Ac-ARAKGAEFAVKAGVR | 1261080-97-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机聚合物 - 多肽
• 英文名称: Ac-ARAKGAEFAVKAGVR
• CAS: 1261080-97-0
• 化学式: C₆₉H₁₁₇N₂₃O₁₉
• 分子量: 1572.83
• InChiKey: UDYCEYFRKRSDEZ-MJCNSVFASA-N

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  辛二亚氨酸二甲酯 、 Ac-ARAKGAEFAVKAGVR 以 aq. buffer 为溶剂， 反应 2.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  Imidate-Based Cross-Linkers for Structural Proteomics: Increased Charge of Protein and Peptide Ions and CID and ECD Fragmentation Studies

  摘要：

  化学交联是蛋白质复合物结构研究中一种极具吸引力的低分辨率技术。通过质谱（MS）鉴定从交联肽中获得的距离约束可用于构建和验证蛋白质模型。酰胺交联剂（如亚伯硫亚胺二乙酯（DEST））已成功用于化学交联实验。在这项工作中，我们用模型肽和蛋白质评估了商用二亚胺交联试剂--亚伯硫酸二甲酯（DMS）的应用。设计的肽具有乙酰化的 N-端，其后是随机序列，包含两个由 Arg 残基分隔的 Lys 残基。交联反应结束后，分子内和分子间的交联物种会发生 CID 和 ECD 解离，以研究它们在气相中的碎片特征。通过碰撞诱导解离（CID）对分子内肽段进行破碎，显示了一种独特的两步破碎途径，其中包括形成一个酮亚胺作为中间体。电子捕获和电子转移解离（ECD 和 ETD）实验表明，环状分子没有解离。分子间物质在 CID 和 ECD 实验中都表现出了之前描述过的破碎行为。与 DMS 反应后得到的电荷状态分布 (CSD) 与使用辛二酸二琥珀酰亚胺酯 (DSS) 得到的电荷状态分布进行了比较。肽和蛋白质与二甲基亚砜反应后的 CSD 增加，这是因为二甲基亚砜修饰物种的碱性更高。在牛碳酸酐酶 II（BCA）与 DMS 交联和胰蛋白酶解后的 LC-MS 实验中也观察到了这些特征。从该蛋白质中提取的交联肽得到了高置信度的鉴定，这些物种与 BCA 的晶体结构一致。

  DOI：

  10.1007/s13361-014-0900-5