uridylyl(3',5'-)uridine ammonium salt | 21052-35-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - （3'->5'）-二核苷酸和类似物
• 英文名称: uridylyl(3',5'-)uridine ammonium salt
• 英文别名: UpU；Uridine, uridylyl-(3'.5')-, ammonium salt；azanium;[(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl [(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-4-hydroxy-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] phosphate
• CAS: 21052-35-7
• 化学式: C₁₈H₂₃N₄O₁₄P*H₃N
• 分子量: 567.403
• InChiKey: VPXDHZMLJOJKOX-ZNFCZCJPSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4.06
• 重原子数：
  38
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.555
• 拓扑面积：
  255
• 氢给体数：
  8
• 氢受体数：
  15

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  uridylyl(3',5'-)uridine ammonium salt 在 C₃₆H₆₄Eu₂N₁₄O₆⁽⁶⁺⁾ 作用下， 生成 uridine 2',3'-cyclic phosphate 、 尿苷酸 、 [(2R,3R,4R,5R)-2-(2,4-二氧代嘧啶-1-基)-4-羟基-5-(羟基甲基)四氢呋喃-3-基]磷酸二氢酯 、 尿嘧啶核苷
  参考文献：
  名称：

  用于切割 RNA 的系留双核铕 (III) 大环催化剂

  摘要：

  所有复合物都促进 RNA 类似物 2-羟丙基-4-硝基苯基磷酸酯 (HpPNP) 在 25 摄氏度（I = 0.10 M (NaNO3)，20 mM 缓冲液）的裂解。催化剂裂解 HpPNP 的二级速率常数在 7-9 的 pH 范围内随 pH 值线性增加。在 pH 7 下双核 Eu(III) 复合物 (Eu2(1)) 对 HpPNP 裂解的二级速率常数分别比 Eu(5) 和 Eu(3) 高 200 和 23 倍，但仅比带有芳基侧基 Eu(4) 的单核复合物高 7 倍。这表明大环取代基调节了 Eu(III) 催化剂的效率。Eu2(1) 促进双核苷、尿苷基-3',5'-尿苷 (UpU) 的裂解，在 pH 7.6 (0.021 M(-1) s(-1)) 下具有 46 倍的二级速率常数高于单核 Eu(5) 复合物。与 Eu(III) 配合物结合的磷酸甲酯在能量上最有利于最好的催化剂，这支持催化剂在稳

  DOI：

  10.1021/ja8037799