methyl 3-(1-benzyl-2-oxo-2,5-dihydro-1H-pyrrol-3-yl)propanoate | 1276126-45-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 英文名称: methyl 3-(1-benzyl-2-oxo-2,5-dihydro-1H-pyrrol-3-yl)propanoate
• CAS: 1276126-45-4
• 化学式: C₁₅H₁₇NO₃
• 分子量: 259.305
• InChiKey: YZBHZSUQTYRMQR-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.91
• 重原子数：
  19.0
• 可旋转键数：
  5.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  46.61
• 氢给体数：
  0.0
• 氢受体数：
  3.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl 3-(1-benzyl-2-oxo-2,5-dihydro-1H-pyrrol-3-yl)propanoate 在 羟胺钾盐 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 生成 3-(1-benzyl-2-oxo-2,5-dihydro-1H-pyrrol-3-yl)-N-hydroxy-propionamide
  参考文献：
  名称：

  基于结构和性能的γ-内酰胺基HDAC抑制剂的设计，合成和生物学评估

  摘要：

  组蛋白脱乙酰基酶（HDAC）参与翻译后修饰和基因表达。癌细胞通过Epi募集了一定数量的HDAC来维持生存-肿瘤抑制基因的基因下调。HDAC已经成为治疗癌症的有希望的靶标，并且如今已经研究了许多HDAC抑制剂。在先前的研究中，我们合成了δ-内酰胺核心HDAC抑制剂，该抑制剂具有强大的HDAC抑制活性以及癌细胞生长抑制活性。通过对δ-内酰胺类抑制剂的QSAR研究，表明较小的核比较大的核更有活性，因为它更适合HDAC酶活性口袋的狭窄疏水通道。设计和合成了较小的γ-内酰胺核心HDAC抑制剂，以优化生物学和性能。引入苯基，萘基和硫代苯基作为帽基。疏水性和大体积的帽基团由于HDAC与抑制剂之间的疏水性相互作用而提高了HDAC抑制能力。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2010.12.079
• 作为产物：
  描述：

  苄胺 在 RuCl2(1,3-dimesityl-imidazolidin-2-yl)(PCy3)(=CHPh) 、 4-二甲氨基吡啶 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 生成 methyl 3-(1-benzyl-2-oxo-2,5-dihydro-1H-pyrrol-3-yl)propanoate
  参考文献：
  名称：

  基于结构和性能的γ-内酰胺基HDAC抑制剂的设计，合成和生物学评估

  摘要：

  组蛋白脱乙酰基酶（HDAC）参与翻译后修饰和基因表达。癌细胞通过Epi募集了一定数量的HDAC来维持生存-肿瘤抑制基因的基因下调。HDAC已经成为治疗癌症的有希望的靶标，并且如今已经研究了许多HDAC抑制剂。在先前的研究中，我们合成了δ-内酰胺核心HDAC抑制剂，该抑制剂具有强大的HDAC抑制活性以及癌细胞生长抑制活性。通过对δ-内酰胺类抑制剂的QSAR研究，表明较小的核比较大的核更有活性，因为它更适合HDAC酶活性口袋的狭窄疏水通道。设计和合成了较小的γ-内酰胺核心HDAC抑制剂，以优化生物学和性能。引入苯基，萘基和硫代苯基作为帽基。疏水性和大体积的帽基团由于HDAC与抑制剂之间的疏水性相互作用而提高了HDAC抑制能力。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2010.12.079

文献信息

• Lactam-Based HDAC Inhibitors for Anticancer Chemotherapy: Restoration of RUNX3 by Posttranslational Modification and Epigenetic Control
  作者：Misun Cho、Eunhyun Choi、Jae Hyun Kim、Hwan Kim、Hwan Mook Kim、Jang Ik Lee、Ki-Chul Hwang、Hyun-Jung Kim、Gyoonhee Han

  DOI：10.1002/cmdc.201300393

  日期：2014.3

  transcription factor 3 (RUNX3) are regulated by histone deacetylase (HDAC). HDAC inhibition alters epigenetic and posttranslational stability of RUNX3, leading to tumor suppression. However, HDAC inhibitors can nonselectively alter global gene expression through chromatin remodeling. Thus, lactam‐based HDAC inhibitors were screened to identify potent protein stabilizers that maintain RUNX3 stability by acetylation

  肿瘤抑制子相关转录因子3（RUNX3）的表达和稳定性受组蛋白脱乙酰基酶（HDAC）调节。HDAC抑制会改变RUNX3的表观遗传和翻译后稳定性，从而导致肿瘤抑制。但是，HDAC抑制剂可以通过染色质重塑非选择性地改变全局基因的表达。因此，筛选了基于内酰胺的HDAC抑制剂以鉴定有效的蛋白质稳定剂，该稳定剂可通过乙酰化保持RUNX3的稳定性。通过基于细胞的RUNX激活和HDAC抑制测定法确定了111种基于内酰胺的类似物的RUNX活性和HDAC抑制作用。3- [1-（4-溴苄基）-2-氧代-2,5-二氢-1 H-吡咯-3-基] -N-羟基丙酰胺（11-8）可显着提高RUNX3的乙酰化和稳定性，并具有相对较低的RUNX3 mRNA表达和HDAC抑制活性。在MKN28异种移植模型中，该化合物显示出显着的抗肿瘤作用，比SAHA强。因此，我们提出了一种新的策略，其中HDAC抑制剂用作选择性靶向RUNX3的表
• Structure and property based design, synthesis and biological evaluation of γ-lactam based HDAC inhibitors: Part II
  作者：Chulho Lee、Eunhyun Choi、Misun Cho、Boah Lee、Soo Jin Oh、Song-Kyu Park、Kiho Lee、Hwan Mook Kim、Gyoonhee Han

  DOI：10.1016/j.bmcl.2012.04.045

  日期：2012.6

  have been the intriguing targets for treatment of cancer. In previous study, we reported synthesis and the biological preliminary results of γ-lactam based HDAC inhibitors. Based on the previous results, smaller γ-lactam core HDAC inhibitors are more active than the corresponding series of larger δ-lactam based analogues and the hydrophobic and bulky cap groups are required for better potency which

  组蛋白脱乙酰基酶（HDAC）参与翻译后修饰和表观基因表达，并且已成为治疗癌症的诱人靶标。在以前的研究中，我们报道了基于γ-内酰胺的HDAC抑制剂的合成和生物学初步结果。根据先前的结果，较小的γ-内酰胺核HDAC抑制剂比相应的一系列较大的基于δ-内酰胺的类似物具有更高的活性，并且疏水和庞大的盖帽基团需要更好的效力，从而降低了微粒体的稳定性。因此，γ-内酰胺类似物以甲氧基，三氟甲基的基团邻位- ，间位- ，对位制备帽组的位置并评估其生物学效力。其中，具有更大亲脂性的三氟甲基类似物显示出比其他类似物更好的HDAC抑制活性。总体而言，亲脂性导致HDAC活性位点表面与HDAC抑制剂之间的疏水相互作用增加，改善了HDAC抑制活性。