1-[(2R,6S)-6-(hydroxymethyl)-4-trityl-morpholin-2-yl]pyrimidine-2,4-dione | 139323-52-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 1-[(2R,6S)-6-(hydroxymethyl)-4-trityl-morpholin-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
• 英文别名: N-trit-U-morpholino；1-[(2R,6S)-6-(hydroxymethyl)-4-tritylmorpholin-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 139323-52-7
• 化学式: C₂₈H₂₇N₃O₄
• 分子量: 469.54
• InChiKey: UGNHTNPQXYRORJ-AZGAKELHSA-N

物化性质

• 密度：
  1.283±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.1
• 重原子数：
  35
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.21
• 拓扑面积：
  82.1
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-[(2R,6S)-6-(hydroxymethyl)-4-trityl-morpholin-2-yl]pyrimidine-2,4-dione 在 一氯化碘 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 生成 5-iodo-N-trit-U-morpholino
  参考文献：
  名称：

  MORPHOLINO-BASED ANTISENSE AGENT

  摘要：

  基于Morpholino的寡聚体适用作为反义物质，包括对磷酸二胺酰基骨架的修饰或对Morpholino化合物进行5-取代嘧啶的修饰，该化合物在培养基中溶解并足以渗透细胞，从而消除了注射到细胞中的需要。包括上述寡聚体的单体及其制造方法，上述寡聚体及其染料、荧光素、药物、生物分子共轭物的制造方法，其中上述寡聚体具有不同的最终用途，但不限于调控基因表达，具有改善转染效率的组织培养以及有关细胞转染的相关研究。

  公开号：

  US20120296087A1
• 作为产物：
  描述：

  尿嘧啶核苷 在 吡啶 、 sodium periodate 、 ammonium biborate tetrahydrate 、 四丁基氟化铵 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 21.0h， 生成 1-[(2R,6S)-6-(hydroxymethyl)-4-trityl-morpholin-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
  参考文献：
  名称：

  [EN] NUCLEIC ACID-POLYPEPTIDE COMPOSITIONS AND USES THEREOF
  [FR] COMPOSITIONS D'ACIDE NUCLÉIQUE-POLYPEPTIDE ET UTILISATIONS DE CELLES-CI

  摘要：

  本文披露了包含与修饰的多核苷酸分子和聚合物结合基团的组合物和药物配方。本文还描述了利用包含与多核苷酸分子和聚合物结合基团共轭的组合物或药物配方治疗癌症的方法。

  公开号：

  WO2019071028A1

文献信息

• Effective Synthesis of 5-Iodo Derivatives of Pyrimidine Morpholino Nucleosides
  作者：Ivan P. Vohtancev、Yuliya V. Sherstyuk、Vladimir N. Silnikov、Tatyana V. Abramova

  DOI：10.1080/00304948.2018.1462063

  日期：2018.5.4

  derivatives of nucleosides are most commonly used for further functionalization in the cross-coupling reaction because they are more reactive than bromine and chlorine. Previously, the synthesis of the N-Tr-protected morpholino nucleoside containing 1a was reported. The same authors published a procedure for the preparation of 40-N-Trand 20-OCH2-silyl protected morpholino nucleoside containing 5-iodocytosine

  核苷的吗啉衍生物作为合成 DNA 或 siRNA 类似物的单体广泛用于医学和生物学。它们被认为是抗癌、抗病毒、抗菌和抗寄生虫治疗以及生物分析应用的有前途的药物。Morpholino 寡核苷酸是反义治疗中影响深远的候选者。Eteplirsen，吗啉代磷酸二酰胺寡核苷酸，于 2016 年被 FDA 批准用于治疗杜兴氏肌营养不良症。吗啉代核苷三磷酸似乎是 DNA 聚合酶 b 和 HIV-1 逆转录酶的底物，而吗啉代胸苷三磷酸被发现是 Taq DNA 聚合酶的底物. 使用杂环碱基处卤化的核苷衍生物为核苷、核苷酸、和寡核苷酸。核苷的碘衍生物最常用于交叉偶联反应中的进一步官能化，因为它们比溴和氯更具反应性。此前，已报道了含有 1a 的 N-Tr 保护的吗啉代核苷的合成。同一作者发表了一种制备含有 5-碘胞嘧啶作为杂环碱基的 40-N-Trand 20-OCH2-甲硅烷基保护的吗啉代核苷的程序。该方法包
• Design, Synthesis and Molecular Modeling Study of Conjugates of ADP and Morpholino Nucleosides as A Novel Class of Inhibitors of PARP-1, PARP-2 and PARP-3
  作者：Yuliya V. Sherstyuk、Nikita V. Ivanisenko、Alexandra L. Zakharenko、Maria V. Sukhanova、Roman Y. Peshkov、Ilia V. Eltsov、Mikhail M. Kutuzov、Tatiana A. Kurgina、Ekaterina A. Belousova、Vladimir A. Ivanisenko、Olga I. Lavrik、Vladimir N. Silnikov、Tatyana V. Abramova

  DOI：10.3390/ijms21010214

  日期：——

  as well as on the linkage between ADP and morpholino nucleoside. The 5-iodination of uracil and the introduction of the P–N bond in NAD+-mimetics have shown to increase inhibition properties. Structural modeling suggested that the P–N bond can stabilize the pyrophosphate group in active conformation due to the formation of an intramolecular hydrogen bond. The most active NAD+ analog against PARP-1 contained

  我们报告了腺苷二磷酸（ADP）和吗啉代核苷作为聚（ADP-核糖）聚合酶-1、2和3的潜在选择性抑制剂的共轭物的设计，合成和分子建模研究。16种含天然杂环碱基的二核苷焦磷酸盐烟酰胺腺嘌呤二核苷酸（NAD +）分子以5卤代嘧啶为主要成分，并模仿这些酶的主要底物，已高收率地合成。吗啉代核苷已通过磷酸酯或磷酰胺键连接到ADP的β-磷酸酯上。筛选这些衍生物对PARP-1和PARP-2的自聚聚（ADP-核糖基）的抑制特性表明，其作用取决于核碱基的类型以及ADP和吗啉代核苷之间的键合。已证明在NAD +模拟物中尿嘧啶的5碘化和P–N键的引入增加了抑制作用。结构模型表明，由于分子内氢键的形成，PN键可以使焦磷酸酯基团稳定在活性构象中。针对PARP-1的活性最高的NAD +类似物包含5-碘尿嘧啶2′-氨基甲基吗啉代核苷，IC50为126±6μM，而在PARP-2的情况下，它是腺嘌呤2′-氨基甲基吗啉代核苷（
• Synthesis and cell transfection properties of cationic uracil-morpholino tetramer
  作者：Sibasish Paul、Sankha Pattanayak、Surajit Sinha

  DOI：10.1016/j.tetlet.2013.12.087

  日期：2014.1

  Synthesis and cell transfection properties of guanidinium-functionalized uracil morpholino tetramer have been reported for the first time. Due to the basic nature of guanidinium groups they remain protonated under physiological conditions. Such cationic tetramer exhibits efficient cellular uptake properties as visualized by microscopy imaging using fluorescent dye BODIPY. 7'-End of this morpholino tetramer was functionalized with an azide group for conjugation with various types of biomolecules or drugs for cellular delivery. (C) 2013 Elsevier Ltd. All rights reserved.