polymyxin B1 sulfate | 108965-61-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机聚合物 - 多肽
• 英文名称: polymyxin B1 sulfate
• 英文别名: Polymyxin B1 Sulfate；(6S)-N-[(2S)-4-amino-1-[[(2S,3R)-1-[[(2S)-4-amino-1-oxo-1-[[(3S,6S,9S,12S,15R,18S,21S)-6,9,18-tris(2-aminoethyl)-15-benzyl-3-[(1R)-1-hydroxyethyl]-12-(2-methylpropyl)-2,5,8,11,14,17,20-heptaoxo-1,4,7,10,13,16,19-heptazacyclotricos-21-yl]amino]butan-2-yl]amino]-3-hydroxy-1-oxobutan-2-yl]amino]-1-oxobutan-2-yl]-6-methyloctanamide;sulfuric acid
• CAS: 108965-61-3
• 化学式: C₅₆H₉₈N₁₆O₁₃*H₂O₄S
• 分子量: 1301.57
• InChiKey: HFMDLUQUEXNBOP-GYMBPXIDSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -5.9
• 重原子数：
  90
• 可旋转键数：
  29
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.7
• 拓扑面积：
  574
• 氢给体数：
  20
• 氢受体数：
  22

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  polymyxin B1 sulfate 、 氯甲酸-2,2,2-三氯乙酯 在 三乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 24.0h， 生成 pentakis(N^γ-trichloroethoxycarbonyl)polymyxin B₁
  参考文献：
  名称：

  Semi-synthesis of Polymyxin B (2-10) and Colistin (2-10) Analogs Employing the Trichloroethoxycarbonyl (Troc) Group for Side Chain Protection of .ALPHA.,.GAMMA.-Diaminobutyric Acid Residues

  摘要：

  报告了将天然多粘菌素 B 和秋水仙素化学转化为其 N 端类似物的改进策略。首先，用三氯乙氧羰基（Troc）保护天然多粘菌素 B 和秋水仙素中五个 <小>L-α,γ-二氨基丁酸（Dab）残基的侧链，然后用三氟乙酸（TFA）：甲磺酸（MSA）: 二甲基甲酰胺（DMF）：H2O (10 : 30 : 55 : 5) 在 40 °C 下处理，以选择性地去除 Nα-alkanoyl-Dab(Troc)-OH 。新的关键化合物四(Nγ-Troc)-多粘菌素 B (2-10)和四(Nγ-Troc)-colistin (2-10)的收率分别为 19% 和 15%，高于之前使用三氟乙酰（Tfa）分别制备四(Nγ-Tfa)-多粘菌素 B (2-10) 和四(Nγ-Tfa)-colistin (2-10)的报道。四(Nγ-Troc)-多粘菌素 B (2-10)和四(Nγ-Troc)-考利司汀(2-10)与各种具有脂肪环或芳香环结构的疏水酸进行酰化，然后在 AcOH 中用 Zn 对 Troc 进行脱保护，得到多粘菌素 B (2-10) 和考利司汀 (2-10) 类似物，并将其用于结构-活性关系研究。研究发现，环己基丁酰基、4-联苯乙酰基和 1-金刚烷乙酰基多粘菌素 B (2-10) 对三种革兰氏阴性细菌菌株的抗菌活性与多粘菌素 B 相当。与多粘菌素 B（2-10）相比，环己基丁酰基、4-联苯乙酰基和环十二羰基多粘菌素 B（2-10）的脂多糖羧酸（LPS）结合活性大大提高。各种 Nα-acylated polymyxin B (2-10) 类似物的抗菌活性和 LPS 结合活性略高于相应的 Nα-acylated colistin (2-10) 类似物。

  DOI：

  10.1248/cpb.55.1724

文献信息

• Semisynthetic polymyxins with potent antibacterial activity and reduced kidney cell toxicity
  作者：Cornelis J. Slingerland、Vladyslav Lysenko、Samhita Chaudhuri、Charlotte M. J. Wesseling、Devon Barnes、Rosalinde Masereeuw、Nathaniel I. Martin

  DOI：10.1039/d3md00456b

  日期：——

  A novel series of polymyxin analogues bearing a disulfide linked lipid tail are reported. The most promising variant identified exhibits antibacterial activity equipotent to that of polymyxin B and is >10-fold less toxic towards kidney cells.

