ethyl 2-[[2-[9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonyl-[2-[(2-methylpropan-2-yl)oxy]-2-oxoethyl]amino]acetyl]-[2-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)ethyl]amino]acetate | 1204812-93-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 英文名称: ethyl 2-[[2-[9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonyl-[2-[(2-methylpropan-2-yl)oxy]-2-oxoethyl]amino]acetyl]-[2-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)ethyl]amino]acetate
• CAS: 1204812-93-0
• 化学式: C₃₄H₄₀N₄O₉
• 分子量: 648.713
• InChiKey: UCGNLDOPMDGQOE-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.3
• 重原子数：
  47
• 可旋转键数：
  16
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.41
• 拓扑面积：
  152
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  ethyl 2-[[2-[9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonyl-[2-[(2-methylpropan-2-yl)oxy]-2-oxoethyl]amino]acetyl]-[2-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)ethyl]amino]acetate 在 lithium hydroxide 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 水 为溶剂， 反应 0.83h， 以69%的产率得到2-[[2-[9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonyl-[2-[(2-methylpropan-2-yl)oxy]-2-oxoethyl]amino]acetyl]-[2-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)ethyl]amino]acetic acid
  参考文献：
  名称：

  用胸腺嘧啶标记的水溶性拟肽核酸寡聚物的设计、合成和杂交

  摘要：

  描述了一种新的主​​链修饰的 PNA 模拟物掺入胸腺嘧啶的制备。目标二肽单体 21 由 N-[2-(thymin-1-yl)ethyl]glycinate 和适当保护的亚氨基二乙酸合成。主链中独特的结构基序是羧基，插入以赋予低聚物水溶性。根据固相合成方案，有效地组装了两个非手性寡肽序列（8-mer 和 12-mer），其特征是酰胺羰基从核碱基转移。热变性研究表明，这两种同型嘧啶寡肽不能与 DNA 和 RNA 的互补序列或完全合成的 (2,4-二氨基)triazin-6-yl-tagged peptoid 22 有效杂交。

  DOI：

  10.1002/ejoc.200900781
• 作为产物：
  描述：

  Ethyl 2-[2-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)ethylamino]acetate 、 Fmoc-nasp(otbu)-oh [Fmoc-n-(叔丁氧基羰基-甲基)-甘氨酸] 在 N,N-二异丙基乙胺 、 Methanaminium,N-[(dimethylamino)(3H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-3-yloxy)methylene]-N-methyl-, hexafluorophosphate(1-) 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以95%的产率得到ethyl 2-[[2-[9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonyl-[2-[(2-methylpropan-2-yl)oxy]-2-oxoethyl]amino]acetyl]-[2-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)ethyl]amino]acetate
  参考文献：
  名称：

  用胸腺嘧啶标记的水溶性拟肽核酸寡聚物的设计、合成和杂交

  摘要：

  描述了一种新的主​​链修饰的 PNA 模拟物掺入胸腺嘧啶的制备。目标二肽单体 21 由 N-[2-(thymin-1-yl)ethyl]glycinate 和适当保护的亚氨基二乙酸合成。主链中独特的结构基序是羧基，插入以赋予低聚物水溶性。根据固相合成方案，有效地组装了两个非手性寡肽序列（8-mer 和 12-mer），其特征是酰胺羰基从核碱基转移。热变性研究表明，这两种同型嘧啶寡肽不能与 DNA 和 RNA 的互补序列或完全合成的 (2,4-二氨基)triazin-6-yl-tagged peptoid 22 有效杂交。

  DOI：

  10.1002/ejoc.200900781