES, PREPARATION THEREOF, AND PHARMACEUTICAL USE THEREOF AS AKT(PKB) PHOSPHORYLATION INHIBITORS
  申请人：Brollo Maurice

  公开号：US20130274253A1

  公开（公告）日：2013-10-17

  The present invention relates to novel chemical compounds derived from pyrimidines, to the method for preparing same, to the novel intermediates obtained, to the use thereof as drugs, to the pharmaceutical compositions containing same, and to the therapeutic use thereof as AKT inhibitors.

  本发明涉及从嘧啶衍生的新化合物，以及制备该化合物的方法，获得的新中间体，将其用作药物的用途，含有该化合物的药物组合物，以及将其作为AKT抑制剂的治疗用途。
• Differential Water Thermodynamics Determine PI3K-Beta/Delta Selectivity for Solvent-Exposed Ligand Modifications
  作者：Daniel Robinson、Thomas Bertrand、Jean-Christophe Carry、Frank Halley、Andreas Karlsson、Magali Mathieu、Hervé Minoux、Marc-Antoine Perrin、Benoit Robert、Laurent Schio、Woody Sherman

  DOI：10.1021/acs.jcim.5b00641

  日期：2016.5.23

  and represent desirable targets for drug discovery efforts, especially related to oncology; however, the four PI3K subtypes (α, β, γ, and δ) have highly similar binding sites, making the design of selective inhibitors challenging. A series of inhibitors with selectivity toward the β subtype over δ resulted in compound 3(S), which has entered a phase I/Ib clinical trial for patients with advanced PTEN-deficient

  磷酸肌醇3-激酶（PI3K）参与重要的细胞功能，并代表着药物研发工作的理想靶点，特别是与肿瘤学有关的研究。然而，四种PI3K亚型（α，β，γ和δ）具有高度相似的结合位点，这使得选择性抑制剂的设计具有挑战性。一系列对β亚型的选择性高于δ的抑制剂产生了化合物3（S），该​​化合物已进入I / Ib期临床试验，用于晚期PTEN缺陷型癌症患者。有趣的是，X射线晶体学揭示了使抑制剂3（S）和相关化合物对β-亚型具有选择性的修饰不会直接与PI3Kβ或PI3Kδ相互作用，从而混淆了SAR的合理性。这里，我们使用WaterMap应用显式的溶剂分子动力学和溶剂热力学分析，以了解异常的亲和力和选择性趋势。我们发现溶剂能量学和水网络的差异，这是通过不同配体的结合进行调节的，从而解释了实验的亲和力和选择性趋势。这项研究突出了水分子在分子识别中的关键作用，以及在药物开发工作中考虑水网络以合理化和提高选择性的重要性。
• Design, scope and mechanism of highly active and selective chiral NHC–iridium catalysts for the intramolecular hydroamination of a variety of unactivated aminoalkenes
  作者：Daven Foster、Pengchao Gao、Ziyun Zhang、Gellért Sipos、Alexandre N. Sobolev、Gareth Nealon、Laura Falivene、Luigi Cavallo、Reto Dorta

  DOI：10.1039/d0sc05884j

  日期：——

  Chiral, cationic NHC–iridium complexes are introduced as catalysts for the intramolecular hydroamination reaction of unactivated aminoalkenes. The catalysts show high activity in the construction of a range of 5- and 6-membered N-heterocycles, which are accessed in excellent optical purity, with various functional groups being tolerated with this system. A major deactivation pathway is presented and

  引入手性阳离子 NHC-铱配合物作为未活化氨基烯烃分子内氢胺化反应的催化剂。该催化剂在构建一系列 5 元和 6 元 N 杂环时表现出高活性，这些杂环具有优异的光学纯度，并且该系统可以耐受各种官能团。通过使用替代反应条件呈现和消除主要的失活途径。对反应机理进行了详细的实验和计算研究，为催化系统的作用模式提供了有价值的见解，并指出了对该催化平台的未来修改。