9-[2-deoxy-5-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2-methoxalylamino-β-D-arabinofuranosyl]-N6-benzoyladenine | 1006062-18-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 9-[2-deoxy-5-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2-methoxalylamino-β-D-arabinofuranosyl]-N6-benzoyladenine
• 英文别名: 9-[2-deoxy-5-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2-methoxalylamino-β-D-arabinofuranosyl]-N⁶-benzoyladenine
• CAS: 1006062-18-5
• 化学式: C₄₁H₃₈N₆O₉
• 分子量: 758.788
• InChiKey: UMRZDCPKCWQWFS-SRATZIGMSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.02
• 重原子数：
  56.0
• 可旋转键数：
  12.0
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.22
• 拓扑面积：
  185.25
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  13.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  9-[2-deoxy-5-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2-methoxalylamino-β-D-arabinofuranosyl]-N6-benzoyladenine 、 双(二异丙基氨基)(2-氰基乙氧基)膦 在 CHN₄^(1-)*iPr₂NH₂⁽¹⁺⁾ 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 4.0h， 以47%的产率得到9-[2-deoxy-5-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2-methoxalylamino-3-(2-cyanoethoxy-N,N-diisopropylaminophosphino)-β-D-arabinofuranosyl]-N⁶-benzoyladenine
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of f luorescein-labeled oligonucleotides bearing a tag in position 2′ of modified adenosine and arabinoadenosine

  摘要：

  含有荧光素残基的寡核苷酸缀合物通过标准固相磷酰胺法合成，使用9-[2-脱氧-5-O-(4,4'-二甲氧基三苯甲基)-2-甲氧羰基氨基-β-D-核糖呋喃糖基]-和9-[2-脱氧-5-O-(4,4'-二甲氧基三苯甲基)-2-甲氧羰基氨基-β-D-阿拉伯糖呋喃糖基]-N6-苯甲酰腺苷的磷酰胺。估计了使用修饰磷酰胺的寡核苷酸合成的相对效率。

  DOI：

  10.1007/s11172-006-0473-y
• 作为产物：
  描述：

  N6-苯甲酰基-3',5'-O-(1,1,3,3-四异丙基-1,3-二硅氧烷二基腺苷 在 palladium on activated charcoal 吡啶 、 sodium azide 、 氢氟酸 、 氢气 、 三乙胺 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 14.0h， 生成 9-[2-deoxy-5-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2-methoxalylamino-β-D-arabinofuranosyl]-N6-benzoyladenine
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of f luorescein-labeled oligonucleotides bearing a tag in position 2′ of modified adenosine and arabinoadenosine

  摘要：

  含有荧光素残基的寡核苷酸缀合物通过标准固相磷酰胺法合成，使用9-[2-脱氧-5-O-(4,4'-二甲氧基三苯甲基)-2-甲氧羰基氨基-β-D-核糖呋喃糖基]-和9-[2-脱氧-5-O-(4,4'-二甲氧基三苯甲基)-2-甲氧羰基氨基-β-D-阿拉伯糖呋喃糖基]-N6-苯甲酰腺苷的磷酰胺。估计了使用修饰磷酰胺的寡核苷酸合成的相对效率。

  DOI：

  10.1007/s11172-006-0473-y