  本研究报道了一系列新型多粘菌素类似物，它们带有二硫连接的脂质尾部。所发现的最有前途的变体具有与多粘菌素 B 相当的抗菌活性，而且对肾细胞的毒性降低了 10 倍。
• Semi-synthesis of Polymyxin B (2-10) and Colistin (2-10) Analogs Employing the Trichloroethoxycarbonyl (Troc) Group for Side Chain Protection of .ALPHA.,.GAMMA.-Diaminobutyric Acid Residues
  作者：Keiko Okimura、Kazuhiro Ohki、Yuki Sato、Kuniharu Ohnishi、Naoki Sakura

  DOI：10.1248/cpb.55.1724

  日期：——

  Improved strategies for the chemical conversion of natural polymyxin B and colistin to their N-terminal analogs are reported. First, the protection of the side chains of five L-α,γ-diaminobutyric acid (Dab) residues in natural polymyxin B and colistin was achieved with trichloroethoxycarbonyl (Troc), then the resulting pentakis(Nγ-Troc)-polymyxin B and pentakis(Nγ-Troc)-colistin were treated with trifluoroacetic acid (TFA) : methanesulfonic acid (MSA) : dimethylformamide (DMF) : H2O (10 : 30 : 55 : 5) at 40 °C in order to remove Nα-alkanoyl-Dab(Troc)-OH selectively. The new key compounds, tetrakis(Nγ-Troc)-polymyxin B (2-10) and tetrakis(Nγ-Troc)-colistin (2-10), were obtained in 19% and 15% yields, respectively, which is higher than previous reports using trifluoroacetyl (Tfa) for tetrakis(Nγ-Tfa)-polymyxin B (2-10) and tetrakis(Nγ-Tfa)-colistin (2-10), respectively. Acylation of tetrakis(Nγ-Troc)-polymyxin B (2-10) and tetrakis(Nγ-Troc)-colistin (2-10) with various hydrophobic acids bearing aliphatic or aromatic ring structures, followed by the deprotection of Troc by Zn in AcOH, produced polymyxin B (2-10) and colistin (2-10) analogs which were used for structure–activity relationship studies. It was found that cyclohexylbutanoyl-, 4-biphenylacetyl-, and 1-adamantaneacetyl-polymyxin B (2-10) showed potent antimicrobial activity equal to that of polymyxin B against three Gram-negative bacterial strains. The lipopolysacharide (LPS) binding activity of cyclohexylbutanoyl-, 4-biphenylacetyl-, and cyclododecanecarbonyl-polymyxin B (2-10) increased greatly in comparison with that of polymyxin B (2-10). The various Nα-acylated polymyxin B (2-10) analogs showed slightly higher antimicrobial and LPS binding activities than the corresponding Nα-acylated colistin (2-10) analogs.

  报告了将天然多粘菌素 B 和秋水仙素化学转化为其 N 端类似物的改进策略。首先，用三氯乙氧羰基（Troc）保护天然多粘菌素 B 和秋水仙素中五个 <小>L-α,γ-二氨基丁酸（Dab）残基的侧链，然后用三氟乙酸（TFA）：甲磺酸（MSA）: 二甲基甲酰胺（DMF）：H2O (10 : 30 : 55 : 5) 在 40 °C 下处理，以选择性地去除 Nα-alkanoyl-Dab(Troc)-OH 。新的关键化合物四(Nγ-Troc)-多粘菌素 B (2-10)和四(Nγ-Troc)-colistin (2-10)的收率分别为 19% 和 15%，高于之前使用三氟乙酰（Tfa）分别制备四(Nγ-Tfa)-多粘菌素 B (2-10) 和四(Nγ-Tfa)-colistin (2-10)的报道。四(Nγ-Troc)-多粘菌素 B (2-10)和四(Nγ-Troc)-考利司汀(2-10)与各种具有脂肪环或芳香环结构的疏水酸进行酰化，然后在 AcOH 中用 Zn 对 Troc 进行脱保护，得到多粘菌素 B (2-10) 和考利司汀 (2-10) 类似物，并将其用于结构-活性关系研究。研究发现，环己基丁酰基、4-联苯乙酰基和 1-金刚烷乙酰基多粘菌素 B (2-10) 对三种革兰氏阴性细菌菌株的抗菌活性与多粘菌素 B 相当。与多粘菌素 B（2-10）相比，环己基丁酰基、4-联苯乙酰基和环十二羰基多粘菌素 B（2-10）的脂多糖羧酸（LPS）结合活性大大提高。各种 Nα-acylated polymyxin B (2-10) 类似物的抗菌活性和 LPS 结合活性略高于相应的 Nα-acylated colistin (2-10) 类似物。