5'-O-[双(4-甲氧基苯基)苯基甲基]-2'-O-(2-甲氧基乙基)-5-甲基尿苷 | 163759-50-0

• 物质功能分类: 医药中间体 - 杂环化合物
• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 中文名称: 5'-O-[双(4-甲氧基苯基)苯基甲基]-2'-O-(2-甲氧基乙基)-5-甲基尿苷
• 中文别名: 5'-O-(双(4-甲氧基苯基)苯基甲基)-2'-O-(2-甲氧基乙基)-5-甲基尿苷
• 英文名称: 5'-O-(4,4'-dimethoxytriphenylmethyl)-2'-O-(2-methoxyethyl)-5-methyluridine
• 英文别名: 1-((2R,3R,4R,5R)-5-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)-4-hydroxy-3-(2-methoxyethoxy)tetrahydrofuran-2-yl)-5-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione；2'-O-methoxyethyl-5'-O-dimethoxytrityl-5-methyluridine；1-[(2R,3R,4R,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-hydroxy-3-(2-methoxyethoxy)oxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 163759-50-0
• 化学式: C₃₄H₃₈N₂O₉
• 分子量: 618.684
• InChiKey: WIPCVBQXKBWNRC-PBAMLIMUSA-N

物化性质

• 密度：
  1.32

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.1
• 重原子数：
  45
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.35
• 拓扑面积：
  125
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-[双(4-甲氧基苯基)苯基甲基]-2'-O-(2-甲氧基乙基)-5-甲基尿苷 在 二氯乙酸 、 吡咯 、 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 甲醇 为溶剂， 生成 2’-O-(2-甲氧基乙基)-5-甲基尿苷
  参考文献：
  名称：

  可替代的2,7-二甲基-9-苯基黄体酮9-醇（DMPx-OH）的可扩展合成：可用于制备结晶5'- O -DMPx保护的核苷

  摘要：

  使用Friedel-Crafts反应已经完成了几种2,7-二甲基-9-苯基黄嘌呤9-醇（DMPx-OH）类似物的便捷一步合成。在路易斯酸催化剂的B（C 6 F 5）3存在下，用未保护的2' - O-甲氧基乙基-核糖核苷（MOE）处理各种DMPx-OH ，得到5'- O-保护的2'-衍生物MOE-核糖核苷产率高。DMPx基团的脱保护是通过在非常温和的条件下进行酸水解来实现的。在合成的五个DMPx类似物中，2,7-二甲基-9-（4-硝基苯基）氧杂蒽-9-基团提供了结晶产物，使得能够进行非色谱分离5'- O - Protetcated核苷。

  DOI：

  10.1016/j.tetlet.2012.06.081
• 作为产物：
  描述：

  三氯化苄 在 aluminum (III) chloride 、 copper(II) nitrate 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 6.0h， 生成 5'-O-[双(4-甲氧基苯基)苯基甲基]-2'-O-(2-甲氧基乙基)-5-甲基尿苷
  参考文献：
  名称：

  硝酸铜 (II) 催化区域选择性保护伯醇与核苷和碳水化合物中的 4,4'-二甲氧基三苯甲基和 2,7-二甲基-9-苯基呫吨-9-基

  摘要：

  摘要 在作为路易斯酸催化剂的硝酸铜 (II) 存在下，使用二甲氧基三苯甲醇 (DMTr-OH) 或二甲基苯甲醇 (DMPx-OH) 实现了核苷和碳水化合物类似物中伯羟基的区域选择性保护。观察到优异的选择性保护伯羟基而不是仲羟基，而糖苷键不受影响。通过脂肪族无环和环状二醇的 DMTr 和 DMPx 保护进一步举例说明了该方法的实用性。

  DOI：

  10.1080/15257770.2018.1460480

文献信息

• [EN] LINKAGE MODIFIED OLIGOMERIC COMPOUNDS<br/>[FR] COMPOSÉS OLIGOMÈRES MODIFIÉS PAR LIAISON
  申请人：ISIS PHARMACEUTICALS INC

  公开号：WO2015168172A1

  公开（公告）日：2015-11-05

  The present invention provides oligomeric compounds comprising at least one neutral methoxypropyl phosphonate modified internucleoside linkage. Such oligomeric compounds have one or more improved properties such as selectivity, potency, improved toxicity profile and or improved proinflammatory profile. Such oligomeric compounds have enhanced stability to exposure to base during synthesis. Certain such oligomeric compounds are useful for hybridizing to a complementary nucleic acid, including but not limited, to nucleic acids in a cell. In certain embodiments, hybridization results in modulation of the amount activity or expression of the target nucleic acid in a cell.

