开发了基于系统片段的从头设计程序,并将其应用于发现
糖原合酶激酶-3β(GSK3β)的新的有效和选择性
抑制剂。通过三个设计步骤生成候选
抑制剂,以同时最大化GSK3β的生化效能和特异性:鉴定三个亚结合区的最佳分子片段,设计适当的连接部分以连接片段结构单元,以及对GSK3β的最终评分产生的分子。通过使用混合标度粒子理论和扩展的溶剂接触模型修改评分功能中的
配体水合自由能术语,我们确定了几种GSK3β
抑制剂,其生化潜能范围从低纳摩尔到皮摩尔
水平。其中,两种最有效的
抑制剂(12和27)预计将作为有希望的药物发现为因为高特异性GSK3β的抑制引起的GSK3β的各种疾病的起始点。