Discovery of Small Molecules Targeting the Frameshifting Element RNA in SARS-CoV-2 Viral Genome
作者:Mo Yang、Feyisola P. Olatunji、Curran Rhodes、Sumirtha Balaratnam、Kara Dunne-Dombrink、Srinath Seshadri、Xiao Liang、Christopher P. Jones、Stuart F. J. Le Grice、Adrian R. Ferré-D’Amaré、John S. Schneekloth
DOI:10.1021/acsmedchemlett.3c00051
日期:2023.6.8
orthogonal biophysical assays and structure–activity relationship (SAR) studies. This work reveals compounds with mid-micromolar binding affinity (KD = 60 ± 6 μM) to the FSE RNA and supports a binding mode distinct from previously reported FSE binders MTDB and merafloxacin. In addition, compounds are active in in vitro dual-luciferase and in-cell dual-fluorescent-reporter frameshifting assays, highlighting
用小分子靶向 SARS-CoV-2 病毒基因组中的结构化 RNA 元件是对病毒复制进行药理学控制的一种有吸引力的策略。在这项工作中,我们报告了利用高通量小分子微阵列(SMM)筛选发现了针对 SARS-CoV-2 RNA 基因组中移码元件(FSE)的小分子。使用多种正交生物物理测定和构效关系 (SAR) 研究合成并表征了 SARS-CoV-2 FSE 的一类新型氨基喹唑啉配体。这项工作揭示了与 FSE RNA 具有中微摩尔结合亲和力 ( K D = 60 ± 6 μM) 的化合物,并支持与之前报道的 FSE 结合剂 MTDB 和美拉沙星不同的结合模式。此外,这些化合物在体外双荧光素酶和细胞内双荧光报告基因移码测定中具有活性,凸显了用药物样化合物靶向RNA结构元件以改变病毒蛋白表达的前景。