N4-acetyl-3'-deoxy-2'-O-palmitoylcytidine | 1193091-05-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: N4-acetyl-3'-deoxy-2'-O-palmitoylcytidine
• 英文别名: [(2R,3R,5S)-2-(4-acetamido-2-oxopyrimidin-1-yl)-5-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hexadecanoate
• CAS: 1193091-05-2
• 化学式: C₂₇H₄₅N₃O₆
• 分子量: 507.671
• InChiKey: GQLJKNUUPFHAMQ-PPJWLVRDSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.9
• 重原子数：
  36
• 可旋转键数：
  19
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.78
• 拓扑面积：
  118
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N4-acetyl-3'-deoxy-2'-O-palmitoylcytidine 、 亚磷酸二苯酯 在 吡啶 作用下， 反应 0.5h， 生成
  参考文献：
  名称：

  3'-脱氧氨基磷酸二核苷作为丙型肝炎病毒亚基因组复制子和 NS5B 聚合酶活性的改进抑制剂

  摘要：

  氨基磷酸酯双核苷命名为“GC 3'-OH”系列，携带各种氨基磷酸酯键，此前已报道为丙型肝炎病毒 (HCV) 抑制剂。为了提高这些二核苷酸的功效，我们合成了一种新的“GC 3'-H”系列作为潜在的链终止剂。我们表明，通过引入新的中性和双负电荷氨基磷酸酯侧链，它们的抑制效力大大提高。在体外和在含有 Huh-6 细胞的 HCV 亚基因组复制子中评估了它们对 HCV NS5B 聚合酶的抑制作用。正如预期的那样，3'-H 化合物比它们的 3'-OH 对应物更有效地抑制 HCV 聚合酶活性。最有效的抑制剂是一种带有双负电荷氨基侧链的 5'-磷酸化二核苷酸 ( 7 )，其 IC 值为50体外 8 μM 的值和 HCV 亚基因组复制子系统中的EC 50值为 2.6 μM。提出了一个分子结构模型来解释 3'-H-胞苷修饰所提供的增益。

  DOI：

  10.1021/jm100102v
• 作为产物：
  描述：

  在 苯磺酸 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 以0.77 g的产率得到N4-acetyl-3'-deoxy-2'-O-palmitoylcytidine
  参考文献：
  名称：

  HIV-1逆转录酶进行2'-脱氧胞苷-5'-单磷酸的δ-二羧丁基氨基磷酸酯作为DNA聚合的底物

  摘要：

  用非天然δ-二羧酸丁基氨基酸取代2'-脱氧核苷三磷酸的焦磷酸盐部分，可以使用HIV-1逆转录酶（RT）作为酶将天然2'-脱氧胞苷掺入DNA中。相反，3'-脱氧胞苷类似物不是HIV-1 RT的底物。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2009.08.001

文献信息

• δ-Di-carboxybutyl phosphoramidate of 2′-deoxycytidine-5′-monophosphate as substrate for DNA polymerization by HIV-1 reverse transcriptase
  作者：Ivan Zlatev、Anne Giraut、François Morvan、Piet Herdewijn、Jean-Jacques Vasseur

  DOI：10.1016/j.bmc.2009.08.001

  日期：2009.10

  of the pyrophosphate moiety of 2′-deoxynucleoside triphosphates by non natural δ-dicarboxylic butyl amino acid allows incorporation of natural 2′-deoxycytidine into DNA using HIV-1 reverse transcriptase (RT) as enzyme. In contrast, the 3′-deoxycytidine analogue was not a substrate of the HIV-1 RT.

  用非天然δ-二羧酸丁基氨基酸取代2'-脱氧核苷三磷酸的焦磷酸盐部分，可以使用HIV-1逆转录酶（RT）作为酶将天然2'-脱氧胞苷掺入DNA中。相反，3'-脱氧胞苷类似物不是HIV-1 RT的底物。
• 3′-Deoxy Phosphoramidate Dinucleosides as Improved Inhibitors of Hepatitis C Virus Subgenomic Replicon and NS5B Polymerase Activity
  作者：Stephane Priet、Ivan Zlatev、Ivan Barvik、Katrien Geerts、Pieter Leyssen、Johan Neyts、Helene Dutartre、Bruno Canard、Jean-Jacques Vasseur、François Morvan、Karine Alvarez

  DOI：10.1021/jm100102v

  日期：2010.9.23

  bis-negatively charged phosphoramidate side chains. Their inhibitory effect on HCV NS5B polymerase was evaluated in vitro and in HCV subgenomic replicon containing Huh-6 cells. As expected, 3′-H compounds are more potent than their 3′-OH counterparts to inhibit HCV polymerase activity. The most potent inhibitor, a 5′-phosphorylated dinucleotide bearing a bis-negatively charged amino side chain (7), exhibits an

  氨基磷酸酯双核苷命名为“GC 3'-OH”系列，携带各种氨基磷酸酯键，此前已报道为丙型肝炎病毒 (HCV) 抑制剂。为了提高这些二核苷酸的功效，我们合成了一种新的“GC 3'-H”系列作为潜在的链终止剂。我们表明，通过引入新的中性和双负电荷氨基磷酸酯侧链，它们的抑制效力大大提高。在体外和在含有 Huh-6 细胞的 HCV 亚基因组复制子中评估了它们对 HCV NS5B 聚合酶的抑制作用。正如预期的那样，3'-H 化合物比它们的 3'-OH 对应物更有效地抑制 HCV 聚合酶活性。最有效的抑制剂是一种带有双负电荷氨基侧链的 5'-磷酸化二核苷酸 ( 7 )，其 IC 值为50体外 8 μM 的值和 HCV 亚基因组复制子系统中的EC 50值为 2.6 μM。提出了一个分子结构模型来解释 3'-H-胞苷修饰所提供的增益。