2'-O-methyl-6-(1,2-dibenzoyloxyethyl)uridine | 518315-19-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 2'-O-methyl-6-(1,2-dibenzoyloxyethyl)uridine
• 英文别名: [2-benzoyloxy-2-[3-[(2R,3R,4R,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)-3-methoxyoxolan-2-yl]-2,6-dioxopyrimidin-4-yl]ethyl] benzoate
• CAS: 518315-19-0
• 化学式: C₂₆H₂₆N₂O₁₀
• 分子量: 526.5
• InChiKey: VQDMXKHDQVIGGV-IEAAJQJSSA-N

物化性质

• 密度：
  1.47±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.2
• 重原子数：
  38
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.31
• 拓扑面积：
  161
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2'-O-methyl-6-(1,2-dibenzoyloxyethyl)uridine 在 吡啶 、 4,5-二氰基咪唑 作用下， 以 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 4.5h， 生成 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-methyl-6-(1,2-dibenzoyloxyethyl)uridine-3'-O-(2-cyanoethyl-N,N-diisopropyl)phosphoramidite
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of Oligonucleotides with 6-Formyl-2'-O-Methyluridine and Thermal Stability of Their Duplexes

  摘要：

  Single 6-formyl-2'-O-methyluridine or 2'-O-methyluridine was introduced into oligonucleotides (9-23 mers), which have simple base-sequences, as a substituent for thymidine to compare the ability of duplex formation and the thermal stability of the resulting duplexes.

  DOI：

  10.3987/com-02-s20
• 作为产物：
  描述：

  1-[3,5-bis-O-(tert-butyldimethylsilyl)-2-O-methyl-β-D-ribo-furanosyl]-6-(1,2-dihydroxyethyl)-4-ethoxy-2-pyrimidinone 在 盐酸 、 N-[(2,4-二氯苯氧基)-甲氧基硫代膦酰]丙-2-胺 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 9.0h， 生成 2'-O-methyl-6-(1,2-dibenzoyloxyethyl)uridine
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of Oligonucleotides with 6-Formyl-2'-O-Methyluridine and Thermal Stability of Their Duplexes

  摘要：

  Single 6-formyl-2'-O-methyluridine or 2'-O-methyluridine was introduced into oligonucleotides (9-23 mers), which have simple base-sequences, as a substituent for thymidine to compare the ability of duplex formation and the thermal stability of the resulting duplexes.

  DOI：

  10.3987/com-02-s20