[9-(2-Carboxyphenyl)-6-[ethyl(3,3,4,4,5,5,6,6,7,7,8,8,8-tridecafluorooctyl)amino]xanthen-3-ylidene]-ethyl-(3,3,4,4,5,5,6,6,7,7,8,8,8-tridecafluorooctyl)azanium;chloride | 1441383-27-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并吡喃
• 英文名称: [9-(2-Carboxyphenyl)-6-[ethyl(3,3,4,4,5,5,6,6,7,7,8,8,8-tridecafluorooctyl)amino]xanthen-3-ylidene]-ethyl-(3,3,4,4,5,5,6,6,7,7,8,8,8-tridecafluorooctyl)azanium;chloride
• 英文别名: [9-(2-carboxyphenyl)-6-[ethyl(3,3,4,4,5,5,6,6,7,7,8,8,8-tridecafluorooctyl)amino]xanthen-3-ylidene]-ethyl-(3,3,4,4,5,5,6,6,7,7,8,8,8-tridecafluorooctyl)azanium;chloride
• CAS: 1441383-27-2
• 化学式: C₄₀H₂₉F₂₆N₂O₃*Cl
• 分子量: 1115.09
• InChiKey: JRCBQMOGCGDJTQ-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  10.78
• 重原子数：
  72
• 可旋转键数：
  19
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  52.8
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  31

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  [9-(2-Carboxyphenyl)-6-[ethyl(3,3,4,4,5,5,6,6,7,7,8,8,8-tridecafluorooctyl)amino]xanthen-3-ylidene]-ethyl-(3,3,4,4,5,5,6,6,7,7,8,8,8-tridecafluorooctyl)azanium;chloride 、 2-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)(6-((tert-butoxycarbonyl)-amino)hexyl)amino)acetic acid 在 1-羟基苯并三唑 、 N,N'-二异丙基碳二亚胺 、 哌啶 作用下， 以 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 0.5h， 以4.09 mg的产率得到[9-[2-[6-Aminohexyl-[2-[6-aminohexyl-[2-[6-aminohexyl-[2-[6-aminohexyl-[2-[6-aminohexyl-[2-[6-aminohexyl-(2-amino-2-oxoethyl)amino]-2-oxoethyl]amino]-2-oxoethyl]amino]-2-oxoethyl]amino]-2-oxoethyl]amino]-2-oxoethyl]carbamoyl]phenyl]-6-[ethyl(3,3,4,4,5,5,6,6,7,7,8,8,8-tridecafluorooctyl)amino]xanthen-3-ylidene]-ethyl-(3,3,4,4,5,5,6,6,7,7,8,8,8-tridecafluorooctyl)azanium;chloride
  参考文献：
  名称：

  罗丹明F：一种用于生物缀合的新型氟马尾染料†

  摘要：

  含氟马尾辫如多氟化烷基残基（CH 2）m（CF 2）n CF 3的引入导致一类新型的基于若丹明的明亮荧光染料。这些染料将经常使用的若丹明染料的出色光物理性质与“轻”氟分子的独特特征相结合。这些特征之一是利用氟固相萃取（F-SPE）分离物质的可能性，这是基于氟化合物之间的特定分子间相互作用。因此，用这些新染料标记的分子不仅可以进行荧光实验，而且还可以轻松纯化（通过所谓的FluoroFlash列）使用前。染料与细胞穿透类肽结合（聚阳离子寡聚（N取代）甘氨酸）放在坚固的支架上。在研究它们的光物理和生物学特性之前，先用F-SPE纯化它们。

  DOI：

  10.1039/c3ob40267c
• 作为产物：
  描述：

  N-乙基-3-甲氧基苯胺 在 三溴化硼 、 对甲苯磺酸 、 丙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 27.0h， 生成 [9-(2-Carboxyphenyl)-6-[ethyl(3,3,4,4,5,5,6,6,7,7,8,8,8-tridecafluorooctyl)amino]xanthen-3-ylidene]-ethyl-(3,3,4,4,5,5,6,6,7,7,8,8,8-tridecafluorooctyl)azanium;chloride
  参考文献：
  名称：

  罗丹明F：一种用于生物缀合的新型氟马尾染料†

  摘要：

  含氟马尾辫如多氟化烷基残基（CH 2）m（CF 2）n CF 3的引入导致一类新型的基于若丹明的明亮荧光染料。这些染料将经常使用的若丹明染料的出色光物理性质与“轻”氟分子的独特特征相结合。这些特征之一是利用氟固相萃取（F-SPE）分离物质的可能性，这是基于氟化合物之间的特定分子间相互作用。因此，用这些新染料标记的分子不仅可以进行荧光实验，而且还可以轻松纯化（通过所谓的FluoroFlash列）使用前。染料与细胞穿透类肽结合（聚阳离子寡聚（N取代）甘氨酸）放在坚固的支架上。在研究它们的光物理和生物学特性之前，先用F-SPE纯化它们。

  DOI：

  10.1039/c3ob40267c

文献信息

• Rhodamine F: a novel class of fluorous ponytailed dyes for bioconjugation
  作者：Dominik K. Kölmel、Birgit Rudat、Delia M. Braun、Christin Bednarek、Ute Schepers、Stefan Bräse

  DOI：10.1039/c3ob40267c

  日期：——

  Incorporation of fluorous ponytails such as polyfluorinated alkyl residues (CH2)m(CF2)nCF3 leads to a novel class of bright rhodamine-based fluorescence dyes. These dyes combine the excellent photophysical properties of the frequently used rhodamine dyes with the unique features of “light” fluorous molecules. One of those features is the possibility to separate substances utilizing fluorous solid-phase

  含氟马尾辫如多氟化烷基残基（CH 2）m（CF 2）n CF 3的引入导致一类新型的基于若丹明的明亮荧光染料。这些染料将经常使用的若丹明染料的出色光物理性质与“轻”氟分子的独特特征相结合。这些特征之一是利用氟固相萃取（F-SPE）分离物质的可能性，这是基于氟化合物之间的特定分子间相互作用。因此，用这些新染料标记的分子不仅可以进行荧光实验，而且还可以轻松纯化（通过所谓的FluoroFlash列）使用前。染料与细胞穿透类肽结合（聚阳离子寡聚（N取代）甘氨酸）放在坚固的支架上。在研究它们的光物理和生物学特性之前，先用F-SPE纯化它们。