5'-O-(α-methylphosphonyl)-β,γ-pyrophosphoryl-2'-deoxythymidine | 138989-23-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 5'-O-(α-methylphosphonyl)-β,γ-pyrophosphoryl-2'-deoxythymidine
• 英文别名: [[(2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-methylphosphoryl] phosphono hydrogen phosphate
• CAS: 138989-23-8
• 化学式: C₁₁H₁₉N₂O₁₃P₃
• 分子量: 480.199
• InChiKey: QQFHAAZWMATUAB-DMCCTYFOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4.5
• 重原子数：
  29
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.64
• 拓扑面积：
  219
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  13

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  5'-O-(methylphosphonyl)-2'-deoxythymidine 在 N,N'-羰基二咪唑 、 三丁基焦磷酸铵 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 2.0h， 以18%的产率得到5'-O-(α-methylphosphonyl)-β,γ-pyrophosphoryl-2'-deoxythymidine
  参考文献：
  名称：

  模板导向的DNA中蛋白质-磷酸盐接触的干扰足迹。

  摘要：

  [图：见正文]我们已经开发出一种干扰蛋白-DNA复合物中接触的磷酸盐的干扰足迹的方法。使用合成的三磷酸酯类似物（αMe-dTTP）进行模板指导的酶促聚合，生成的产物具有修饰的核苷酸间键，扰乱​​了蛋白质-磷酸盐的接触。我们发现，在非水条件下（MeO- / MeOH）处理甲基膦二酸酯取代的延伸产物会导致在每个T残基处形成一个裂解产物，但在标准的哌啶水溶液裂解方案下进行处理时会导致两个裂解产物。

  DOI：

  10.1021/ol006792j

文献信息

• XIGUTI, XIROTAKA
  作者：XIGUTI, XIROTAKA

  DOI：——

  日期：——