[(2R,3R,4R,5R)-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[[[(2R,3R,4R,5R)-2-(6-aminopurin-9-yl)-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxymethyl]-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxyoxolan-3-yl] [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate | 125234-24-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - （3'->5'）-二核苷酸和类似物
• 英文名称: [(2R,3R,4R,5R)-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[[[(2R,3R,4R,5R)-2-(6-aminopurin-9-yl)-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxymethyl]-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxyoxolan-3-yl] [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate
• CAS: 125234-24-4
• 化学式: C₄₂H₆₅N₁₅O₁₆P₂Si₂
• 分子量: 1154.19
• InChiKey: XGYLMTRSVQIDQO-AHLXXARSSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.44
• 重原子数：
  77.0
• 可旋转键数：
  18.0
• 环数：
  9.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.64
• 拓扑面积：
  427.22
• 氢给体数：
  8.0
• 氢受体数：
  29.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  [(2R,3R,4R,5R)-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[[[(2R,3R,4R,5R)-2-(6-aminopurin-9-yl)-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxymethyl]-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxyoxolan-3-yl] [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate 在 四丁基氟化铵 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 18.0h， 生成 腺苷酰-(2'-5')-腺苷酰-(2'-5')腺苷
  参考文献：
  名称：

  在通过亚磷酰胺法合成 DNA 和 RNA 寡聚体中作为高效启动子的酸/唑复合物

  摘要：

  研究了唑衍生物的各种酸式盐作为促进核苷亚磷酰胺和核苷缩合的促进剂的用途。在这些盐中，N-(苯基)咪唑鎓三氟甲磺酸盐、N-(对乙酰苯基)咪唑鎓三氟甲磺酸盐、N-(甲基)苯并咪唑鎓三氟甲磺酸盐、苯并咪唑鎓三氟甲磺酸盐和N-(苯基)咪唑鎓高氯酸盐在液相中显示出极高的反应性. 这些试剂用作脱氧核糖核苷 3'-（烯丙基 N,N-二异丙基亚磷酰胺）或 3'-（2-氰乙基 N,N-二异丙基亚磷酰胺）的强力活化剂，用于制备脱氧核糖核苷酸，和 3'-O-（叔-丁基二甲基甲硅烷基)核糖核苷 2'-(N,N-二异丙基亚磷酰胺)s 或 2'-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)核糖核苷 3'-(N,N-二异丙基亚磷酰胺)s 用于形成 2'-5' 和 3'-5' 核糖核苷之间的核苷酸间连接，分别。唑鎓盐允许核苷亚磷酰胺和不含 5'-O 的核苷顺利和高产率缩合，其中在乙腈中的粉末分子筛 3A 存在下使用等摩尔量的反应物和促进

  DOI：

  10.1021/ja010078v
• 作为产物：
  描述：

  在 diethylammonium hydrogencarbonate 、 四(三苯基膦)钯 、 三苯基膦 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.08h， 以672 mg的产率得到[(2R,3R,4R,5R)-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[[[(2R,3R,4R,5R)-2-(6-aminopurin-9-yl)-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxymethyl]-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxyoxolan-3-yl] [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate
  参考文献：
  名称：

  在通过亚磷酰胺法合成 DNA 和 RNA 寡聚体中作为高效启动子的酸/唑复合物

  摘要：

  研究了唑衍生物的各种酸式盐作为促进核苷亚磷酰胺和核苷缩合的促进剂的用途。在这些盐中，N-(苯基)咪唑鎓三氟甲磺酸盐、N-(对乙酰苯基)咪唑鎓三氟甲磺酸盐、N-(甲基)苯并咪唑鎓三氟甲磺酸盐、苯并咪唑鎓三氟甲磺酸盐和N-(苯基)咪唑鎓高氯酸盐在液相中显示出极高的反应性. 这些试剂用作脱氧核糖核苷 3'-（烯丙基 N,N-二异丙基亚磷酰胺）或 3'-（2-氰乙基 N,N-二异丙基亚磷酰胺）的强力活化剂，用于制备脱氧核糖核苷酸，和 3'-O-（叔-丁基二甲基甲硅烷基)核糖核苷 2'-(N,N-二异丙基亚磷酰胺)s 或 2'-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)核糖核苷 3'-(N,N-二异丙基亚磷酰胺)s 用于形成 2'-5' 和 3'-5' 核糖核苷之间的核苷酸间连接，分别。唑鎓盐允许核苷亚磷酰胺和不含 5'-O 的核苷顺利和高产率缩合，其中在乙腈中的粉末分子筛 3A 存在下使用等摩尔量的反应物和促进

  DOI：

  10.1021/ja010078v

文献信息

• Synthesis and properties of adenylate trimers A2′p5′A2′p5′A, A2′p5′A3′p5′A and A3′p5′A2′p5′A
  作者：Ramamurthy Charubala、Wolfgang Pfleiderer

  DOI：10.1016/s0040-4039(00)93649-9

  日期：1980.1

  Triadenylates with (2′-5′)(2′-5′) and mixed (2′-5′)(3′-5′) and (3′-5′)(2′-5′) linkages respectively were synthesized via the phosphotriester approach followed by deblocking of the fully protected intermediates. The isomeric trimers were characterized by NMR- and CD-spectra and show very similar hypochromicity effects.

  分别具有（2'-5'）（2'-5'）和混合（2'-5'）（3'-5'）和（3'-5'）（2'-5'）键的三腺苷酸分别为通过磷酸三酯方法合成，然后解封完全保护的中间体。异构体三聚体通过NMR和CD光谱表征，并显示出非常相似的减色效应。