枯草杆菌蛋白酶催化的有机溶剂中核苷酰化的活性和底物特异性可以通过从含有底物的
水溶液中冻干酶来控制。这种“分子印迹”技术使用
胸苷作为模型核苷进行检测,所得枯草杆菌蛋白
酶制剂在几乎无
水四氢呋喃中对
胸苷酰化的反应比在没有核苷的情况下从
水性缓冲液中冻干的
枯草杆菌蛋白酶高 50 倍。尽管用
枯草杆菌蛋白酶冻干的几种化合物,包括胸腺
嘧啶和
核糖,提高了
胸苷酰化的速率,但
胸苷印迹酶是该反应最有效的催化剂。此外,通过在不同亲核底物存在下冻干酶,可以改变
枯草杆菌蛋白酶的底物选择性。例如,印记使得区分结构不同(即
蔗糖与
胸苷)以及结构不同成为可能。