针对高亲和力先导化合物的片段命中优化是基于片段的药物发现 (F
BDD) 的一个关键方面。在目前的研究中,我们通过生长到
乙酰胆碱结合蛋白 (AChBP) 结合位点的
配体诱导亚袋中,成功地优化了一个片段。该蛋白质是 Cys 环受体
配体结合域 (LBD) 的可溶性同源物。片段优化通过
配体复合物的 X 射线结构和使用表面等离子体共振 (
SPR)
生物传感器分析和等温滴定量热法 (ITC) 的系统热力学分析进行监测。使用来自不同物种的定点诱变和 AChBP,我们发现热力学结合谱的特定变化表明与 AChBP 的
配体诱导亚袋相互作用。