N-[2-(fluorenylmethoxycarbonyl)aminoethyl]-N2-(6-(2-(2-(tert-butyloxycarbonylamino)ethoxy)phenyl)pyrrolocytosin-1-yl)acetyl glycine | 1056015-82-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 英文名称: N-[2-(fluorenylmethoxycarbonyl)aminoethyl]-N2-(6-(2-(2-(tert-butyloxycarbonylamino)ethoxy)phenyl)pyrrolocytosin-1-yl)acetyl glycine
• CAS: 1056015-82-7
• 化学式: C₄₀H₄₂N₆O₉
• 分子量: 750.808
• InChiKey: VRQIVJHKMMJEJL-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.75
• 重原子数：
  55.0
• 可旋转键数：
  14.0
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.3
• 拓扑面积：
  194.18
• 氢给体数：
  4.0
• 氢受体数：
  10.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  benzyl N-[2-(fluorenylmethoxycarbonyl)aminoethyl]-N2-(6-(2-(2-(tert-butyloxycarbonylamino)ethoxy)phenyl)pyrrolocytosin-1-yl)acetyl glycinate 在 1% Pd/C 、 氢气 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 2.0h， 以84%的产率得到N-[2-(fluorenylmethoxycarbonyl)aminoethyl]-N2-(6-(2-(2-(tert-butyloxycarbonylamino)ethoxy)phenyl)pyrrolocytosin-1-yl)acetyl glycine
  参考文献：
  名称：

  Fluorescence and Hybridization Properties of Peptide Nucleic Acid Containing a Substituted Phenylpyrrolocytosine Designed to Engage Guanine with an Additional H-Bond

  摘要：

  A new pyrrolocytosine derivative has been designed to selectively interact with guanine and has been evaluated in peptide nucleic acid where it imparts increased selective binding affinity for complementary oligonucleotides. The modified nucleobase also possesses an exceptionally high fluorescence quantum yield that is responsive to hybridization.

  DOI：

  10.1021/ja804233g