H3PO4

• 分子结构分类: 无机化合物 - 均质非金属化合物 - 非金属氧阴离子化合物
• 英文名称: H3PO4
• 英文别名: trihydrogen phosphate；phosphoric acid；phosphorous acid；hydrogen phosphate；hydrogen, monophosphate；polyhydrogen phosphate；phosphric acid；hydron;phosphate
• 化学式: 3H*O₄P
• 分子量: 97.9952
• InChiKey: NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-L

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.3
• 重原子数：
  5
• 可旋转键数：
  0
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.0
• 拓扑面积：
  83.4
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  三氯化铝 、 H3PO4 在 ethylene ixide 作用下， 以 水 为溶剂， 生成 monoaluminum phosphate
  参考文献：
  名称：

  Campelo, J. M.; Garcia, A.; Luna, D., Canadian Journal of Chemistry, 1984, vol. 62, p. 638 - 643

  摘要：

  DOI：
• 作为产物：
  描述：

  disodium hydrogenphosphate 以 水 为溶剂， 生成 H3PO4
  参考文献：
  名称：

  US2011/245444

  摘要：

  公开号：
• 作为试剂：
  描述：

  聚合甲醛 、 草酸醛 、 2,6-二异丙基苯胺 在 H3PO4 、 ammonium acetate 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 以36 %的产率得到1-(2,6-二异丙基苯基)-1H-咪唑
  参考文献：
  名称：

  [EN] UNSYMMETRICAL N-HETEROCYCLIC CARBENE CATALYSTS AND METHODS USING SAME
  [FR] CATALYSEURS CARBÈNES N-HÉTÉROCYCLIQUES ASYMÉTRIQUES ET LEURS PROCÉDÉS D'UTILISATION

  摘要：

  本公开涉及非对称N-杂环卡宾（NHC）配体和10或11族金属的新型配合物。本公开还涉及使用此处所描述的NHC催化剂进行炔烃和/或腈的亲电官能团化的方法。

  公开号：

  WO2022187205A1

文献信息

• The Nonribosomal Peptide Synthetase Enzyme DdaD Tethers <i>N</i>_β-Fumaramoyl-<scp>l</scp>-2,3-diaminopropionate for Fe(II)/α-Ketoglutarate-Dependent Epoxidation by DdaC during Dapdiamide Antibiotic Biosynthesis
  作者：Marie A. Hollenhorst、Stefanie B. Bumpus、Megan L. Matthews、J. Martin Bollinger、Neil L. Kelleher、Christopher T. Walsh

  DOI：10.1021/ja1072367

  日期：2010.11.10

  The gene cluster from Pantoea agglomerans responsible for biosynthesis of the dapdiamide antibiotics encodes an adenylation-thiolation didomain protein, DdaD, and an Fe(II)/α-ketoglutarate-dependent dioxygenase homologue, DdaC. Here we show that DdaD, a nonribosomal peptide synthetase module, activates and sequesters N(β)-fumaramoyl-l-2,3-diaminopropionate as a covalently tethered thioester for subsequent

  来自成团泛菌的基因簇负责 DAPdiamide 抗生素的生物合成，编码腺苷酸化-硫醇化双结构域蛋白 DdaD 和 Fe(II)/α-酮戊二酸依赖性双加氧酶同源物 DdaC。在这里，我们展示了 DdaD，一种非核糖体肽合成酶模块，激活和隔离 N(β)-延胡索酰基-1-2,3-二氨基丙酸酯作为共价连接的硫酯，用于随后对延胡索酰基进行氧化修饰。DdaC 催化共价结合的 N(β)-富马甲酰基-1-2,3-二氨基丙酰基-S-DdaD 物质的 Fe(II)-和 α-酮戊二酸依赖性环氧化，生成 N(β)-环氧琥珀酰胺-DAP (DAP = 2,3-二氨基丙酸酯）与 DdaD 的硫酯连接。水解释放后，
• Panoramic view of a superfamily of phosphatases through substrate profiling
  作者：Hua Huang、Chetanya Pandya、Chunliang Liu、Nawar F. Al-Obaidi、Min Wang、Li Zheng、Sarah Toews Keating、Miyuki Aono、James D. Love、Brandon Evans、Ronald D. Seidel、Brandan S. Hillerich、Scott J. Garforth、Steven C. Almo、Patrick S. Mariano、Debra Dunaway-Mariano、Karen N. Allen、Jeremiah D. Farelli

  DOI：10.1073/pnas.1423570112

  日期：2015.4.21

  Here, we examine the activity profile of the haloalkanoic acid dehalogenase (HAD) superfamily by screening a customized library against >200 enzymes from a broad sampling of the superfamily. From this dataset, we can infer the function of nearly 35% of the superfamily. Overall, the superfamily was found to show high substrate ambiguity, with 75% of the superfamily utilizing greater than five substrates. In addition, the HAD members with the least amount of structural accessorization of the Rossmann fold were found to be the most specific, suggesting that elaboration of the core domain may have led to increased substrate range of the superfamily.

