Active site mapping of trypsin, thrombin and matriptase-2 by sulfamoyl benzamidines
作者:Stefan Dosa、Marit Stirnberg、Verena Lülsdorff、Daniela Häußler、Eva Maurer、Michael Gütschow
DOI:10.1016/j.bmc.2012.08.042
日期:2012.11
approach was performed with these inhibitors to scan the active site of the three target proteases. In particular, bisbenzamidines, able to interact with both the S1 and S3/S4 binding sites, showed notable affinity. In branched bisbenzamidines 66–73 containing a third hydrophobic residue, opposite effects of the stereochemistry on trypsin and thrombin inhibition were observed.
苯甲idine部分是一种众所周知的精氨酸模拟物,已被引入多种配体中,包括胰蛋白酶样丝氨酸蛋白酶的拟肽抑制剂。根据它们的主要底物特异性,苄am残基与此类酶的S1口袋底部的带负电荷的天冬氨酸相互作用。六个系列的苯甲脒衍生物(的1 - 73)的合成和评价作为两个原型丝氨酸蛋白酶的抑制剂,即,牛胰蛋白酶和人凝血酶。作为进一步的靶标,研究了人Matriptase-2(一种最近发现的II型跨膜丝氨酸蛋白酶)。Matriptase-2通过下调铁调素表达在铁稳态中代表了重要的调节蛋白酶。化合物1 –73个分子被设计为包含一个固定的氨磺酰基苯甲酰胺部分作为精氨酸模拟物和一个连接有连接子的附加亚结构,例如叔丁酯,羧酸盐或第二个苯甲idine官能团。用这些抑制剂进行了系统的作图方法,以扫描三种靶蛋白酶的活性位点。特别地,能够与S1和S3 / S4结合位点相互作用的双苯甲m显示出显着的亲和力。在支链bisbenzamidines