  本发明提供了含有至少一种中性甲氧基丙基磷酸酯修饰的核苷间连接的寡聚化合物。这种寡聚化合物具有一个或多个改进的性质，如选择性、效力、改进的毒性谱和/或改进的促炎谱。这种寡聚化合物在合成过程中对碱的暴露具有增强的稳定性。某些这种寡聚化合物对于与细胞中的互补核酸杂交是有用的，包括但不限于核酸。在某些实施例中，杂交导致调节细胞中目标核酸的活性或表达量。
• Protection of nucleosides
  申请人：——

  公开号：US20040158055A1

  公开（公告）日：2004-08-12

  A process of manufacturing protected nucleosides comprises reacting a nucleoside with a protecting reagent in the presence of a regioselective activator to produce a regioselectively protected nucleoside. In some embodiments of the inventive method, an optionally substituted trityl or optionally substituted pixyl group is selectively added to the 5′-O-position of a nucleoside in the presence of lutidine as activator or activator/solvent. The inventive method results in improved selectivity of the 5′-O-position over the 3′-O-position, thereby improving overall product yield and purity, and permitting simplified purification protocols, in some cases obviating the need for chromatography to produce a purified protected nucleoside suitable for automated synthesis of oligonucleotides, such as primers, probes and antisense molecules.

  制造受保护核苷的过程包括在具有区域选择性活化剂的存在下，将核苷与保护试剂反应，以产生区域选择性受保护核苷。在本发明方法的一些实施例中，可选择地将一个可选取代的三苯甲基或可选择地取代的哌啶基团选择性地添加到核苷的5'-O-位置，同时存在卢替啶作为活化剂或活化剂/溶剂。这种创新方法导致了对5'-O-位置的选择性提高，从而提高了整体产物产量和纯度，并允许简化的纯化方案，在某些情况下，无需色谱法即可生产适用于寡核苷酸的自动合成的纯化受保护核苷，例如引物、探针和反义分子。
• [EN] STEREOSELECTIVE SYNTHESIS OF PHOSPHOROTHIOATE OLIGORIBONUCLEOTIDES<br/>[FR] SYNTHÈSE STÉRÉOSÉLECTIVE D'OLIGORIBONUCLÉOTIDES DE PHOSPHOROTHIOATE
  申请人：ETH ZUERICH

  公开号：WO2017198775A1

  公开（公告）日：2017-11-23

  The present invention relates to chiral phosphoramidites represented by formula (Ia) or formula (Ib) as novel monomers for the synthesis of stereodefined phosphorothioate MOE oligonucleotides. Furthermore, the present invention relates to a method for synthesizing stereodefined phosphorothioate MOE oligonucleotides using said novel chiral phosphoramidites.

  本发明涉及由式(Ia)或式(Ib)表示的手性磷酰胺亚甲基酯，作为合成立体定义的磷硫酸酯MOE寡核苷酸的新单体。此外，本发明涉及使用所述新型手性磷酰胺亚甲基酯合成立体定义的磷硫酸酯MOE寡核苷酸的方法。
• Antisense modulation of CDC14A expression
  申请人：Isis Pharmaceuticals Inc.

  公开号：US20040077085A1

  公开（公告）日：2004-04-22

  Antisense compounds, compositions and methods are provided for modulating the expression of CDC14A. The compositions comprise antisense compounds, particularly antisense oligonucleotides, targeted to nucleic acids encoding CDC14A. Methods of using these compounds for modulation of CDC14A expression and for treatment of diseases associated with expression of CDC14A are provided.

  提供了用于调节CDC14A表达的反义物化合物、组合物和方法。这些组合物包括针对编码CDC14A的核酸的反义物化合物，特别是反义寡核苷酸。提供了使用这些化合物调节CDC14A表达以及治疗与CDC14A表达相关的疾病的方法。
• Antisense modulation of cyclin-dependent kinase 6 expression
  申请人：Isis Pharmaceuticals Inc.

  公开号：US20040087523A1

  公开（公告）日：2004-05-06

  Antisense compounds, compositions and methods are provided for modulating the expression of cyclin-dependent kinase 6. The compositions comprise antisense compounds, particularly antisense oligonucleotides, targeted to nucleic acids encoding cyclin-dependent kinase 6. Methods of using these compounds for modulation of cyclin-dependent kinase 6 expression and for treatment of diseases associated with expression of cyclin-dependent kinase 6 are provided.

  提供了用于调节细胞周期依赖性激酶6表达的反义化合物、组合物和方法。这些组合物包括针对编码细胞周期依赖性激酶6的核酸的反义化合物，特别是反义寡核苷酸。提供了利用这些化合物调节细胞周期依赖性激酶6表达以及治疗与细胞周期依赖性激酶6表达相关的疾病的方法。