cyclo-(AcIII-γ-PPP-(R)-Cys)-β-Dp | 1346132-57-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯丙烷和聚酮 - 大环内酰胺类
• 英文名称: cyclo-(AcIII-γ-PPP-(R)-Cys)-β-Dp
• 英文别名: (42R)-N-[3-[3-(dimethylamino)propylamino]-3-oxopropyl]-5,11,22,28,34,46-hexamethyl-3,9,15,20,26,32,38,44-octaoxo-40-thia-2,5,8,11,14,19,22,25,28,31,34,37,43,46,49,50,51-heptadecazaheptacyclo[43.2.1.14,7.110,13.121,24.127,30.133,36]tripentaconta-1(47),4(53),6,10(52),12,21(51),23,27(50),29,33(49),35,45(48)-dodecaene-42-carboxamide
• CAS: 1346132-57-7
• 化学式: C₅₀H₆₄N₂₀O₁₀S
• 分子量: 1137.25
• InChiKey: LPEGFBMAHDIJRL-HKBQPEDESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.9
• 重原子数：
  81
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  388
• 氢给体数：
  10
• 氢受体数：
  15

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  在 benzotriazol-1-yloxyl-tris-(pyrrolidino)-phosphonium hexafluorophosphate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 1.17h， 生成 cyclo-(AcIII-γ-PPP-(R)-Cys)-β-Dp
  参考文献：
  名称：

  半胱氨酸环吡咯-咪唑聚酰胺用于 DNA 小凹槽中的序列特异性识别

  摘要：

  吡咯-咪唑 (PI) 聚酰胺是小的 DNA 结合分子，可以以高亲和力和特异性识别预定的 DNA 序列。发夹 PI 聚酰胺已被深入研究；然而，环状 PI 聚酰胺受到的关注较少，主要是因为它们的合成困难。在这里，我们描述了一种使用半胱氨酸和氯乙酰残基生产 PI 聚酰胺的新型环化方法。环化反应在1小时内完成，转化效率高。该方法可用于生产可识别 7 bp DNA 序列的长环状 PI 聚酰胺。含有两个β-丙氨酸分子的环状PI聚酰胺比相应的发夹PI聚酰胺具有更高的亲和力和特异性，表明环状PI聚酰胺可以作为一种新型的DNA结合分子。

  DOI：

  10.1021/ja207440p