(2s,5s)-2-Amino-6-[(2r,3s,4r,5r)-5-(6-Amino-9h-Purin-9-Yl)-3,4-Dihydroxytetrahydrofuran-2-Yl]-5-(Propylamino)hexanoic Acid | 1403482-36-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 5'-脱氧核糖核苷
• 英文名称: (2s,5s)-2-Amino-6-[(2r,3s,4r,5r)-5-(6-Amino-9h-Purin-9-Yl)-3,4-Dihydroxytetrahydrofuran-2-Yl]-5-(Propylamino)hexanoic Acid
• 英文别名: (2S,5S)-2-amino-6-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]-5-(propylamino)hexanoic acid
• CAS: 1403482-36-9
• 化学式: C₁₈H₂₉N₇O₅
• 分子量: 423.472
• InChiKey: ZDIZXAAADLAUDS-GTAFEMJLSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.9
• 重原子数：
  30
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.67
• 拓扑面积：
  195
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  N⁶,N⁶-dibenzoyl-5'-deoxy-5'-iodo-2',3'-O-isopropylideneadenosine 在 吡啶 、 magnesium hydroxide 、 双氧水 、 sodium hydride 、 sodium cyanoborohydride 、 magnesium 、 [双(三氟乙酰氧基)碘]苯 作用下， 以 甲醇 、 二甲基亚砜 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 (2s,5s)-2-Amino-6-[(2r,3s,4r,5r)-5-(6-Amino-9h-Purin-9-Yl)-3,4-Dihydroxytetrahydrofuran-2-Yl]-5-(Propylamino)hexanoic Acid
  参考文献：
  名称：

  表观遗传致癌基因MMSET的结构和N-烷基紫杉醇衍生物的抑制作用

  摘要：

  NSD赖氨酸甲基转移酶亚家族的成员是令人信服的肿瘤学靶标，原因是最近在几种血液系统癌症中获得了功能获得性突变和易位。迄今为止，已证明这些蛋白质对小分子抑制具有顽固性。在这里，我们提出了使用溶液相和晶体结构方法鉴定MMSET（aka NSD2或WHSC1）抑制剂的初步努力。在比较NSD1和MMSET结构迁移率的2D NMR实验的基础上，我们设计了一个在其SET结构域的N末端螺旋结构中具有五个点突变的MMSET构建体，用于结晶实验，并阐明了分辨率为2.1Å的突变体MMSET SET结构域的结构。NSD1和MMSET晶体系统均被证明对抑制剂的浸泡或共结晶具有抵抗力。然而，对烷基SETD2和MMSET表现出低微摩尔抑制作用的N-烷基西芬芬净衍生物。

  DOI：

  10.1021/acschembio.6b00308

文献信息

• Sinefungin Derivatives as Inhibitors and Structure Probes of Protein Lysine Methyltransferase SETD2
  作者：Weihong Zheng、Glorymar Ibáñez、Hong Wu、Gil Blum、Hong Zeng、Aiping Dong、Fengling Li、Taraneh Hajian、Abdellah Allali-Hassani、Maria F. Amaya、Alena Siarheyeva、Wenyu Yu、Peter J. Brown、Matthieu Schapira、Masoud Vedadi、Jinrong Min、Minkui Luo

  DOI：10.1021/ja307060p

  日期：2012.10.31

  Epigenetic regulation is involved in numerous physiological and pathogenic processes. Among the key regulators that orchestrate epigenetic signaling are over 50 human protein lysine methyltransferases (PKMTs). Interrogation of the functions of individual PKMTs can be facilitated by target-specific PKMT inhibitors. Given the emerging need for such small molecules, we envisioned an approach to identify target-specific methyltransferase inhibitors by screening privileged small-molecule scaffolds against diverse methyltransferases. In this work, we demonstrated the feasibility of such an approach by identifying the inhibitors of SETD2. N-propyl sinefungin (Pr-SNF) was shown to interact preferentially with SETD2 by matching the distinct transition-state features of SETD2's catalytically active conformer. With Pr-SNF as a structure probe, we further revealed the dual roles of SETD2's post-SET loop in regulating substrate access through a distinct topological reconfiguration. Privileged sinefungin scaffolds are expected to have broad use as structure and chemical probes of methyltransferases.
• Structure of the Epigenetic Oncogene MMSET and Inhibition by <i>N</i>-Alkyl Sinefungin Derivatives
  作者：Dominic Tisi、Elisabetta Chiarparin、Emiliano Tamanini、Puja Pathuri、Joseph E. Coyle、Adam Hold、Finn P. Holding、Nader Amin、Agnes C. L. Martin、Sharna J. Rich、Valerio Berdini、Jeff Yon、Paul Acklam、Rosemary Burke、Ludovic Drouin、Jenny E. Harmer、Fiona Jeganathan、Rob L. M. van Montfort、Yvette Newbatt、Marcello Tortorici、Maura Westlake、Amy Wood、Swen Hoelder、Tom D. Heightman

  DOI：10.1021/acschembio.6b00308

  日期：2016.11.18

  systems proved resistant to soaking or cocrystallography with inhibitors. However, use of the close homologue SETD2 as a structural surrogate supported the design and characterization of N-alkyl sinefungin derivatives, which showed low micromolar inhibition against both SETD2 and MMSET.

  NSD赖氨酸甲基转移酶亚家族的成员是令人信服的肿瘤学靶标，原因是最近在几种血液系统癌症中获得了功能获得性突变和易位。迄今为止，已证明这些蛋白质对小分子抑制具有顽固性。在这里，我们提出了使用溶液相和晶体结构方法鉴定MMSET（aka NSD2或WHSC1）抑制剂的初步努力。在比较NSD1和MMSET结构迁移率的2D NMR实验的基础上，我们设计了一个在其SET结构域的N末端螺旋结构中具有五个点突变的MMSET构建体，用于结晶实验，并阐明了分辨率为2.1Å的突变体MMSET SET结构域的结构。NSD1和MMSET晶体系统均被证明对抑制剂的浸泡或共结晶具有抵抗力。然而，对烷基SETD2和MMSET表现出低微摩尔抑制作用的N-烷基西芬芬净衍生物。