  这里，我们通过对一个定制库进行筛选，对来自广泛的HAD超家族样本中的200多种酶进行活性分析。从这组数据中，我们可以推断出几乎35%的超家族的功能。总体而言，发现超家族具有高度的底物模糊性，有75%的超家族利用了超过五种底物。此外，发现Rossmann折叠结构附件最少的HAD成员最为特定，这表明核心域的扩展可能导致了超家族底物范围的增加。
• Crystal structure of PhnZ in complex with substrate reveals a di-iron oxygenase mechanism for catabolism of organophosphonates
  作者：Laura M. van Staalduinen、Fern R. McSorley、Katharina Schiessl、Jacqueline Séguin、Peter B. Wyatt、Friedrich Hammerschmidt、David L. Zechel、Zongchao Jia

  DOI：10.1073/pnas.1320039111

  日期：2014.4.8

  coordinated by four histidines and two aspartates that is strikingly similar to the carbon-carbon bond cleaving enzyme, myo-inositol-oxygenase. The exception is Y24, which forms a transient ligand interaction at the dioxygen binding site of Fe2. Site-directed mutagenesis and kinetic analysis with substrate analogs revealed the roles of key active site residues. A fifth histidine that is conserved in the PhnZ

  PhnY 和 PhnZ 酶包含氧化分解代谢途径，使海洋细菌能够使用 2-氨基乙基膦酸作为无机磷酸盐的来源。PhnZ 以使用 Fe(II) 和双氧催化碳-磷键的氧化裂解而著称，尽管它属于水解酶的一个大家族，即 HD-磷酸水解酶超家族。我们已经确定了与其底物 (R)-2-amino-1-hydroxyethylphosphonate (2.1 A) 和缓冲添加剂 l-酒石酸盐 (1.7 A) 结合的 PhnZ 的高分辨率结构。这些结构表明 PhnZ 具有一个活性位点，其中包含由四个组氨酸和两个天冬氨酸配位的两个 Fe 离子，与碳-碳键裂解酶肌肉肌醇加氧酶极为相似。Y24 是个例外，它在 Fe2 的双氧结合位点形成瞬时配体相互作用。用底物类似物进行定点诱变和动力学分析揭示了关键活性位点残基的作用。第五个组氨酸在 PhnZ 亚分支中保守，H62，专门与底物 1-羟基相互作用。这些结构还表明，Y24
• A Previously Unrecognized Kanosamine Biosynthesis Pathway in <i>Bacillus subtilis</i>
  作者：Natasha D. Vetter、David M. Langill、Shazia Anjum、Julie Boisvert-Martel、Rajendra C. Jagdhane、Egiroh Omene、Hongyan Zheng、Karin E. van Straaten、Isaac Asiamah、Ed S. Krol、David A. R. Sanders、David R. J. Palmer

  DOI：10.1021/ja4010255

  日期：2013.4.24

  NtdC, constitute a complete set of enzymes required for NTD synthesis, although their functions have never been demonstrated in vitro. We now report that these enzymes catalyze the biosynthesis of kanosamine from glucose-6-phosphate: NtdC is a glucose-6-phosphate 3-dehydrogenase, NtdA is a pyridoxal phosphate-dependent 3-oxo-glucose-6-phosphate:glutamate aminotransferase, and NtdB is a kanosamine-6-phosphate

  枯草芽孢杆菌中的 NTd 操纵子对于 3,3'-新海藻二胺 (NTD) 的生物合成至关重要，NTD 是一种不寻常的非还原性二糖，据报道具有抗生素特性。有人提出该操纵子内编码的三种酶 NTdA、NTdB 和 NTdC 构成了 NTD 合成所需的完整酶组，尽管它们的功能从未在体外得到证实。我们现在报告这些酶催化 6-磷酸葡萄糖生物合成卡诺胺：NTdC 是一种葡萄糖 6-磷酸 3-脱氢酶，NTdA 是一种磷酸吡哆醛依赖性 3-氧代-葡萄糖-6-磷酸：谷氨酸氨基转移酶， NTdB 是一种 kanosamine-6-磷酸磷酸酶。这些酶促反应以前都没有报道过。
• Establishment of an <i>In Vitro</i> <scp>d</scp> -Cycloserine-Synthesizing System by Using <i>O</i> -Ureido- <scp>l</scp> -Serine Synthase and <scp>d</scp> -Cycloserine Synthetase Found in the Biosynthetic Pathway
  作者：Narutoshi Uda、Yasuyuki Matoba、Takanori Kumagai、Kosuke Oda、Masafumi Noda、Masanori Sugiyama

