Target Profiling of a Small Library of Phosphodiesterase 5 (PDE5) Inhibitors using Chemical Proteomics
作者:Reinout Raijmakers、Poupak Dadvar、Sarah Pelletier、Joost Gouw、Klaus Rumpel、Albert J. R. Heck
DOI:10.1002/cmdc.201000303
日期:2010.11.8
Inhibitors of phosphodiesterase 5 (PDE5) are widely used for the treatment of erectile dysfunction and pulmonary hypertension. The commercially available inhibitors are effective, well‐tolerated drugs, but differ in their phosphodiesterase specificity. To explore and manipulate the specificity of PDE5 inhibitors, a small library of four inhibitors was synthesized using the structure of known PDE5 inhibitors
磷酸二酯酶5(PDE5)抑制剂广泛用于治疗勃起功能障碍和肺动脉高压。市售的抑制剂是有效的,耐受性良好的药物,但它们的磷酸二酯酶特异性不同。为了探索和操纵PDE5抑制剂的特异性,使用已知PDE5抑制剂的结构作为支架,合成了一个包含四个抑制剂的小型文库。评估了它们对PDE5及其相关家族成员的抑制力。接下来,将它们固定在基质上以在大鼠睾丸组织中进行亲和力下拉测定,然后进行质谱(MS)分析。通过在质谱分析中使用已鉴定蛋白质的独特肽谱计数,我们能够评估这些抑制剂与大量蛋白质的相对结合,可以在体外确定其选择性。对于选定的目标蛋白质,使用定量同位素二甲基标记和免疫印迹以及等温滴定量热法(ITC)验证了结果。对于PDE5抑制剂,我们的数据表明,即使是微小的化学修饰也可以使其选择性明显偏向其他相互作用的蛋白质,从而打开了将这些化合物用作开发新蛋白质靶标抑制剂的支架的潜力。从广义上讲,我们证明了化学蛋白质组学