F<scp>ragtory</scp>: Pharmacophore-Focused Design, Synthesis, and Evaluation of an sp<sup>3</sup>-Enriched Fragment Library
作者:Mike Bührmann、Shivakrishna Kallepu、Jonas D. Warmuth、Jan N. Wiese、Christiane Ehrt、Helge Vatheuer、Wolf Hiller、Carina Seitz、Laura Levy、Paul Czodrowski、Sonja Sievers、Matthias P. Müller、Daniel Rauh
DOI:10.1021/acs.jmedchem.3c00187
日期:2023.5.11
structures in commercial libraries often hamper the full potential of this approach. Hence, the thorough design of screening libraries inevitably determines the probability for meaningful hits and subsequent structural elaboration. Against this background, we present the generation of an exclusive fragment library based on iterative entry nomination by a specifically designed computational workflow:
基于片段的药物发现在药物化学和药物研究中发挥了重要作用。尽管取得了许多成功,但商业文库中平面、sp 2丰富的结构的有限多样性和过度代表性往往阻碍了这种方法的全部潜力。因此,筛选文库的彻底设计不可避免地决定了有意义的命中和随后的结构阐述的概率。在此背景下,我们通过专门设计的计算工作流程“ Fragtory ”,提出了基于迭代条目提名的独家片段库的生成。遵循药效团多样性驱动的方法,我们使用了Fragtory在跨学科的学术环境中,指导定制合成工作和内部化合物的实施,以建立一个由 288 名成员组成的精选 sp 3片段库。随后针对模型蛋白质的核磁共振筛选和蛋白质晶体学的命中验证导致了结构新颖的配体的鉴定,这些配体通过等温滴定量热法进一步表征,证明了我们的实验方法的适用性。