(E)-5-(3-(2-(N-Methyl-N-(2-(2,2,2-trifluoroacetamido)ethyl)amino)ethylamino)-3-oxoprop-1-enyl)-2'-deoxyuridine | 1056651-29-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: (E)-5-(3-(2-(N-Methyl-N-(2-(2,2,2-trifluoroacetamido)ethyl)amino)ethylamino)-3-oxoprop-1-enyl)-2'-deoxyuridine
• 英文别名: (E)-3-[1-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-2,4-dioxopyrimidin-5-yl]-N-[2-[methyl-[2-[(2,2,2-trifluoroacetyl)amino]ethyl]amino]ethyl]prop-2-enamide
• CAS: 1056651-29-6
• 化学式: C₁₉H₂₆F₃N₅O₇
• 分子量: 493.44
• InChiKey: GZPRXCNSCFZREN-GBVFBGGSSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.4
• 重原子数：
  34
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.58
• 拓扑面积：
  161
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (E)-5-(3-(2-(N-Methyl-N-(2-(2,2,2-trifluoroacetamido)ethyl)amino)ethylamino)-3-oxoprop-1-enyl)-2'-deoxyuridine 、 4,4'-双甲氧基三苯甲基氯 在 吡啶 作用下， 反应 2.0h， 以77%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  COMPOUND HAVING STRUCTURE DERIVED FROM MONONUCLEOSIDE OR MONONUCLEOTIDE, NUCLEIC ACID, LABELING SUBSTANCE, AND METHOD AND KIT FOR DETECTION OF NUCLEIC ACID

  摘要：

  公开号：

  EP2130835B1
• 作为产物：
  描述：

  三氟乙酸乙酯 、 在 三乙胺 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 16.0h， 生成 (E)-5-(3-(2-(N-Methyl-N-(2-(2,2,2-trifluoroacetamido)ethyl)amino)ethylamino)-3-oxoprop-1-enyl)-2'-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  COMPOUND HAVING STRUCTURE DERIVED FROM MONONUCLEOSIDE OR MONONUCLEOTIDE, NUCLEIC ACID, LABELING SUBSTANCE, AND METHOD AND KIT FOR DETECTION OF NUCLEIC ACID

  摘要：

  公开号：

  EP2130835B1

文献信息

• Primer, primer set, and nucleic acid amplification method and mutation detection method using the same
  申请人：Hayashizaki Yoshihide

  公开号：US20080227104A1

  公开（公告）日：2008-09-18

  The present invention provides a primer that effectively can detect, for example, the double helix structure of a nucleic acid. The primer is a labeled nucleic acid containing at least one structure represented by the following formula (16), where B is an atomic group having a nucleobase skeleton, E is an atomic group having a deoxyribose skeleton, a ribose skeleton, or a structure derived from either one of them, or an atomic group having a peptide structure or a peptoid structure, and Z 11 and Z 12 are each an atomic group that exhibits fluorescence and are identical to or different from each other.

  本发明提供了一种引物，可以有效地检测核酸的双螺旋结构，例如。该引物是一种带标记的核酸，其中至少包含下式（16）所表示的一个结构，其中B是具有核苷酸骨架的原子团，E是具有脱氧核糖骨架，核糖骨架或从它们中的任何一个派生的结构，或具有肽结构或肽酰结构的原子团，而Z11和Z12是各自表现出荧光的原子团，它们相同或不同。
• US8067162B2
  申请人：——

  公开号：US8067162B2

  公开（公告）日：2011-11-29
• US8383792B2
  申请人：——

  公开号：US8383792B2

  公开（公告）日：2013-02-26
• COMPOUND HAVING STRUCTURE DERIVED FROM MONONUCLEOSIDE OR MONONUCLEOTIDE, NUCLEIC ACID, LABELING SUBSTANCE, AND METHOD AND KIT FOR DETECTION OF NUCLEIC ACID
  申请人：Riken

  公开号：EP2130835B1

  公开（公告）日：2012-05-23