  DOI：10.1128/aac.02291-12

  日期：2013.6

  We have recently cloned a DNA fragment containing a gene cluster that is responsible for the biosynthesis of an antituberculosis antibiotic, d -cycloserine. The gene cluster is composed of 10 open reading frames, designated dcsA to dcsJ . Judging from the sequence similarity between each putative gene product and known proteins, DcsC, which displays high homology to diaminopimelate epimerase, may catalyze the racemization of O -ureidoserine. DcsD is similar to O -acetylserine sulfhydrylase, which generates l -cysteine using O -acetyl- l -serine with sulfide, and therefore, DcsD may be a synthase to generate O -ureido- l -serine using O -acetyl- l -serine and hydroxyurea. DcsG, which exhibits similarity to a family of enzymes with an ATP-grasp fold, may be an ATP-dependent synthetase converting O -ureido- d -serine into d -cycloserine. In the present study, to characterize the enzymatic functions of DcsC, DcsD, and DcsG, each protein was overexpressed in Escherichia coli and purified to near homogeneity. The biochemical function of each of the reactions catalyzed by these three proteins was verified by thin-layer chromatography (TLC), high-performance liquid chromatography (HPLC), and, in some cases, mass spectrometry. The results from this study demonstrate that by using a mixture of the three purified enzymes and the two commercially available substrates O -acetyl- l -serine and hydroxyurea, synthesis of d -cycloserine was successfully attained. These in vitro studies yield the conclusion that DcsD and DcsG are necessary for the syntheses of O -ureido- l -serine and d -cycloserine, respectively. DcsD was also able to catalyze the synthesis of l -cysteine when sulfide was added instead of hydroxyurea. Furthermore, the present study shows that DcsG can also form other cyclic d -amino acid analogs, such as d -homocysteine thiolactone.

  摘要 我们最近克隆了一个 DNA 片段，其中含有一个负责抗结核抗生素生物合成的基因簇、 d -环丝氨酸。该基因簇由 10 个开放阅读框组成，分别为 dcsA 到 dcsJ .从每个推定基因产物与已知蛋白质之间的序列相似性来看，DcsC 与二氨基亚硒酸酯外延酶同源性很高，可能会催化 Omega 的外消旋化。 O -尿苷酸的外消旋化。DcsD 与 O -乙酰丝氨酸巯基酶相似，后者可生成 l -半胱氨酸。 O -乙酰- l 因此，DcsD 可能是生成 O-乙酰基-l-半胱氨酸的合成酶。 O -脲 l -丝氨酸的合成酶。 O -乙酰-l-丝氨酸 l -丝氨酸和羟基脲。DcsG 与具有 ATP-抓取折叠的酶家族相似，可能是一种 ATP 依赖性合成酶，能将 O-乙酰基-丝氨酸转化为丝氨酸。 O -脲 d -丝氨酸转化为 d -环丝氨酸。在本研究中，为了鉴定 DcsC、DcsD 和 DcsG 的酶功能，将每种蛋白在 大肠杆菌 并纯化至接近均一。通过薄层色谱法（TLC）、高效液相色谱法（HPLC）和质谱法（在某些情况下）验证了这三种蛋白质催化的每个反应的生化功能。这项研究的结果表明，通过使用三种纯化酶和两种市售底物的混合物 O -乙酰- l -丝氨酸和羟基脲，可合成 d -环丝氨酸的合成。这些 体外 这些体外研究得出的结论是，DcsD 和 DcsG 是合成 O-环丝氨酸的必要条件。 O -脲 l -丝氨酸和 d -环丝氨酸。DcsD 还能催化 l -丝氨酸和 d -环丝氨酸的合成。 l 当加入硫化物而不是羟基脲时，DcsD 也能催化合成 l -半胱氨酸。此外，本研究还表明，DcsG 还能形成其他环 d -氨基酸类似物，如 d -高半胱氨酸硫内酯。