3′,5′-O-bis-(tert-butyl-dimethylsilyl)-4-N-(1H-indol-2-yl-carbonyl)deoxycytidine | 1582719-88-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 3′,5′-O-bis-(tert-butyl-dimethylsilyl)-4-N-(1H-indol-2-yl-carbonyl)deoxycytidine
• CAS: 1582719-88-7
• 化学式: C₃₀H₄₆N₄O₅Si₂
• 分子量: 598.89
• InChiKey: YBSOBVUWSWIOQK-BFLUCZKCSA-N

物化性质

• 密度：
  1.15±0.1 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.68
• 重原子数：
  41.0
• 可旋转键数：
  8.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.57
• 拓扑面积：
  107.47
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  7.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3′,5′-O-bis-(tert-butyl-dimethylsilyl)-4-N-(1H-indol-2-yl-carbonyl)deoxycytidine 在 四丁基氟化铵 、 sodium hydride 作用下， 以 四氢呋喃 、 mineral oil 为溶剂， 反应 6.0h， 生成 4-N-(1-pivaloyloxymethyl-1H-indol-2-yl-carbonyl)-deoxycytidine
  参考文献：
  名称：

  A new modified cytosine base capable of base pairing with guanine using four hydrogen bonds

  摘要：

  含有4-N-(1H-吡咯-2-基甲酰)脱氧胞苷（dC^Pyc）及相关衍生物的寡核苷酸，通过使用1.5 M NaOMe/MeOH进行去保护合成。

  DOI：

  10.1039/c3ob42420k
• 作为产物：
  描述：

  1H-吲哚-2-羰酰氯 、 2',3'-二-O-(叔-丁基二甲基硅烷基)-2'-脱氧胞苷 在 吡啶 作用下， 反应 1.0h， 以90%的产率得到3′,5′-O-bis-(tert-butyl-dimethylsilyl)-4-N-(1H-indol-2-yl-carbonyl)deoxycytidine
  参考文献：
  名称：

  A new modified cytosine base capable of base pairing with guanine using four hydrogen bonds

  摘要：

  含有4-N-(1H-吡咯-2-基甲酰)脱氧胞苷（dC^Pyc）及相关衍生物的寡核苷酸，通过使用1.5 M NaOMe/MeOH进行去保护合成。

  DOI：

  10.1039/c3ob42420k