methyl 5-[4-(bromomethyl)phenyl]-2-furancarboxylate | 1242264-61-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 呋喃
• 英文名称: methyl 5-[4-(bromomethyl)phenyl]-2-furancarboxylate
• 英文别名: Methyl 5-[4-(bromomethyl)phenyl]furan-2-carboxylate
• CAS: 1242264-61-4
• 化学式: C₁₃H₁₁BrO₃
• 分子量: 295.133
• InChiKey: BIADLJSNVYKSAE-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  403.6±45.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.440±0.06 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.4
• 重原子数：
  17
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.15
• 拓扑面积：
  39.4
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl 5-[4-(bromomethyl)phenyl]-2-furancarboxylate 在 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三乙胺 、 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 24.33h， 生成 (S)-N-(3-Methyl-1-(Methylamino)-1-Oxobutan-2-Yl)-5-(4-(((4-Oxo-4,5,6,7-Tetrahydro-3h-Cyclopenta[d]pyrimidin-2-Yl)thio)methyl)phenyl)furan-2-Carboxamide
  参考文献：
  名称：

  有力和选择性基质金属蛋白酶13抑制剂的基于结构的设计与合成

  摘要：

  我们描述了使用比较结构分析和结构指导的分子设计来开发基质金属蛋白酶13（MMP-13）的有效和选择性抑制剂（10d和（S）-17b）。我们采用了三步过程，首先比较了化合物5与MMP-13的X射线晶体学结构，并比较了已知MMP-13·抑制剂配合物的结构，然后进行了分子设计和有效但非选择性的合成锌螯合MMP抑制剂（例如10a和10b）。在证明螯合抑制剂（S）-10a，（R）-图10a和10b结合在MMP-13活性位点内，Zn 2+螯合单元被桥接在Zn 2+结合位点上并到达溶剂可及区域的非螯合极性残基代替。经过两轮结构优化后，这些设计方法导致了小分子MMP-13抑制剂10d和（S）-17b，它们在MMP-13的底物结合位点内结合并包围具有催化活性的Zn 2+离子而不会与金属。这些化合物相对于其他MMP表现出至少500倍的选择性。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.7b00514
• 作为产物：
  描述：

  4-羟甲基苯硼酸 在 四(三苯基膦)钯 、 四溴化碳 、 三苯基膦 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 17.25h， 生成 methyl 5-[4-(bromomethyl)phenyl]-2-furancarboxylate
  参考文献：
  名称：

  有力和选择性基质金属蛋白酶13抑制剂的基于结构的设计与合成

  摘要：

  我们描述了使用比较结构分析和结构指导的分子设计来开发基质金属蛋白酶13（MMP-13）的有效和选择性抑制剂（10d和（S）-17b）。我们采用了三步过程，首先比较了化合物5与MMP-13的X射线晶体学结构，并比较了已知MMP-13·抑制剂配合物的结构，然后进行了分子设计和有效但非选择性的合成锌螯合MMP抑制剂（例如10a和10b）。在证明螯合抑制剂（S）-10a，（R）-图10a和10b结合在MMP-13活性位点内，Zn 2+螯合单元被桥接在Zn 2+结合位点上并到达溶剂可及区域的非螯合极性残基代替。经过两轮结构优化后，这些设计方法导致了小分子MMP-13抑制剂10d和（S）-17b，它们在MMP-13的底物结合位点内结合并包围具有催化活性的Zn 2+离子而不会与金属。这些化合物相对于其他MMP表现出至少500倍的选择性。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.7b00514

文献信息

• Falcipain Inhibitors: Optimization Studies of the 2-Pyrimidinecarbonitrile Lead Series
  作者：Jose M. Coterón、David Catterick、Julia Castro、María J. Chaparro、Beatriz Díaz、Esther Fernández、Santiago Ferrer、Francisco J. Gamo、Mariola Gordo、Jiri Gut、Laura de las Heras、Jennifer Legac、Maria Marco、Juan Miguel、Vicente Muñoz、Esther Porras、Juan C. de la Rosa、Jose R. Ruiz、Elena Sandoval、Pilar Ventosa、Philip J. Rosenthal、Jose M. Fiandor

  DOI：10.1021/jm100556b

  日期：2010.8.26

  were studied as potential falcipain inhibitors and therefore potential antiparasitic lead compounds, with the 5-substituted-2-cyanopyrimidine chemical class emerging as the most potent and promising lead series. Through a sequential lead optimization process considering the different positions present in the initial scaffold, nanomolar and subnanomolar inhibitors at falcipains 2 and 3 were identified

