(4S)-N-[(2S,3R)-1-[[(Z)-1-[[2-[[(E)-1-[[(2R)-1-[[(2R,3S)-1-[[(2S)-1-[[(2R)-1-[[(Z)-1-[[(2R)-1-[[(2S)-1-[[(2R)-1-[[1-[[(2S)-1-(dimethylamino)-3-methylbutan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobut-2-en-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-1-oxopropan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxopent-2-en-2-yl]amino]-3-hydroxy-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-3-hydroxy-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxopentan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxopent-2-en-2-yl]amino]-2-oxoethyl]amino]-3-methyl-1-oxopent-2-en-2-yl]amino]-3-hydroxy-3-methyl-1-oxopentan-2-yl]-2,2,4,6-tetramethyl-3-oxoheptanamide | 1259475-27-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机聚合物 - 多肽
• 英文名称: (4S)-N-[(2S,3R)-1-[[(Z)-1-[[2-[[(E)-1-[[(2R)-1-[[(2R,3S)-1-[[(2S)-1-[[(2R)-1-[[(Z)-1-[[(2R)-1-[[(2S)-1-[[(2R)-1-[[1-[[(2S)-1-(dimethylamino)-3-methylbutan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobut-2-en-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-1-oxopropan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxopent-2-en-2-yl]amino]-3-hydroxy-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-3-hydroxy-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxopentan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxopent-2-en-2-yl]amino]-2-oxoethyl]amino]-3-methyl-1-oxopent-2-en-2-yl]amino]-3-hydroxy-3-methyl-1-oxopentan-2-yl]-2,2,4,6-tetramethyl-3-oxoheptanamide
• CAS: 1259475-27-8
• 化学式: C₈₃H₁₄₅N₁₅O₁₈
• 分子量: 1641.15
• InChiKey: MBKVJKFMTUJTOW-UKHILTLHSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  9.3
• 重原子数：
  116
• 可旋转键数：
  47
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.72
• 拓扑面积：
  488
• 氢给体数：
  17
• 氢受体数：
  19

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  (S)-2,2,4,6-tetramethyl-3-oxoheptanoic acid 、 (2S,3R)-2-amino-N-[(Z)-1-[[2-[[(E)-1-[[(2R)-1-[[(2R,3S)-1-[[(2S)-1-[[(2R)-1-[[(Z)-1-[[(2R)-1-[[(2S)-1-[[(2R)-1-[[1-[[(2S)-1-(dimethylamino)-3-methylbutan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobut-2-en-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-1-oxopropan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxopent-2-en-2-yl]amino]-3-hydroxy-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-3-hydroxy-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxopentan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxopent-2-en-2-yl]amino]-2-oxoethyl]amino]-3-methyl-1-oxopent-2-en-2-yl]-3-hydroxy-3-methylpentanamide 在 2,4,6-三甲基吡啶 、 (1-cyano-2-ethoxy-2-oxoethylidenaminooxy)dimethylaminomorpholinocarbenium hexafluorophosphate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 5.5h， 以3.6 mg的产率得到(4S)-N-[(2S,3R)-1-[[(Z)-1-[[2-[[(E)-1-[[(2R)-1-[[(2R,3S)-1-[[(2S)-1-[[(2R)-1-[[(Z)-1-[[(2R)-1-[[(2S)-1-[[(2R)-1-[[1-[[(2S)-1-(dimethylamino)-3-methylbutan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobut-2-en-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-1-oxopropan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxopent-2-en-2-yl]amino]-3-hydroxy-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-3-hydroxy-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxopentan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxopent-2-en-2-yl]amino]-2-oxoethyl]amino]-3-methyl-1-oxopent-2-en-2-yl]amino]-3-hydroxy-3-methyl-1-oxopentan-2-yl]-2,2,4,6-tetramethyl-3-oxoheptanamide
  参考文献：
  名称：

  Yaku'amide A的全合成和完整结构分配

  摘要：

  在这里，我们报告了 yaku'amide A 的第一次全合成和完整的立体化学分配。 Yaku'amide A (1) 是从海绵 Ceratopsion sp. 中分离出来的。作为一种非常有效的细胞毒素。除了 N 端酰基 (NTA) 中的 C4 立体化学外，确定了其结构。这种十三肽由 2 个蛋白原氨基酸残基和 11 个非蛋白原氨基酸残基组成，并用 NTA 和一个 C 端胺 (CTA) 封端。α,β-脱氢缬氨酸、E- 和 Z-α,β-脱氢异亮氨酸是 1 中最不寻常的非蛋白质残基，因此需要开发新的组装方法。因此，Cu 介导的交叉偶联反应有效地用于 E/Z 选择性合成三种二肽与脱氢异亮氨酸以及构建四肽与脱氢缬氨酸。然后以逐步方式从四肽延长肽以提供 1 的两种可能的 C4-差向异构体。广泛的 NMR 研究表明，天然 1 具有 C4S-立体化学，使用 P388 小鼠白血病细胞的生物学分析表明，C4-差向异构体具有相当的毒性。用于构建

  DOI：

  10.1021/ja401457h

文献信息

• Total Synthesis and Complete Structural Assignment of Yaku’amide A
  作者：Takefumi Kuranaga、Yusuke Sesoko、Komei Sakata、Naoya Maeda、Atsushi Hayata、Masayuki Inoue

  DOI：10.1021/ja401457h

  日期：2013.4.10

  their assembly. Consequently, Cu-mediated cross-coupling reactions were efficiently employed for E/Z-selective syntheses of the three dipeptides with the dehydroisoleucines and for construction of the tetrapeptide with the dehydrovaline. The peptide was then elongated from the tetrapeptide in a stepwise fashion to deliver the two possible C4-epimers of 1. Extensive NMR studies revealed that the natural

  在这里，我们报告了 yaku'amide A 的第一次全合成和完整的立体化学分配。 Yaku'amide A (1) 是从海绵 Ceratopsion sp. 中分离出来的。作为一种非常有效的细胞毒素。除了 N 端酰基 (NTA) 中的 C4 立体化学外，确定了其结构。这种十三肽由 2 个蛋白原氨基酸残基和 11 个非蛋白原氨基酸残基组成，并用 NTA 和一个 C 端胺 (CTA) 封端。α,β-脱氢缬氨酸、E- 和 Z-α,β-脱氢异亮氨酸是 1 中最不寻常的非蛋白质残基，因此需要开发新的组装方法。因此，Cu 介导的交叉偶联反应有效地用于 E/Z 选择性合成三种二肽与脱氢异亮氨酸以及构建四肽与脱氢缬氨酸。然后以逐步方式从四肽延长肽以提供 1 的两种可能的 C4-差向异构体。广泛的 NMR 研究表明，天然 1 具有 C4S-立体化学，使用 P388 小鼠白血病细胞的生物学分析表明，C4-差向异构体具有相当的毒性。用于构建