β-分泌酶(BACE1)是淀粉样蛋白-β肽生产中第一步和限速步骤的酶,是治疗阿尔茨海默氏病的诱人靶标。在这项研究中,我们报告了基于从头片段的分子设计程序SPROUT在基于联苯乙酰胺支架的一系列非肽BACE1抑制剂的发现中的应用。从最初的BACE1 IC 50开始,基于这种设计的分子支架的分子的结合亲和力增加了在合成了优化配体库之后,使用最新开发的SPROUT-HitOpt软件对323μM至27μM的分子进行了精制。尽管发现许多抑制剂表现出细胞毒性,但是发现该系列中的一种化合物在细胞测定中具有有用的BACE1抑制活性,并且细胞毒性最小。这项工作证明了基于计算机模拟片段的分子设计方法在发现新型BACE1抑制剂中的强大功能。