  Falcipain-2和falcipain-3是疟原虫恶性疟原虫的木瓜蛋白酶家族半胱氨酸蛋白酶负责宿主血红蛋白水解以提供用于寄生虫蛋白质合成的氨基酸。研究了不同的杂芳基腈衍生物作为潜在的falcipain抑制剂，因此潜在的抗寄生虫铅化合物，其中5-取代的2-氰基嘧啶化学类别成为最有效和有前途的铅系列。考虑到初始支架中存在的不同位置，通过顺序的前导优化过程，鉴定出了在恶性激素2和3处的纳摩尔和亚纳摩尔抑制剂，并具有在微摩尔范围内对抗培养的寄生虫的活性。在铅分子中引入质子化胺后，对培养的寄生虫的活性显着提高了1000倍，而其他SAR趋势没有明显改变。
• [EN] SELECTIVE MATRIX METALLOPROTEINASE-13 INHIBITORS<br/>[FR] INHIBITEURS SÉLECTIFS DE MÉTALLOPROTÉINASES-13 MATRICIELLES
  申请人：FLORIDA ATLANTIC UNIV BOARD OF TRUSTEES

  公开号：WO2018226837A1

  公开（公告）日：2018-12-13

  We describe the use of comparative structural analysis and structure-guided molecular design to develop potent and selective inhibitors (10d and (S)-17b) of matrix metalloproteinase 13 (MMP-13). We applied a three-step process, starting with a comparative analysis of the X-ray crystallographic structure of compound 5 in complex with MMP-13 with published structures of known MMP-13inhibitor complexes followed by molecular design and synthesis of potent, but non-selective zinc-chelating MMP inhibitors (e.g., 10a and 10b). After demonstrating that the pharmacophores of the chelating inhibitors (S)-10a, (R)-10a, and 10b were binding within the MMP-13 active site, the Zn2+ chelating unit was replaced with non-chelating polar residues that bridged over the Zn2+ binding site and reach into a solvent accessible area. After two rounds of structural optimization, these design approaches led to small molecule MMP-13 inhibitors 10d and (S)-17b which bind within the substrate-binding site of MMP-13 and surround the catalytically active Zn2+ ion without chelating to the metal. These compounds exhibit at least 500-fold selectivity versus other MMPs.

  我们描述了比较结构分析和结构引导的分子设计的使用，以开发针对基质金属蛋白酶13（MMP-13）的有效且选择性抑制剂（10d和（S）-17b）。我们应用了一个三步过程，首先是对化合物5与MMP-13复合物的X射线晶体结构进行比较分析，然后与已知的MMP-13抑制剂复合物的已发表结构进行比较，接着进行分子设计和合成有效但非选择性的锌螯合MMP抑制剂（例如10a和10b）。在证明了螯合抑制剂（S）-10a、（R）-10a和10b的药效团结合在MMP-13活性位点内后，Zn2+螯合单元被替换为桥接到Zn2+结合位点并伸入溶剂可接触区域的非螯合极性残基。经过两轮结构优化，这些设计方法导致小分子MMP-13抑制剂10d和（S）-17b，它们结合在MMP-13的底物结合位点，并围绕着催化活性的Zn2+离子，而不与金属螯合。这些化合物与其他MMP至少具有500倍的选择性。
• Diphenylpyrazoles as Replication Protein A Inhibitors
  作者：Alex G. Waterson、J. Phillip Kennedy、James D. Patrone、Nicholas F. Pelz、Michael D. Feldkamp、Andreas O. Frank、Bhavatarini Vangamudi、Elaine M. Souza-Fagundes、Olivia W. Rossanese、Walter J. Chazin、Stephen W. Fesik

  DOI：10.1021/ml5003629

  日期：2015.2.12

  Replication Protein A is the primary eukaryotic ssDNA binding protein that has a central role in initiating the cellular response to DNA damage. RPA recruits multiple proteins to sites of DNA damage via the N-terminal domain of the 70 kDa subunit (RPA70N). Here we describe the optimization of a diphenylpyrazole carboxylic acid series of inhibitors of these RPA-protein interactions. We evaluated substituents on the aromatic rings as well as the type and geometry of the linkers used to combine fragments, ultimately leading to submicromolar inhibitors of RPA70N protein-protein interactions.
• SELECTIVE MATRIX METALLOPROTEINASE-13 INHIBITORS
  申请人：FLORIDA ATLANTIC UNIVERSITY BOARD OF TRUSTEES

  公开号：US20200181095A1

  公开（公告）日：2020-06-11

  We describe the use of comparative structural analysis and structure-guided molecular design to develop potent and selective inhibitors (10d and (S)-17b) of matrix metalloproteinase 13 (MMP-13). We applied a three-step process, starting with a comparative analysis of the X-ray crystallographic structure of compound 5 in complex with MMP-13 with published structures of known MMP-13 inhibitor complexes followed by molecular design and synthesis of potent, but non-selective zinc-chelating MMP inhibitors (e.g., 10a and 10b). After demonstrating that the pharmacophores of the chelating inhibitors (S)-10a, (R)-10a, and 10b were binding within the MMP-13 active site, the Zn2+ chelating unit was replaced with non-chelating polar residues that bridged over the Zn2+ binding site and reach into a solvent accessible area. After two rounds of structural optimization, these design approaches led to small molecule MMP-13 inhibitors 10d and (S)-17b which bind within the substrate-binding site of MMP-13 and surround the catalytically active Zn2+ ion without chelating to the metal. These compounds exhibit at least 500-fold selectivity versus other MMPs.