4-(5-Aminomethyl-pyridin-2-yl)-piperazine-1-carboxylic acid tert-butyl ester | 874880-91-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪烷类
• 英文名称: 4-(5-Aminomethyl-pyridin-2-yl)-piperazine-1-carboxylic acid tert-butyl ester
• 英文别名: tert-Butyl 4-(5-(aminomethyl)pyridin-2-yl)piperazine-1-carboxylate；tert-butyl 4-[5-(aminomethyl)pyridin-2-yl]piperazine-1-carboxylate
• CAS: 874880-91-8
• 化学式: C₁₅H₂₄N₄O₂
• 分子量: 292.381
• InChiKey: LFJRSFAURAIOAB-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.8
• 重原子数：
  21
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  71.7
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-(5-Aminomethyl-pyridin-2-yl)-piperazine-1-carboxylic acid tert-butyl ester 在 potassium carbonate 、 三乙胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 8.0h， 生成 5-Nitro-furan-2-carboxylic acid [6-(4-benzyl-piperazin-1-yl)-pyridin-3-ylmethyl]-amide
  参考文献：
  名称：

  合成抗结核剂5-硝基呋喃-2-羧酸4-（4-苄基哌嗪-1-基）-苄基酰胺的新的有效的类似物，具有改善的生物利用度。

  摘要：

  以前，在我们的抗结核药物发现计划中已经确定了先导化合物5-硝基呋喃-2-羧酸4-（4-苄基哌嗪-1-基）-苄基酰胺。尽管该化合物具有出色的体外活性，但由于其结构特征导致快速的代谢裂解和吸收不良，因此未能达到预期的体内分布，因此限制了其生物利用度。为了提高生物利用度，使用三种修饰方案成功合成了一系列新的类似物：用氨基甲酸酯和尿素官能团取代哌嗪C环上的苄基；将氮原子引入芳族环-B中；环B膨胀成双环四氢异喹啉部分。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2006.02.048
• 作为产物：
  描述：

  6-(哌嗪)吡啶-3-甲腈 在 palladium on activated charcoal 、 镍 lithium hydroxide 、 氢气 、 potassium carbonate 作用下， 以 二甲基亚砜 、 乙酸乙酯 为溶剂， 反应 8.0h， 生成 4-(5-Aminomethyl-pyridin-2-yl)-piperazine-1-carboxylic acid tert-butyl ester
  参考文献：
  名称：

  合成抗结核剂5-硝基呋喃-2-羧酸4-（4-苄基哌嗪-1-基）-苄基酰胺的新的有效的类似物，具有改善的生物利用度。

  摘要：

  以前，在我们的抗结核药物发现计划中已经确定了先导化合物5-硝基呋喃-2-羧酸4-（4-苄基哌嗪-1-基）-苄基酰胺。尽管该化合物具有出色的体外活性，但由于其结构特征导致快速的代谢裂解和吸收不良，因此未能达到预期的体内分布，因此限制了其生物利用度。为了提高生物利用度，使用三种修饰方案成功合成了一系列新的类似物：用氨基甲酸酯和尿素官能团取代哌嗪C环上的苄基；将氮原子引入芳族环-B中；环B膨胀成双环四氢异喹啉部分。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2006.02.048

文献信息

• Direct-to-Biology Accelerates PROTAC Synthesis and the Evaluation of Linker Effects on Permeability and Degradation
  作者：Charles E. Hendrick、Jeff R. Jorgensen、Charu Chaudhry、Iulia I. Strambeanu、Jean-Francois Brazeau、Jamie Schiffer、Zhicai Shi、Jennifer D. Venable、Scott E. Wolkenberg

  DOI：10.1021/acsmedchemlett.2c00124

  日期：2022.7.14

  A platform to accelerate optimization of proteolysis targeting chimeras (PROTACs) has been developed using a direct-to-biology (D2B) approach with a focus on linker effects. A large number of linker analogs─with varying length, polarity, and rigidity─were rapidly prepared and characterized in four cell-based assays by streamlining time-consuming steps in synthesis and purification. The expansive dataset

  使用直接生物学（D2B）方法开发了一个加速优化蛋白水解靶向嵌合体（PROTAC）的平台，重点关注链接效应。通过简化耗时的合成和纯化步骤，在四种基于细胞的测定中快速制备并表征了大量具有不同长度、极性和刚性的接头类似物。广泛的数据集提供了有关细胞内 E3 连接酶靶标参与、降解、渗透性和细胞毒性的接头结构-活性关系 (SAR) 的信息。发现了链接器 SAR 的意外方面，与“链接器学”的文献报道一致，并且该方法极大地加速了经验优化。物理化学性质趋势出现，该平台有潜力快速扩展更复杂预测模型的训练集。我们进行了深入的验证研究，并确认 D2B 平台是加速 PROTAC 设计-制造-测试周期的宝贵工具。