5-[[1-(4,4-dimethyl-2,6-dioxocyclohexylidene)-3-methylbutyl]amino]-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)pentanoic acid

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 英文名称: 5-[[1-(4,4-dimethyl-2,6-dioxocyclohexylidene)-3-methylbutyl]amino]-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)pentanoic acid
• 化学式: C₃₃H₄₀N₂O₆
• 分子量: 560.69
• InChiKey: XSDVRBYPXOEYHM-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.61
• 重原子数：
  41.0
• 可旋转键数：
  11.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  121.8
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  6.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Fmoc-L-丙氨酸 、 N2-(((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)-N6-(oxazole-5-carbonyl)-L-lysine 、 5-[[1-(4,4-dimethyl-2,6-dioxocyclohexylidene)-3-methylbutyl]amino]-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)pentanoic acid 、 (2S,3S)-2-(((allyloxy)carbonyl)amino)-3-(tert-butoxy)butanoic acid 在 N,N-二异丙基乙胺 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 、 哌啶 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 C₂₆H₄₂N₈O₉
  参考文献：
  名称：

  简洁的固相合成能够衍生化 YEATS 结构域环肽抑制剂以改善细胞摄取

  摘要：

  YEATS 结构域是新发现的组蛋白赖氨酸乙酰化和巴豆酰化的表观遗传阅读器，已成为有希望的抗癌药物靶点。我们最近开发了 AF9 YEATS 域选择性环肽抑制剂。然而，环肽的繁琐和耗时的合成限制了进一步的结构衍生化和应用。在这里，我们报道了一种简洁的环肽固相合成方法，该方法大大减少了制备环肽所需的时间，并提高了总收率。此外，这种新的合成路线还允许进一步衍生化具有各种功能模块的环肽，包括荧光染料和细胞穿透肽。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2021.116342